论文摘要
对金莲花叶绿体基因组中筛选出的49条蛋白质编码序列(CDS)进行密码子使用偏好性(CUB)分析,为研究物种进化和外源基因表达提供依据。结果表明,金莲花叶绿体基因的有效密码子数(ENC)在40.21～55.54波动,密码子的偏好性较弱;ENC与U3s、A3s呈极显著负相关,与G3s、GC3s呈极显著正相关,同义密码子第3位上的碱基含量直接影响密码子使用偏好性和基因的表达水平。相对同义密码子使用度(RSCU)分析发现,每种氨基酸的较优表达密码子RSCU均大于1且都以A或U结尾,最后确定9个密码子为金莲花叶绿体的最优密码子。通过与其他物种密码子使用频率的比较发现,酵母真核表达系统和双子叶模式植物拟南芥分别更适合金莲花叶绿体基因作基因表达和转基因研究的异源受体。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 雷慧,李鸽,王娜玉
关键词: 金莲花,叶绿体,密码子偏好性,最优密码子
来源: 山西农业科学 2019年08期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学,农作物
单位: 忻州师范学院生物系
基金: 忻州师范学院院级青年基金项目(QN201536)
分类号: Q943.2;S567.2
页码: 1300-1305+1445
总页数: 7
文件大小: 157K
下载量: 231
相关论文文献
- [1].巨桉叶绿体基因组密码子偏好性分析[J]. 广西植物 2019(12)
- [2].两种梧桐叶绿体基因组密码子使用偏性分析[J]. 广西植物 2020(02)
- [3].密码子使用偏好性对生物钟基因表达模式及功能的影响[J]. 生物学教学 2020(03)
- [4].基于转录组数据分析药用真菌猪苓密码子使用偏好性[J]. 药学学报 2020(05)
- [5].马尾松转录组密码子使用偏好性及其影响因素[J]. 林业科学 2020(04)
- [6].云南蓝果树叶绿体基因组密码子偏好性分析[J]. 西北林学院学报 2020(04)
- [7].乳油木叶绿体基因组密码子偏好性分析[J]. 分子植物育种 2020(17)
- [8].美国红梣叶绿体基因组密码子偏好性分析[J]. 江苏农业科学 2020(15)
- [9].遗传密码子的起源——从能量转化到信息化[J]. 生物多样性 2017(01)
- [10].寨卡病毒基因组密码子偏爱性分析[J]. 基因组学与应用生物学 2017(02)
- [11].中东呼吸综合征冠状病毒结构蛋白与附属蛋白编码基因密码子偏爱性分析[J]. 病毒学报 2016(04)
- [12].川贝母转录组密码子使用偏好性分析[J]. 中国中药杂志 2016(11)
- [13].密码子偏性分析方法及茶树中密码子偏性研究进展[J]. 茶叶通讯 2016(02)
- [14].大豆花叶病毒密码子使用及其进化分析[J]. 大豆科学 2014(06)
- [15].埃博拉病毒包膜糖蛋白的密码子偏爱性分析[J]. 医学研究杂志 2015(03)
- [16].高中生物教学中“一”的辨析[J]. 中学生物教学 2017(05)
- [17].基因科学新发现:所有密码子都可能成为起始密码子[J]. 飞碟探索 2017(04)
- [18].植物抗病基因密码子使用特性分析[J]. 山东农业大学学报(自然科学版) 2013(04)
- [19].木兰科叶绿体基因组的密码子使用特征分析[J]. 中国农业科技导报 2020(11)
- [20].落叶松-杨栅锈菌基因组密码子使用偏好分析[J]. 菌物学报 2020(02)
- [21].茶树密码子使用偏性分析方法及其研究进展[J]. 分子植物育种 2020(05)
- [22].小球藻叶绿体基因组密码子偏好性分析[J]. 分子植物育种 2020(17)
- [23].秋茄叶绿体基因组密码子使用偏好性分析[J]. 森林与环境学报 2020(05)
- [24].铁核桃叶绿体基因组密码子偏好性分析[J]. 分子植物育种 2020(20)
- [25].茄腐镰孢(Fusarium solani)线粒体基因组密码子偏好性分析[J]. 基因组学与应用生物学 2015(11)
- [26].长春花密码子使用偏好性分析[J]. 中国中药杂志 2016(22)
- [27].密码子使用偏性量化方法研究综述[J]. 基因组学与应用生物学 2013(05)
- [28].红豆杉属基因的密码子偏性分析[J]. 湖北农业科学 2013(10)
- [29].多杀性巴氏杆菌的遗传密码子偏好性初步分析[J]. 黑龙江畜牧兽医 2012(09)
- [30].鸡七号染色体上的最优密码子[J]. 畜牧与饲料科学 2012(07)