导读:本文包含了柯萨奇论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:病毒,萨奇,手足,肠道,基因,信息学,噬菌体。
柯萨奇论文文献综述
答嵘,王伟[1]（2019）在《柯萨奇病毒B5基因组进化存在结构蛋白编码区VP4的重组》一文中研究指出目的重组是肠道病毒进化的重要机制,大多数重组事件发生在包括P2和P3的肠道病毒的非编码区中,但是在埃可病毒30株中首次发现了作为蛋白质编码区的VP4区域中的重组,本研究旨在探讨柯萨奇病毒B5(CVB5)中是否存在类似的重组事件。方法从GenBank中检索CVB5的核苷酸序列,分别在5′UTR和VP1区域中进行系统发育分析。此外,跨越5′UTR-VP4-5′VP2的部分基因组用于检测重组并使用序列相似性作图(Similarity plot)来分析重组体。结果 5′UTR和VP1系统发育树显示5′UTR和VP1之间有4个病毒株位于不同簇中,表明这些病毒株中存在重组事件。Similarity plot分析表明,CVB5AY875692的5′UTR-VP4-5′VP2区域存在交叉,序列分析证明VP4区域存在重组位点。结论 CVB5在VP4区域具有重组事件,表明结构蛋白编码区亦可作为CVB5重组的候选基因位点。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2019年23期）
姚学君,李峰,陈国清,张红军,姜仁杰[2]（2019）在《盐城地区柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区基因分子生物信息学分析》一文中研究指出目的分析盐城地区柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)VP1区蛋白结构和B细胞表位。方法基于盐城地区2017年CVA16分离株J837 VP1区蛋白序列,采用分子生物信息学软件预测蛋白质理化特性、亲水性、二级结构和抗原表位等。结果盐城地区CVA16分离株VP1区编码蛋白为亲水蛋白,无信号肽,有1个跨膜螺旋区域,二级结构以无规则卷曲为主,存在7个潜在的B细胞抗原表位。结论本文成功预测了CVA16分离株VP1区蛋白二级结构和B细胞优势表位,为CVA16疫苗研研发提供了科学依据。(本文来源于《现代预防医学》期刊2019年21期）
董兆鹏,孙箐爽,臧昊,王唐,蔡光[3]（2019）在《金山区柯萨奇病毒A组6型基因特征分析》一文中研究指出目的分析上海市金山区2017—2018年分离的柯萨奇病毒A组6型(Cox A6) VP1基因特征和氨基酸位点突变,为手足口病防控提供依据。方法对金山区2017—2018年采集并分离到16株Cox A6分离株VP1全长基因进行扩增、测序、序列比对,构建系统发生树,分析核苷酸和氨基酸同源性以及氨基酸位点突变。结果金山区16株Cox A6分离株均属于E2亚型同一个进化分支,16株间VP1基因核苷酸同源性为92.3%～97.7%,氨基酸同源性为98.4%～100.0%。与金山区16株分离株同源性最高的是2018年山东分离株MK357081/CHN/SD/JN/2018,核苷酸和氨基酸同源性分别为95.7%～99.3%和98.7%～99.7%。13株Cox A6分离株VP1氨基酸序列存在氨基酸位点变异,涉及8个氨基酸变异位点,但在抗原表位重要位点201D、243H、245R、247Y、248M和249R均未检测到抗原漂移。结论 16株Cox A6分离株核苷酸和氨基酸序列高度同源且位于E2亚型同一进化分支;Cox A6 E2亚型可能是金山区2017—2018年流行的主导基因型,金山区Cox A6 VP1存在氨基酸突变位点但未涉及关键的抗原表位。(本文来源于《预防医学》期刊2019年11期）
