高通量测序数据识别拼接错误方法

高通量测序数据识别拼接错误方法

论文摘要

本文基于思想对识别错误序列拼接的算法进行优化,增加了运算速率,降低了CPU内存消耗,提高了识别序列错误拼接的效率。基因组序列拼接是指待检测基因组序列的物种,使用Sanger等技术手段参照各测序片段之间的contigs重新生成reads片段并组建待测物种的基因组序列的一种方法,本文采用多种方法识别错误拼接并比较其优缺点。

论文目录

  • 1 引言
  • 2 高通量测序数据识别错误拼接的方法
  •   2.1 将PE数据比对到拼接后的基因组序列
  •   2.2 识别contigs内部的错误拼接
  • 3 多种方法识别错误拼接的实验分析与比较
  • 4 总结与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 范佳雯

    关键词: 基因组拼接,高通量测序,错误拼接,识别

    来源: 电子技术与软件工程 2019年23期

    年度: 2019

    分类: 信息科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 哈尔滨师范大学

    分类号: Q78

    页码: 146-147

    总页数: 2

    文件大小: 1519K

    下载量: 51

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