群体遗传结构论文_邢泽农,辛鑫,刘亚忠,李秋孝,张嘉园

导读:本文包含了群体遗传结构论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:种质,多样性,群体,结构,标记,水牛,珠母。

群体遗传结构论文文献综述

邢泽农,辛鑫,刘亚忠,李秋孝,张嘉园[1](2019)在《陕棉抗病种质及其衍生品种遗传多样性与群体结构的研究》一文中研究指出通过72个分布于棉花全基因组的SSR标记,对54份陕棉抗病种质及其衍生品种遗传多样性与群体结构进行了分析。结果表明,陕棉血统的54份种质间遗传相似系数在0.7333~0.9872之间。其中,材料间相似系数≤0.90的占11.1%,相似系数≥0.95的占55.6%,相似系数在0.90~0.95的占33.3%。72个SSR标记等位基因变异的多态性信息含量(PIC值)在0.04~0.68,平均为0.33。基于遗传距离的UPGMA聚类分析显示,在遗传相似系数为0.877时将54个品种分为5类,第Ⅰ类44个品种,第Ⅲ类7个品种,第Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ类各1个品种。基于数学模型的聚类和群体结构分析显示,54份种质归属于4个组群。总的来看,54份材料间遗传相似系数较大,遗传基础比较狭窄,多样性很低。(本文来源于《科技创新与扶贫攻坚——陕西省农作物学会第二届会员代表大会暨2019年学术年会摘要集》期刊2019-12-13)

陈越,陈玲,张敦宇,肖素勤,殷富有[2](2019)在《云南水稻种质资源的遗传多样性及群体结构分析》一文中研究指出利用SSR分子标记对覆盖云南16个州(市)的908份水稻种质资源进行遗传多样性及群体结构分析。结果表明,22对SSR标记共检测到193个等位基因,每对标记的等位基因数为4~18,平均8.78;主要等位基因的频率为0.204 8~0.794 1,平均0.380 3;基因多样性指数为0.347 7~0.887 6,平均0.730 7;多态信息含量为0.320 2~0.877 7,平均0.698 6。以地理来源进行分类并分析其遗传多样性,结果表明,云南水稻种质资源在不同州(市)间的遗传差异较大,其中普洱市水稻种质资源的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性及Shannon’s指数最高,而迪庆州和楚雄州相对较低,说明普洱市水稻种质资源的遗传多样性最丰富,而迪庆州和楚雄州相对较低;遗传距离和遗传一致度分析表明,普洱市与西双版纳州水稻种质资源的遗传距离最小、遗传一致度较高,亲缘关系最近,而昆明市与楚雄州水稻种质资源的遗传距离最大、遗传一致度较低,亲缘关系最远。遗传分化分析显示,908份水稻种质资源的遗传变异主要来源于种质内个体间,且种质间的基因流为2.838 8,该值大于1,说明云南水稻种质资源间存在频繁的基因交流现象;NJ聚类分析、PCA主成分分析及Sturcture群体遗传结构分析均将供试材料分为2大类群,其中NJ聚类分析和PCA分析又在2大类群的基础上分为4个亚群,908份云南水稻种质资源并没有按照地理来源进行聚类,交错分布于各个类群中。表明云南水稻种质资源具有极其丰富的遗传多样性,且不同州(市)水稻种质资源的遗传差异较大,将为今后水稻新品种选育提供宝贵的资源材料。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年11期)

黄景,潘肖兰,许蒙,刘文广,张华[3](2019)在《形态学和SNP标记分析马氏珠母贝杂交子代及其亲本群体的遗传结构》一文中研究指出马氏珠母贝是重要的海水养殖贝类,为了探究繁育亲本及其子代的遗传结构和关系,本研究运用多元性形态学和SNP标记对马氏珠母贝母本深圳群体、父本海南群体和其杂交子代F1的外部形态和分子遗传结构进行分析。结果发现, 3个群体的综合判别率为72%, F1和母本群体的形态差异最小,父本群体与母本、F1的形态差异较大。采用HRM法(high resolution melting)应用4个SNP位点对这3个群体进行分型, 3个群体的平均观测杂合度Ho和期望杂合度He分别为0.2110~0.2879和0.3317~0.4685, F1的杂合度高于两个亲本;平均多态信息含量PIC值为0.2643~0.3556,呈现中等程度遗传多样性。F1与母本之间的基因流Nm最大(7.7701),遗传距离最小(0.0546),亲缘关系最近;两个亲本之间的Nm最小(1.9662),遗传距离最大(0.1759)。rs8位点可以判别两个亲本群体,可作为特异性的标记。该结果可以为马氏珠母贝群体遗传结构鉴别、育种群体管理提供指导。(本文来源于《热带海洋学报》期刊2019年06期)

曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣[4](2019)在《基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析》一文中研究指出采用Illumina高通量测序技术对鳜(Siniperca chuatsi)性腺转录组进行分析,筛选获得可设计引物的微卫星序列4 986条。随机合成239对微卫星引物,其中27个微卫星标记(11.30%)在12个鳜群体中呈现多态性,等位基因数2~8(5.63±1.84),有效等位基因数1.86~6.80(3.99±1.56),观测杂合度0.21~0.78(0.49±0.16),期望杂合度0.46~0.85(0.71±0.12),平均多态信息量0.37~0.84(0.66±0.15),基因流0.11~2.14(0.67±0.45)。在12个鳜群体中,嘉鱼群体平均等位基因数和平均有效等位基因数最大;武汉群体平均观测杂合度、平均期望杂合度高;12个群体遗传距离为0.103 0~1.511 7,遗传相似系数为0.220 5~0.902 2;抚远群体和顺德群体间的遗传距离最大(1.511 7),遗传相似系数最小(0.220 5);韶关群体和顺德群体间的遗传距离最小(0.103 0),遗传相似系数最大(0.902 2);UPGMA聚类分析显示珠江水系一支与长江水系一支先聚集后再与黑龙江水体支汇聚;12个群体间的遗传分化系数F_(ST)介于0.041 8~0.611 0,群体间的遗传分化达到了显着性水平(P<0.05),梁子湖群体与武汉群体间的F_(ST)最小(0.041 8),顺德群体与抚远群体间的F_(ST)最大(0.611 0);AMOVA分析表明:群体间的遗传变异占33.14%,群体内遗传变异占66.86%;Structure分析显示12个群体可分为5个亚群。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2019年06期)

宫丹丹,吴蕾,申雪雪,李强,王保通[5](2019)在《陕西省小麦白粉菌群体毒性结构及遗传多样性》一文中研究指出为了明确陕西省小麦白粉菌群体的毒性频率和遗传多样性,利用34个含有已知抗白粉病基因的小麦品种(系)和5对多态性较好的ISSR分子标记,分别对2016年采集、分离自陕西省渭南、西安、咸阳、宝鸡、汉中和安康等6个市15个乡镇的小麦白粉菌160个单孢子菌株进行了毒性频率和遗传多样性分析。结果显示,供试小麦白粉菌群体对Pm1、Pm2、Pm3b、Pm3c、Pm3e、Pm3f、Pm6、Pm7、Pm8、Pm19和Pm1+2+19的毒性频率在60%~100%之间,表明这些抗性基因在生产上已经丧失利用价值,对Pm4b、Pm24、Pm2+6、Pm2+Mld、Pm2+6+?、Pm4b+Mli、Pm "Era"、Pm "XBD"、Pm21的毒性频率低于20%,表明这些抗性基因抗性良好,可以在抗病育种中利用。渭南群体、西安群体、咸阳群体、宝鸡群体、汉中群体和安康群体等小麦白粉菌6个地理群体间的遗传距离在0.0204~0.1037,其中宝鸡群体和渭南群体的遗传距离最近,汉中群体和咸阳群体的遗传距离最远。群体间的遗传变异占总体变异的12.82%,群体内的遗传变异占87.12%,表明遗传变异主要来自于群体内。UPGMA的聚类分析结果显示,小麦白粉菌的遗传结构与地理位置之间存在着一定的相关性。(本文来源于《中国植物保护学会2019年学术年会论文集》期刊2019-10-23)

