一个源于皮革肾岛衣地衣型真菌中的HR-PKS基因克隆与鉴定

一个源于皮革肾岛衣地衣型真菌中的HR-PKS基因克隆与鉴定

论文摘要

本研究通过对皮革肾岛衣(Nephrmopsis pallescens)地衣型真菌转录组数据的分析,首次克隆得到一种高度还原型聚酮合酶(Highly reducing PKS)基因全长,并对该基因进行生物信息学分析,并检测该基因在不同培养基上的表达量。该基因cDNA全长7 491 bp (命名为NpPKS1),可编码2 496个氨基酸,是一种稳定存在于细胞质基质中的非分泌蛋白;结构域与其他真菌的洛伐他汀九酮合成酶(LNKS)结构域极为相似,且聚类分析与其他真菌的洛伐他汀九酮合成酶(LNKS)聚为一类;在以葡萄糖和麦芽糖作为碳源的情况下,番茄浸粉、牛肉浸粉、酪蛋白胨等作为氮源可强烈刺激NpPKS1基因的表达,而胰蛋白胨对该基因的表达存在一定程度的抑制效应。本研究为皮革肾岛衣地衣型真菌中的基因资源利用、聚酮化合物异源表达和其合成机制的研究奠定了基础。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 NpPKS1基因全长cDNA的获取
  •   1.2 NpPKS1基因及其氨基酸残基序列的生物信息学分析
  •   1.3 NpPKS1基因在不同培养基上的荧光定量表达
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •   3.2 方法
  •     3.2.1 NpPKS1基因全长cDNA的克隆
  •     3.2.2 NpPKS1基因生物信息学分析
  •     3.2.3 NpPKS1基因在不同培养基上的荧光定量表达
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 原晓龙,陈剑,华梅,王娟,王毅

    关键词: 皮革肾岛衣,聚酮合成酶,生物信息学,基因表达

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学

    单位: 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31860177),云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055),云南省对外科技合作计划项目(2015IA004)共同资助

    分类号: Q78

    DOI: 10.13417/j.gab.038.001608

    页码: 1608-1614

    总页数: 7

    文件大小: 446K

    下载量: 76

    相关论文文献

    • [1].根癌农杆菌介导的地衣型真菌Cladonia metacorallifera的转化[J]. 菌物学报 2015(02)
    • [2].地衣型真菌的Ⅰ型内含子及其在系统发育中的应用[J]. 菌物学报 2011(06)
    • [3].中国叶生地衣型真菌2新种和1新记录种[J]. 菌物研究 2020(03)
    • [4].地衣型真菌皮革肾岛衣中1个Ⅲ型聚酮合酶基因的克隆与鉴定[J]. 西北植物学报 2017(11)
    • [5].中国绒衣属地衣的初步研究(英文)[J]. 热带亚热带植物学报 2018(04)
    • [6].地衣生物学专刊序言[J]. 菌物学报 2018(07)
    • [7].中国横断山地区蓝藻型肺衣属地衣的三个新种(英文)[J]. 菌物学报 2018(07)
    • [8].中国柱衣属小志(英文)[J]. 菌物学报 2011(06)
    • [9].地衣生态功能研究进展[J]. 生态学杂志 2020(09)
    • [10].中国裂隙衣属地衣(文字衣科)的初步研究(英文)[J]. 菌物学报 2018(07)
    • [11].一个含有CMeT新型NR-PKS基因的克隆与鉴定[J]. 分子植物育种 2019(20)
    • [12].中国地衣新记录属——裂孔衣属(英文)[J]. 广西植物 2020(02)
    • [13].中国地衣新记录属——裂衣属(英文)[J]. 热带亚热带植物学报 2016(05)
    • [14].岩生树花地衣型真菌NRPS基因的生物信息学分析[J]. 西部林业科学 2018(02)
    • [15].中国点衣属(文字衣科)地衣的研究(英文)[J]. 菌物学报 2016(05)
    • [16].中国地图衣3个新记录种(英文)[J]. 西北植物学报 2015(08)
    • [17].地衣型真菌次级代谢产物抗菌活性初步研究[J]. 广西植物 2017(02)
    • [18].污核衣科地衣分类学研究进展[J]. 聊城大学学报(自然科学版) 2019(04)
    • [19].中国宁夏六盘山的地卷目地衣(英文)[J]. 菌物研究 2010(04)
    • [20].中国地衣1新记录属——珐氏衣属及其新记录种(英文)[J]. 西北植物学报 2016(08)
    • [21].中国文字衣属新种和新记录种(英文)[J]. 菌物学报 2014(05)
    • [22].全球最大的“地衣蘑菇”被发现[J]. 植物分类与资源学报 2013(01)
    • [23].中国大陆饼干衣属地衣小志[J]. 聊城大学学报(自然科学版) 2020(04)
    • [24].皮革肾岛衣一个聚酮合酶基因的克隆与鉴定[J]. 福建农林大学学报(自然科学版) 2019(01)
    • [25].石果衣菌藻次级代谢产物的初步研究[J]. 菌物学报 2018(02)
    • [26].典型的共生生物——地衣[J]. 大自然 2011(01)
    • [27].猫耳衣属的2个亚洲新记录种(英文)[J]. 菌物研究 2014(02)
    • [28].海南地衣多样性考察及其资源研发前景[J]. 菌物研究 2013(04)
    • [29].中国大陆多毛类猫耳衣属一新记录种(英文)[J]. 菌物研究 2012(04)
    • [30].石耳属ITS条形码物种的快速鉴定[J]. 菌物学报 2011(06)

    标签:;  ;  ;  ;  

    一个源于皮革肾岛衣地衣型真菌中的HR-PKS基因克隆与鉴定
    下载Doc文档

    猜你喜欢