沈雅婧,李兰娟[4]（2019）在《B3型柯萨奇病毒感染对胰岛细胞糖尿病相关LncRNA表达的影响》一文中研究指出目的:探讨B3型柯萨奇病毒诱发糖尿病发生的具体机制。方法:采用B3型柯萨奇病毒感染人胰岛细胞HUM-CELL-0058,病毒感染48 h后提取细胞总RNA并通过荧光定量PCR检测糖尿病相关LncRNA。对调控叁种LncRNA转录的转录因子mRNA及蛋白采用实时定量PCR及Western blot进行监测。构建了PAX6及NF-κB的过表达质粒,并转染病毒感染后的胰岛β细胞,检测柯萨奇病毒感染后异常表达LncRNA的表达水平。结果:糖尿病相关LncRNA,Lnc-P12792和MALAT1有上调表达,上升2～3倍(P<0.01),而HI-Lnc45的表达水平约为对照组的60%(P<0.01)。实时定量PCR及Western blot结果表明调控HI-Lnc45表达的转录因子PAX6表达量降低50%而调控Lnc-P12792和MALAT1的转录因子NF-κB(p65)表达升高2.5倍(P<0.001),这与其调控的转录因子趋势一致。表明LncRNA的表达差异是由于该基因转录因子表达异常所导致。实时定量结果表明,叁种异常表达LncRNA的mRNA水平回归B3型柯萨奇病毒感染前的正常水平,证明这一趋势可被调控这两种转录因子的表达量所拯救。结论:B3型柯萨奇病毒感染人胰岛β细胞会引起转录因子NF-κB的上调表达以及PAX6的下调表达,并引起下游与糖尿病发生有关LncRNA的异常表达,这可能是B3型柯萨奇病毒诱发糖尿病发生的病理机制之一。(本文来源于《中国临床药理学与治疗学》期刊2019年10期）
孔志芳,倪红霞,杨斌,谢蕾,张丹[5]（2019）在《2018年浙江省宁海县柯萨奇病毒A组6型手足口病临床特征及分子流行病学》一文中研究指出目的了解浙江省宁海县柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)手足口病的临床特征,探讨其防控策略和措施。方法从国家疾病监测信息系统获取2018年宁海县手足口病资料,采集宁海县第一医院手足口病门诊、住院患者粪便和(或)咽拭子标本,用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测肠道病毒通用型及核酸分型,对Cox A6阳性标本进一步用RT-PCR方法进行VP1全长基因扩增、测序和系统进化分析。结果肠道病毒核酸阳性635例,阳性率为75.42%,其中Cox A6、非Cox A6阳性分别为412例(64.88%)和223(35.12%);对Cox A6与非Cox A6病例组的临床表现进行比较,年龄、发热及热程、皮疹分布范围、出现疱疹及大疱疹比例、皮肤疼痛和痒感、脱皮及色素沉着、随访16周脱甲率等因素差异有统计学意义。序列分析显示,2018年宁海县流行的Cox A6均为D3基因亚群,D3.2分枝。结论 2018年宁海县Cox A6 D3基因亚群病毒广泛流行,临床上表现为皮肤黏膜剧烈反应,皮疹分布较非Cox A6广泛,脱甲为Cox A6病毒对指(趾)甲的直接侵害。(本文来源于《疾病监测》期刊2019年11期）
白晗,马淑花,郭会杰,刘少华,李秀玲[6]（2019）在《柯萨奇病毒A组16型抗原表位预测》一文中研究指出目的应用模拟表位策略研究柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)抗原表位。方法分别以具有中和活性的抗CA16单克隆抗体2C6、4F9、1D8为靶分子,在噬菌体12肽库中淘选可与之特异性结合的阳性克隆,对淘选得到的阳性克隆进行序列测定和比对,并采用Phage ELISA法进行特异性鉴定。同时利用生物信息学方法对CA16衣壳蛋白理化性质进行分析,并与阳性噬菌体多肽序列和结构进行比对,预测CA16中和抗原表位。结果经噬菌体12肽库筛选,单克隆抗体2C6、4F9、1D8淘选阳性噬菌体富集率分别为2.39×10~3、1.32×10~4和3.762×10,获得可与单克隆抗体2C6、4F9、1D8结合的阳性克隆分别为10、11、6种,其中各组共有基序分别为K+X+WW和N/Q+S/T+Y/F/W、K+X+WW+D/E、T+X+P+W。Phage ELISA特异性鉴定阳性克隆肽CA1和CB1、FB3和FC3、DA1和DA2、DA5分别强特异性结合单克隆抗体2C6、4F9、1D8。经计算机预测分析,确定了主要位于CA16 VP1 800-810区域,并涉及VP4、VP3上的多个中和表位区域。结论应用模拟表位策略成功筛选出了CA16中和抗原表位,为CA16蛋白抗原结构、新型表位疫苗及诊断试剂的进一步研究奠定了基础。(本文来源于《中国生物制品学杂志》期刊2019年10期）
