群体遗传多样性论文_邢泽农,辛鑫,刘亚忠,李秋孝,张嘉园

导读:本文包含了群体遗传多样性论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:多样性,种质,群体,叶绿体,标记,线粒体,陕西省。

群体遗传多样性论文文献综述

邢泽农,辛鑫,刘亚忠,李秋孝,张嘉园[1](2019)在《陕棉抗病种质及其衍生品种遗传多样性与群体结构的研究》一文中研究指出通过72个分布于棉花全基因组的SSR标记,对54份陕棉抗病种质及其衍生品种遗传多样性与群体结构进行了分析。结果表明,陕棉血统的54份种质间遗传相似系数在0.7333~0.9872之间。其中,材料间相似系数≤0.90的占11.1%,相似系数≥0.95的占55.6%,相似系数在0.90~0.95的占33.3%。72个SSR标记等位基因变异的多态性信息含量(PIC值)在0.04~0.68,平均为0.33。基于遗传距离的UPGMA聚类分析显示,在遗传相似系数为0.877时将54个品种分为5类,第Ⅰ类44个品种,第Ⅲ类7个品种,第Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ类各1个品种。基于数学模型的聚类和群体结构分析显示,54份种质归属于4个组群。总的来看,54份材料间遗传相似系数较大,遗传基础比较狭窄,多样性很低。(本文来源于《科技创新与扶贫攻坚——陕西省农作物学会第二届会员代表大会暨2019年学术年会摘要集》期刊2019-12-13)

刘洁,高风英,卢迈新,陈刚,曹建萌[2](2019)在《我国7个泥鳅群体遗传多样性的微卫星分析》一文中研究指出环境污染和人类活动使我国泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)资源量锐减,种质资源不断退化。为探索我国泥鳅不同地理群体的遗传多样性及种群遗传结构,本研究采用10个微卫星标记对鄱阳湖地区及珠江流域共7个泥鳅群体(鄱阳湖,英德,清远,连南,南雄,梅州,柳州)进行了遗传多样性分析。结果表明,各基因座的平均等位基因数(number of allele, Na)和有效等位基因数(effective number of allele, Ne)分别为7和2.5个,平均观测杂合度(observed heterozygosity, Ho)和期望杂合度(expected heterozygosity, He)分别为0.327 4和0.396 0。7个泥鳅群体间的近交系数(population inbreeding coefficient, Fis)、遗传分化系数(genetic differentiation coefficient, Fst)和基因流(number of migrants per generation, Nm)分别为0.093 0、0.372 0和0.422 1,表明7个群体间遗传交流水平低,存在较高程度的遗传分化。10对微卫星引物在7个群体中共扩增出79个等位基因,群体的Na为3.0~7.5个,Ne为1.7~5.5个,Ho为0.307 4~0.534 7,He为0.329 0~0.861 5,多态信息含量(polymorphism information content, PIC)为0.316 8~0.529 4。7个泥鳅群体间的遗传距离为0.045 3~1.602 3,柳州与南雄群体遗传距离最小(0.0453),亲缘关系较近;清远与梅州群体遗传距离最大(1.6023),亲缘关系相对较远。基于遗传距离的聚类结果显示,柳州、南雄、连南和梅州群体聚为一个分支,而清远、英德和鄱阳湖群体聚为另一个分支。上述研究结果表明,目前我国泥鳅群体的遗传多样性处于中等水平,泥鳅群体间的遗传分化受自身迁移能力和地理隔离等因素的影响。本研究可为泥鳅良种基础群体的进一步选择及泥鳅种质资源的保护提供理论依据。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年12期)