徐文文,孙甜甜,覃广胜,贾银海,王国利[6](2019)在《河流型水牛尼里-拉菲和摩拉水牛群体遗传结构分析》一文中研究指出为了对摩拉水牛、尼里-拉菲水牛进行合理有效的保护,研究其遗传多样性,掌握其遗传背景,试验利用15个微卫星位点对96个个体(尼里-拉菲、摩拉水牛各48头)进行遗传多样性检测。结果表明:在尼里-拉菲水牛15个微卫星位点上共检测到92个等位基因,平均等位基因为6. 133 3,平均有效等位基因为2. 942 3,平均多态信息含量(PIC)为0. 565 5,平均期望杂合度值为0. 618 4;在摩拉水牛15个微卫星位点上共检测到76个等位基因,平均等位基因为5. 133 3,平均有效等位基因为2. 545 4,平均PIC为0. 493 7,平均期望杂合度值为0. 541 3。说明摩拉水牛、尼里-拉菲水牛群体的遗传多样性比较丰富,尼里-拉菲水牛群体的遗传多样性高于摩拉水牛群体。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年17期)

郭易佳,杨天燕,孟玮,韩志强,高天翔[7](2019)在《基于线粒体Cyt b基因的龙头鱼群体遗传结构分析》一文中研究指出在我国黄海、东海和南海海岸带上,选取青岛、南通、舟山、叁门、宁德、泉州和湛江共7个群体164尾龙头鱼(Harpadon nehereus)为研究对象,通过PCR扩增共获得长度为1112 bp的线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因序列,共检测到32个变异位点,其中单变异位点27个,简约信息位点1个。164条序列定义了29个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.3026±0.0479和0.000371±0.000379,其中泉州群体的单倍型多样性和核苷酸多样性均最低。分析比较了不同龙头鱼群体间遗传变异情况,发现群体间平均遗传距离为0.00035,遗传分化指数F_(ST)值均小于0.05,群体间没有发生明显的遗传分化。AMOVA分析结果显示龙头鱼群体遗传差异主要来源于群体内个体间的变异。中性检验的Tajima’s D和Fu’s Fs统计值均为负值且显着偏离中性,核苷酸不配对分布图呈现明显的单峰分布,表明龙头鱼历史上经历了群体扩张事件,参考已知海洋鱼类Cyt b基因2%每百万年的进化速率,估算群体扩张发生的时间大约在0.08—0.32百万年前的第四纪更新世中晚期。(本文来源于《水生生物学报》期刊2019年05期)

任润生,羊杏平,Rumiana,Ray,徐锦华,李苹芳[8](2019)在《基于DArTseq的SNP标记的西瓜核心种质遗传多样性和群体结构分析》一文中研究指出目的与意义:亲本材料是进行育种工作的基础,遗传基础狭窄导致难以培育出突破性品种,因此亟需加强遗传资源的引进及其农艺性状特征和遗传基础的了解与掌握,对现有优良西瓜品种和育种亲本材料进行遗传多样性研究,可有效减少相似遗传背景的组合,减少育种的工作量。同时,随着分子生物学技术的发展,分子标记种类及检测手段(本文来源于《中国瓜菜》期刊2019年08期)

王准,许勇,张海英,范建光,郭绍贵[9](2019)在《1197份西瓜种质资源遗传多样性和群体结构分析及核心种质构建》一文中研究指出目的与意义:西瓜是世界上主要的蔬菜作物,更是中国瓜农增收的高效园艺作物。拓宽西瓜遗传基础,发掘优异种质,提高西瓜品种改良效率是目前全球西瓜育种面临的首要任务,核心种质构建为发掘与利用优异种质提供了一条有效途径。而已有西瓜种质资源的研究多局限于形态特征及农艺性状的鉴定与描述,巨大的工作量使我们无法同(本文来源于《中国瓜菜》期刊2019年08期)

张烨,凌俊,段国庆,胡玉婷,潘庭双[10](2019)在《安徽河川沙塘鳢不同地理群体遗传多样性和遗传结构研究》一文中研究指出为探究安徽河川沙塘鳢不同地理群体遗传多样性差异和遗传分化水平,研究采集了安徽长江、新安江流域的4个地理群体,共142个河川沙塘鳢样本。选择线粒体基因作为分子标记,进行测序与分析。结果显示,标记全长1 291 bp,包含52个变异位点,定义了15个单倍型。4个群体总体遗传多样性水平远高于群体内遗传多样性水平,分子变异主要来源于群体间。所有群体形成了3个反映物种的地理分布关系的支系,且未曾发生过扩张。河川沙塘鳢群体间的分化程度很高,具有较高的保护和选育价值。(本文来源于《安徽农业大学学报》期刊2019年03期)