韦冬明,罗园生,彭心华[7]（2019）在《胶体金法在检测肠道病毒71型IgM和柯萨奇病毒A16型IgM中的应用》一文中研究指出目的探讨胶体金法在检测肠道病毒71型IgM(EV71-IgM)和柯萨奇病毒A16型IgM(CA16-IgM)中的应用价值。方法选择医院2017—2018年收治的400例手足口病患儿作为研究对象,均进行胶体金法和酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测;以最终确诊结果为参照,比较胶体金法与ELISA法对于CA16-IgM抗体、EV71-IgM抗体的检测结果和符合率。结果胶体金法检出CA16-IgM抗体的符合率低于ELISA法,但差异无统计学意义(P>0.05);胶体金法检出EV71-IgM抗体的符合率低于ELISA法,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论胶体金法检测CA16-IgM抗体、EV71-IgM抗体的符合率与ELISA法相近,可为临床患儿提供早期诊断的依据。(本文来源于《医疗装备》期刊2019年18期）
戎浩,王丽萍,高柳莺,董长征[8]（2019）在《柯萨奇病毒A组10型构象表位的生物信息学预测》一文中研究指出近年来,柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)逐渐成为手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)最重要的病原体之一。相比肠道病毒A组71型(Enterovirus 71,EV-A71),CV-A10尚未有上市的疫苗,其构象表位也缺乏系统性研究。本研究利用实验室发展的人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,对CV-A10的构象表位进行系统性预测。结果显示:45个氨基酸残基聚集成叁簇构象表位:site 1、site 2和site 3。site 1位于病毒衣壳表面峡谷的北侧,site 2和site 3位于峡谷南侧,叁者呈现"品"字形分布。site 2和site 3与已报道的两个表位2G8和VP2-P28高度重迭,说明预测结果具有较高准确性。鼻病毒B种14型(Rhinovirus B14,RV-B14)、脊髓灰质炎病毒1型(Poliovirus type 1,PV1)和CV-A10同属于人肠道病毒。已有研究表明,RVB14和PV1的抗原表位也呈叁簇分布,且每一簇都与CV-A10的预测结果高度重迭。这既说明了预测结果的准确性,同时也提示叁簇构象表位的分布模式可能是人肠道病毒构象表位的基本分布规律。CV-A10构象表位的预测结果,为构象表位的实验鉴定、病毒的分子流行病学研究和疫苗研发提供了重要支持。(本文来源于《病毒学报》期刊2019年05期）
魏雷雷,吴东林,杨尧,王岙,王爽[9]（2019）在《2017年吉林省手足口病肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析》一文中研究指出目的了解吉林省2017年肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型(CVA16)流行特征、种系进化及基因分型。方法对吉林省2017年分离获得的EV71和CVA16阳性毒株的VP1编码区核苷酸进行扩增及序列测定,而后使用Mega 6. 0和Bioedit 7. 01软件进行序列分析。结果 8株EV71流行株均为C4a基因亚型,流行株间核苷酸和氨基酸同源性分别为92. 2%～100%和98. 3%～100%; 9株CVA16流行株均为B1b基因亚型,流行株间核苷酸和氨基酸同源性分别为94. 2%～100%和99. 3%～100%。结论 EV71的C4a基因亚型和CVA16的B1b基因亚型是引起吉林省2017年手足口病流行的主要基因亚型;相对于EV71流行株的变异而言,CVA16流行株变异较少。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2019年17期）