王永辰,姜巨峰,刘肖莲,宋立民,吴会民[3](2019)在《天津地区日本沼虾群体遗传多样性的微卫星分析》一文中研究指出为了评估天津地区日本沼虾(Macrobrachium nipponense)野生种质资源遗传背景,采用9对微卫星分子标记(Mn33、Mn37、Mni04、Mni01、Mni06、Mni76、Mni13、Mni40、Mni58)对日本沼虾4个野生群体(YDXH、DLJH、XQLH和YQSK)进行了遗传多样性研究。结果表明,9对微卫星引物在日本沼虾4个群体中的等位基因数(Na)为3~12,有效等位基因数(Ne)为1.976 9~10.816 5,观测杂合度(Ho)为0.285 7~0.975 0,期望杂合度(He)为0.494 2~0.896 7,多态信息含量(PIC)为0.474 9~0.888 0,说明日本沼虾群体的遗传多样性水平较高;分子方差分析(AMOVA)显示,群体中仅有2.04%(P<0.01)的遗传变异来源于群体间,97.96%(P<0.01)的变异来源于群体内,表明遗传差变异主要存在于个体间;群体间遗传分化指数(Fst)为0.010 4~0.037 7,说明群体间的遗传分化程度并不明显;基于群体间Nei’s遗传距离采用UPGMA法对4个群体进行聚类树构建,永定新河(YDXH)与独流减河(DLJH)首先聚为一支,其次与西七里海(XQLH)聚为一支,最后与于桥水库(YQSK)聚为一支。(本文来源于《天津农业科学》期刊2019年12期)

陈越,陈玲,张敦宇,肖素勤,殷富有[4](2019)在《云南水稻种质资源的遗传多样性及群体结构分析》一文中研究指出利用SSR分子标记对覆盖云南16个州(市)的908份水稻种质资源进行遗传多样性及群体结构分析。结果表明,22对SSR标记共检测到193个等位基因,每对标记的等位基因数为4~18,平均8.78;主要等位基因的频率为0.204 8~0.794 1,平均0.380 3;基因多样性指数为0.347 7~0.887 6,平均0.730 7;多态信息含量为0.320 2~0.877 7,平均0.698 6。以地理来源进行分类并分析其遗传多样性,结果表明,云南水稻种质资源在不同州(市)间的遗传差异较大,其中普洱市水稻种质资源的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性及Shannon’s指数最高,而迪庆州和楚雄州相对较低,说明普洱市水稻种质资源的遗传多样性最丰富,而迪庆州和楚雄州相对较低;遗传距离和遗传一致度分析表明,普洱市与西双版纳州水稻种质资源的遗传距离最小、遗传一致度较高,亲缘关系最近,而昆明市与楚雄州水稻种质资源的遗传距离最大、遗传一致度较低,亲缘关系最远。遗传分化分析显示,908份水稻种质资源的遗传变异主要来源于种质内个体间,且种质间的基因流为2.838 8,该值大于1,说明云南水稻种质资源间存在频繁的基因交流现象;NJ聚类分析、PCA主成分分析及Sturcture群体遗传结构分析均将供试材料分为2大类群,其中NJ聚类分析和PCA分析又在2大类群的基础上分为4个亚群,908份云南水稻种质资源并没有按照地理来源进行聚类,交错分布于各个类群中。表明云南水稻种质资源具有极其丰富的遗传多样性,且不同州(市)水稻种质资源的遗传差异较大,将为今后水稻新品种选育提供宝贵的资源材料。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年11期)

朱弘,蔡厚才,李涌福,陈万东,陈林[5](2019)在《中国东部沿海水仙归化群体的遗传多样性》一文中研究指出为揭示我国东部归化水仙(Narcissus tazetta var. chinensis)的群体遗传多样性,利用2个叶绿体基因mat K和trn H-psb A片段对采自沪、浙、闽的5个代表群体的49株水仙进行了评估。结果表明,双基因联合序列的总长为1443bp,共定义6个单倍型,各归化群体的遗传多样性水平为DLSY>PTD>NJD=ZZ>CMD。AMOVA分析表明,群体内变异为遗传变异的主要来源(91.98%),群体间的遗传分化较低(Fst=0.080 22)。群体物种水平上的谱系结构不显着(Nst=0.020<Gst=0.031;P<0.05)。Mantel检验表明水仙群体间的遗传距离与地理距离呈显着的线性相关(r=0.929,P=0.02 <0.05)。中性检验和错配分布分析结果均暗示水仙群体背离了快速扩张模型的假设。单倍型分布的中介网络图结合系统发育NJ树均将所有群体划分为2大分支。因此,我国东部沿海水仙归化群体整体遗传多样性水平较低,各群体间遗传分化较弱,遗传变异主要来自群体内,物种近期未经历扩张事件,可能是基因流受海岛隔离、自身生物学特征、生境异质性与及人为干扰的综合作用影响。(本文来源于《热带亚热带植物学报》期刊2019年06期)