群体遗传结构论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

利用SSR分子标记对覆盖云南16个州(市)的908份水稻种质资源进行遗传多样性及群体结构分析。结果表明,22对SSR标记共检测到193个等位基因,每对标记的等位基因数为4~18,平均8.78;主要等位基因的频率为0.204 8~0.794 1,平均0.380 3;基因多样性指数为0.347 7~0.887 6,平均0.730 7;多态信息含量为0.320 2~0.877 7,平均0.698 6。以地理来源进行分类并分析其遗传多样性,结果表明,云南水稻种质资源在不同州(市)间的遗传差异较大,其中普洱市水稻种质资源的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性及Shannon’s指数最高,而迪庆州和楚雄州相对较低,说明普洱市水稻种质资源的遗传多样性最丰富,而迪庆州和楚雄州相对较低;遗传距离和遗传一致度分析表明,普洱市与西双版纳州水稻种质资源的遗传距离最小、遗传一致度较高,亲缘关系最近,而昆明市与楚雄州水稻种质资源的遗传距离最大、遗传一致度较低,亲缘关系最远。遗传分化分析显示,908份水稻种质资源的遗传变异主要来源于种质内个体间,且种质间的基因流为2.838 8,该值大于1,说明云南水稻种质资源间存在频繁的基因交流现象;NJ聚类分析、PCA主成分分析及Sturcture群体遗传结构分析均将供试材料分为2大类群,其中NJ聚类分析和PCA分析又在2大类群的基础上分为4个亚群,908份云南水稻种质资源并没有按照地理来源进行聚类,交错分布于各个类群中。表明云南水稻种质资源具有极其丰富的遗传多样性,且不同州(市)水稻种质资源的遗传差异较大,将为今后水稻新品种选育提供宝贵的资源材料。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

群体遗传结构论文参考文献

[1].邢泽农,辛鑫,刘亚忠,李秋孝,张嘉园.陕棉抗病种质及其衍生品种遗传多样性与群体结构的研究[C].科技创新与扶贫攻坚——陕西省农作物学会第二届会员代表大会暨2019年学术年会摘要集.2019

[2].陈越,陈玲,张敦宇,肖素勤,殷富有.云南水稻种质资源的遗传多样性及群体结构分析[J].西北农业学报.2019

[3].黄景,潘肖兰,许蒙,刘文广,张华.形态学和SNP标记分析马氏珠母贝杂交子代及其亲本群体的遗传结构[J].热带海洋学报.2019

[4].曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣.基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析[J].华中农业大学学报.2019

[5].宫丹丹,吴蕾,申雪雪,李强,王保通.陕西省小麦白粉菌群体毒性结构及遗传多样性[C].中国植物保护学会2019年学术年会论文集.2019

[6].徐文文,孙甜甜,覃广胜,贾银海,王国利.河流型水牛尼里-拉菲和摩拉水牛群体遗传结构分析[J].黑龙江畜牧兽医.2019

[7].郭易佳,杨天燕,孟玮,韩志强,高天翔.基于线粒体Cytb基因的龙头鱼群体遗传结构分析[J].水生生物学报.2019

[8].任润生,羊杏平,Rumiana,Ray,徐锦华,李苹芳.基于DArTseq的SNP标记的西瓜核心种质遗传多样性和群体结构分析[J].中国瓜菜.2019

[9].王准,许勇,张海英,范建光,郭绍贵.1197份西瓜种质资源遗传多样性和群体结构分析及核心种质构建[J].中国瓜菜.2019

[10].张烨,凌俊,段国庆,胡玉婷,潘庭双.安徽河川沙塘鳢不同地理群体遗传多样性和遗传结构研究[J].安徽农业大学学报.2019

论文知识图

牛INSR基因扩增产物检测二Fig.4-3Det...华北普通杏种质的群体遗传结构(...群体遗传结构推导图基于SSR标记的113份大麦亲本材料群体用DISTRUCT推导群体遗传结构3基于SSR标记的63份大麦亲本材料的...

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