戴潇逸,钟江[10]（2019）在《受miRNA-205调控的重组柯萨奇病毒B3的构建及其复制》一文中研究指出本研究在柯萨奇病毒B3(coxsackievirus B3,CVB3)基因组P1编码区与P2编码区之间插入一段has-miRNA-205-3p和has-miRNA-205-5p(简称miR-205)的靶序列,得到重组病毒v205T,并比较分析了它在人宫颈癌细胞系HeLa细胞(miR-205低水平表达)和非小细胞肺癌细胞系A549细胞(miR-205高水平表达)中的复制情况。结果表明,插入的miR-205靶序列不影响病毒在HeLa细胞中的复制水平,但抑制了病毒在A549细胞中的复制,病毒滴度为对照的1%以下。为探讨v205T在2株细胞中复制差异的原因,进一步加入miR-205的类似物和抑制物。miR-205类似物可抑制v205T在HeLa细胞中复制和杀伤细胞的水平,而miR-205抑制物可提高v205T在A549细胞中的复制和杀伤细胞的水平。结果表明,v205T的复制确实受miR-205的调控。本研究为开发基于CVB3载体的溶瘤病毒和针对CVB3的减毒活疫苗提供了依据。(本文来源于《微生物与感染》期刊2019年04期）
柯萨奇论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的分析盐城地区柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)VP1区蛋白结构和B细胞表位。方法基于盐城地区2017年CVA16分离株J837 VP1区蛋白序列,采用分子生物信息学软件预测蛋白质理化特性、亲水性、二级结构和抗原表位等。结果盐城地区CVA16分离株VP1区编码蛋白为亲水蛋白,无信号肽,有1个跨膜螺旋区域,二级结构以无规则卷曲为主,存在7个潜在的B细胞抗原表位。结论本文成功预测了CVA16分离株VP1区蛋白二级结构和B细胞优势表位,为CVA16疫苗研研发提供了科学依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
柯萨奇论文参考文献
[1].答嵘,王伟.柯萨奇病毒B5基因组进化存在结构蛋白编码区VP4的重组[J].国际检验医学杂志.2019
[2].姚学君,李峰,陈国清,张红军,姜仁杰.盐城地区柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区基因分子生物信息学分析[J].现代预防医学.2019
[3].董兆鹏,孙箐爽,臧昊,王唐,蔡光.金山区柯萨奇病毒A组6型基因特征分析[J].预防医学.2019
[4].沈雅婧,李兰娟.B3型柯萨奇病毒感染对胰岛细胞糖尿病相关LncRNA表达的影响[J].中国临床药理学与治疗学.2019
[5].孔志芳,倪红霞,杨斌,谢蕾,张丹.2018年浙江省宁海县柯萨奇病毒A组6型手足口病临床特征及分子流行病学[J].疾病监测.2019
[6].白晗,马淑花,郭会杰,刘少华,李秀玲.柯萨奇病毒A组16型抗原表位预测[J].中国生物制品学杂志.2019
[7].韦冬明,罗园生,彭心华.胶体金法在检测肠道病毒71型IgM和柯萨奇病毒A16型IgM中的应用[J].医疗装备.2019
[8].戎浩,王丽萍,高柳莺,董长征.柯萨奇病毒A组10型构象表位的生物信息学预测[J].病毒学报.2019
[9].魏雷雷,吴东林,杨尧,王岙,王爽.2017年吉林省手足口病肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析[J].中国卫生检验杂志.2019
[10].戴潇逸,钟江.受miRNA-205调控的重组柯萨奇病毒B3的构建及其复制[J].微生物与感染.2019
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