潘贤辉,周康奇,陈忠,杜雪松,黄姻[6](2019)在《基于线粒体D-loop区和COI基因序列研究2个禾花鲤群体和野生鲤群体的遗传多样性与系统进化关系》一文中研究指出利用线粒体D-loop区和COI基因序列分析了全州禾花鲤(Quanzhou Procypris merus)、融水禾花鲤(Rongshui P.merus)和野生鲤鱼群体的遗传多样性和系统进化关系。基于D-loop区序列分析结果表明:序列长度为927~930 bp,共统计变异位点53个;A、T、G、C核苷酸平均含量分别为33.4%、32.9%、14%和19.7%,A+T(66.3%)明显高于G+C(33.7%);总体的单倍型数(h)、单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为40个、0.95和0.008 3;遗传分化指数(Fst)为0.224 59。基于COI基因序列分析结果显示:序列长度为897~899 bp,共统计变异位点33个;A、T、G、C核苷酸平均含量分别为26.7%、28.5%、17.8%和27%,且A+T(55.2%)高于G+C(44.8%);总体的h为25个,Hd为0.91,π为0.003 16;Fst值为0.191 43。在3个群体内和群体间遗传距离分别在0.003~0.009和0.003~0.01,远小于种群分类水平0.05。分子方差分析(AMOVA)结果表明,77.54%(D-loop)和80.86%(COI)变异来自群体间变异,22.46%(D-loop)和19.14%(COI)来自群体内变异。单倍型进化树和网络图显示,全州禾花鲤和野鲤群体均存在单独聚为一支的单倍型,而融水群体未出现单独成支现象。研究表明,线粒体D-loop区作为反映3个群体间遗传多样性的灵敏度要高于COI基因,并且3个群体均属于高单倍型多样性和高核苷酸多样性。综上,3个群体间出现了较为明显的分化现象。(本文来源于《淡水渔业》期刊2019年06期)

曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣[7](2019)在《基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析》一文中研究指出采用Illumina高通量测序技术对鳜(Siniperca chuatsi)性腺转录组进行分析,筛选获得可设计引物的微卫星序列4 986条。随机合成239对微卫星引物,其中27个微卫星标记(11.30%)在12个鳜群体中呈现多态性,等位基因数2~8(5.63±1.84),有效等位基因数1.86~6.80(3.99±1.56),观测杂合度0.21~0.78(0.49±0.16),期望杂合度0.46~0.85(0.71±0.12),平均多态信息量0.37~0.84(0.66±0.15),基因流0.11~2.14(0.67±0.45)。在12个鳜群体中,嘉鱼群体平均等位基因数和平均有效等位基因数最大;武汉群体平均观测杂合度、平均期望杂合度高;12个群体遗传距离为0.103 0~1.511 7,遗传相似系数为0.220 5~0.902 2;抚远群体和顺德群体间的遗传距离最大(1.511 7),遗传相似系数最小(0.220 5);韶关群体和顺德群体间的遗传距离最小(0.103 0),遗传相似系数最大(0.902 2);UPGMA聚类分析显示珠江水系一支与长江水系一支先聚集后再与黑龙江水体支汇聚;12个群体间的遗传分化系数F_(ST)介于0.041 8~0.611 0,群体间的遗传分化达到了显着性水平(P<0.05),梁子湖群体与武汉群体间的F_(ST)最小(0.041 8),顺德群体与抚远群体间的F_(ST)最大(0.611 0);AMOVA分析表明:群体间的遗传变异占33.14%,群体内遗传变异占66.86%;Structure分析显示12个群体可分为5个亚群。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2019年06期)

