DNA醛基修饰的选择性荧光标记研究

DNA醛基修饰的选择性荧光标记研究

论文摘要

醛基是DNA中天然核苷酸修饰的重要基团,在表观遗传学的研究中具有重要意义。这些醛基修饰碱基包括5-醛基胞嘧啶(5fC),5-醛基尿嘧啶(5fU),脱碱基位点(AP),它们在真核生物和原核生物的基因表达调控中发挥关键作用,并且修饰水平与某些疾病密切相关。5fC,5fU,AP三者之间存在某些联系,比如参与DNA的主动去甲基化、改变DNA的结构和稳定性从而造成DNA损伤,与蛋白质发生作用形成DNA-蛋白质交联物等,因此,本论文以三种碱基为共同研究对象,致力于用小分子荧光探针同时标记和检测它们。本论文设计并合成了萘酰胺-羟胺和萘酰胺-乙二胺两种探针,通过分别比较两者与三种不同含有醛基的碱基单体反应的活性和稳定性,最终选定萘酰胺-羟胺为较佳的探针。本论文用该探针首次选择性标记了DNA中含有的全部天然醛基包括5fC、5fU和AP,而该探针对其他基团如羟甲基,甲基等修饰的碱基不起作用,表明了探针分子对醛基的高度特异性。本论文详细研究了产物的荧光特性,讨论了羟胺对DNA中醛基的反应活性,为设计选择性标记修饰DNA的化合物提供了重要参考,期望未来本论文设计的探针能用于活体内醛基的定量检测。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstact
  • 第一章 绪论
  •   1.1 核酸的概述
  •     1.1.1 核酸的结构与表观遗传学
  •     1.1.2 修饰碱基
  •   1.2 天然存在的醛基修饰的碱基产生及其功能
  •     1.2.1 5-醛基胞嘧啶的产生和功能
  •     1.2.2 5-醛基尿嘧啶的产生和功能
  •     1.2.3 脱碱基位点的产生和功能
  •   1.3 醛基修饰碱基的化学检测手段
  •     1.3.1 5-醛基胞嘧啶的化学检测方法
  •     1.3.2 5-醛基尿嘧啶的化学检测方法
  •     1.3.3 AP位点的化学检测方法
  •   1.4 本章小结
  • 第二章 课题设计
  •   2.1 选择性标记DNA中的醛基
  •     2.1.1 选题依据
  •     2.1.2 设计思路
  • 第三章 羟胺探针选择性标记DNA上的醛基
  •   3.1 引言
  •   3.2 仪器及试剂
  •     3.2.1 实验器材和设备
  •     3.2.2 试剂
  •     3.2.3 DNA链
  •     3.2.4 实验条件和检测方法
  •   3.3 实验结果与讨论
  •     3.3.1 探针的合成与表征
  •     3.3.2 两种探针分别与单体反应的活性比较
  •     3.3.3 产物的紫外荧光特性的研究
  •     3.3.4 评估羟胺探针对DNA单链的反应活性与选择性
  •     3.3.5 DNA中醛基的定性和定量分析
  •   3.4 本章小结
  • 全文总结
  • 参考文献
  • 攻读硕士期间发表的论文
  • 致谢
  • 附录
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 罗小梦

    导师: 周翔

    关键词: 醛基胞嘧啶,醛基尿嘧啶,脱碱基位点,萘酰胺探针,选择性

    来源: 武汉大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 武汉大学

    分类号: Q751

    总页数: 73

    文件大小: 4502K

    下载量: 87

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