乳腺癌ceRNA生物信息学分析与SSP411基因功能验证

论文摘要

目的:随着对乳腺癌发病机制的进一步了解,有许多与乳腺癌相关的信号通路和治疗靶点被发现。本研究通过使用生物信息学分析以及实验验证发现竞争性内源RNA（ceRNA）网络与SSP411基因对于乳腺癌的发生和发展有影响。方法:1.从肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库下载芯片数据,在R软件上分析得到差异的长链非编码RNA（lncRNA）,构建ceRNA网络并进行GO和KEGG的富集分析。通过考虑每个与预后相关的lncRNA的功效,在多变量Cox回归分析中拟合与预后相关lncRNA,构建风险评分模型。2.构建SSP411敲除载体,通过细胞转染将构建好的载体转入乳腺癌细胞SKBR3中,筛选获得SSP411敲除的稳定表达细胞株SKBR3-SSP411-/-,通过Real-time PCR及Western Blot等实验手段,根据基因表达结果、蛋白表达结果及细胞验证的实验结果来探究SSP411对于乳腺癌细胞SKBR3的影响。结果:1.本研究结果显示,有5个lncRNA与乳腺癌的预后相关。这五个lncRNA不仅在ceRNA网络中处于关键节点,而且与乳腺癌患者的总体预后生存也相关。2.成功构建SSP411敲除的SKBR3细胞株,并通过Real-time PCR及Western Blot方法验证。细胞实验结果表明,敲除SSP411基因后,细胞增殖能力降低,细胞迁移能力下降,细胞周期发生阻滞。结论:1.发现5个lncRNA可能具有成为乳腺癌的预后标志物的潜力。2.乳腺癌细胞SKBR3敲除SSP411基因后,细胞增殖能力降低,细胞迁移能力下降,细胞周期发生阻滞。这说明5个lncRNA和SSP411有潜力作为乳腺癌的治疗靶点。

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文章来源

类型: 硕士论文

作者: 王克

导师: 金荣仲

关键词: 乳腺癌,靶向标记物,生物信息学,竞争性内源

来源: 桂林医学院

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学,肿瘤学

单位: 桂林医学院

分类号: Q811.4;R737.9

总页数: 73

文件大小: 5651K

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