宫丹丹,吴蕾,申雪雪,李强,王保通[8](2019)在《陕西省小麦白粉菌群体毒性结构及遗传多样性》一文中研究指出为了明确陕西省小麦白粉菌群体的毒性频率和遗传多样性,利用34个含有已知抗白粉病基因的小麦品种(系)和5对多态性较好的ISSR分子标记,分别对2016年采集、分离自陕西省渭南、西安、咸阳、宝鸡、汉中和安康等6个市15个乡镇的小麦白粉菌160个单孢子菌株进行了毒性频率和遗传多样性分析。结果显示,供试小麦白粉菌群体对Pm1、Pm2、Pm3b、Pm3c、Pm3e、Pm3f、Pm6、Pm7、Pm8、Pm19和Pm1+2+19的毒性频率在60%~100%之间,表明这些抗性基因在生产上已经丧失利用价值,对Pm4b、Pm24、Pm2+6、Pm2+Mld、Pm2+6+?、Pm4b+Mli、Pm "Era"、Pm "XBD"、Pm21的毒性频率低于20%,表明这些抗性基因抗性良好,可以在抗病育种中利用。渭南群体、西安群体、咸阳群体、宝鸡群体、汉中群体和安康群体等小麦白粉菌6个地理群体间的遗传距离在0.0204~0.1037,其中宝鸡群体和渭南群体的遗传距离最近,汉中群体和咸阳群体的遗传距离最远。群体间的遗传变异占总体变异的12.82%,群体内的遗传变异占87.12%,表明遗传变异主要来自于群体内。UPGMA的聚类分析结果显示,小麦白粉菌的遗传结构与地理位置之间存在着一定的相关性。(本文来源于《中国植物保护学会2019年学术年会论文集》期刊2019-10-23)

赵凯,靳小业,林大钧,巩五虎[9](2019)在《湛江汉族27个Y-STR基因座的群体遗传多样性》一文中研究指出目的研究27个Y-STR基因座在湛江汉族群体中的遗传多样性分布,并评估这些基因座的法医学应用价值。方法采集湛江汉族551名健康男性无关个体的血液样本,采用Y filer~(TM) Plus试剂盒对27个Y-STR基因座进行复合扩增检测,根据基因型的结果计算27个Y-STR基因座的等位基因频率、基因多态性、单倍型多态性等法医学参数,同时基于Y-STR Haplotype Reference Database中报道的群体数据探讨湛江汉族和其他汉族群体的遗传关系。结果在551名湛江汉族个体中,一共观察到290个等位基因,等位基因频率分布在0.0018~0.7532。27个Y-STR基因座的基因多态性分布在0.3885~0.9539。群体遗传学分析结果表明:湛江汉族与南方地区的汉族群体有较近的遗传关系。结论 24个Y-STR基因座在湛江汉族群体中显示出较好的遗传多样性,可为湛江汉族父系亲缘关系的鉴识研究提供有价值的信息。(本文来源于《中国法医学杂志》期刊2019年05期)

郑小壮,陈清华,陈文坚,郭照良[10](2019)在《基于线粒体COⅠ基因序列的掌肢新米虾7个自然群体遗传多样性分析》一文中研究指出采用DNA条形码技术,对采自广东清远、惠州、韶关、广州与广西河池、南宁、崇左的7个掌肢新米虾(Neocaridinapalmata)野生群体的97个样本的线粒体COⅠ基因片段进行PCR扩增和测序分析,研究掌肢新米虾自然群体的遗传多样性及遗传结构。结果表明:掌肢新米虾在624 bp的COⅠ基因序列中A、T、C、G碱基的平均含量分别为26.98%、33.17%、20.99%、18.85%,AT含量(60.15%)高于CG含量(39.84%),表现出较强的AT偏倚性;基于COⅠ基因序列的总群体中共检测到4个核苷酸变异位点,定义了5种单倍型,平均核苷酸差异数(K)、单倍型多样性指数(Hd)以及核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.611、(0.557±0.025)、(0.00098±0.00007),呈现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性;7个自然群体的群体内遗传距离为0.000~0.001,群体间的遗传距离为0.000~0.002;分子方差分析(AMOVA)和遗传分化系数(F_(st))结果揭示,掌肢新米虾的遗传变异主要来自于群体间;中性检验和核苷酸错配分布表明,掌肢新米虾7个自然群体遵循群体扩张模式,发生了历史扩张事件;系统发育分析显示,广东4群体与广西3群体形成姐妹支,表明不同地理区域具有一定的种群特征,可作为单独的管理单位进行保护,Hap1与Hap4分别是广东4群体与广西3群体和惠州群体的共享单倍型,其余单倍型为各群体所独享。(本文来源于《湖南农业大学学报(自然科学版)》期刊2019年05期)

群体遗传多样性论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

环境污染和人类活动使我国泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)资源量锐减,种质资源不断退化。为探索我国泥鳅不同地理群体的遗传多样性及种群遗传结构,本研究采用10个微卫星标记对鄱阳湖地区及珠江流域共7个泥鳅群体(鄱阳湖,英德,清远,连南,南雄,梅州,柳州)进行了遗传多样性分析。结果表明,各基因座的平均等位基因数(number of allele, Na)和有效等位基因数(effective number of allele, Ne)分别为7和2.5个,平均观测杂合度(observed heterozygosity, Ho)和期望杂合度(expected heterozygosity, He)分别为0.327 4和0.396 0。7个泥鳅群体间的近交系数(population inbreeding coefficient, Fis)、遗传分化系数(genetic differentiation coefficient, Fst)和基因流(number of migrants per generation, Nm)分别为0.093 0、0.372 0和0.422 1,表明7个群体间遗传交流水平低,存在较高程度的遗传分化。10对微卫星引物在7个群体中共扩增出79个等位基因,群体的Na为3.0~7.5个,Ne为1.7~5.5个,Ho为0.307 4~0.534 7,He为0.329 0~0.861 5,多态信息含量(polymorphism information content, PIC)为0.316 8~0.529 4。7个泥鳅群体间的遗传距离为0.045 3~1.602 3,柳州与南雄群体遗传距离最小(0.0453),亲缘关系较近;清远与梅州群体遗传距离最大(1.6023),亲缘关系相对较远。基于遗传距离的聚类结果显示,柳州、南雄、连南和梅州群体聚为一个分支,而清远、英德和鄱阳湖群体聚为另一个分支。上述研究结果表明,目前我国泥鳅群体的遗传多样性处于中等水平,泥鳅群体间的遗传分化受自身迁移能力和地理隔离等因素的影响。本研究可为泥鳅良种基础群体的进一步选择及泥鳅种质资源的保护提供理论依据。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

群体遗传多样性论文参考文献

[1].邢泽农,辛鑫,刘亚忠,李秋孝,张嘉园.陕棉抗病种质及其衍生品种遗传多样性与群体结构的研究[C].科技创新与扶贫攻坚——陕西省农作物学会第二届会员代表大会暨2019年学术年会摘要集.2019

[2].刘洁,高风英,卢迈新,陈刚,曹建萌.我国7个泥鳅群体遗传多样性的微卫星分析[J].农业生物技术学报.2019

[3].王永辰,姜巨峰,刘肖莲,宋立民,吴会民.天津地区日本沼虾群体遗传多样性的微卫星分析[J].天津农业科学.2019

[4].陈越,陈玲,张敦宇,肖素勤,殷富有.云南水稻种质资源的遗传多样性及群体结构分析[J].西北农业学报.2019

[5].朱弘,蔡厚才,李涌福,陈万东,陈林.中国东部沿海水仙归化群体的遗传多样性[J].热带亚热带植物学报.2019

[6].潘贤辉,周康奇,陈忠,杜雪松,黄姻.基于线粒体D-loop区和COI基因序列研究2个禾花鲤群体和野生鲤群体的遗传多样性与系统进化关系[J].淡水渔业.2019

[7].曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣.基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析[J].华中农业大学学报.2019

[8].宫丹丹,吴蕾,申雪雪,李强,王保通.陕西省小麦白粉菌群体毒性结构及遗传多样性[C].中国植物保护学会2019年学术年会论文集.2019

[9].赵凯,靳小业,林大钧,巩五虎.湛江汉族27个Y-STR基因座的群体遗传多样性[J].中国法医学杂志.2019

[10].郑小壮,陈清华,陈文坚,郭照良.基于线粒体COⅠ基因序列的掌肢新米虾7个自然群体遗传多样性分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版).2019

论文知识图

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