出壳雏鸡病原菌分析及粪肠球菌定量PCR检测方法的建立

出壳雏鸡病原菌分析及粪肠球菌定量PCR检测方法的建立

论文摘要

胚胎期以及刚出壳的雏鸡处于其生命最脆弱的时期,该阶段发育还不完善,抵抗力较差,容易受到外界各种因素影响而导致疾病发生,造成孵化率低、健雏率低,对孵化场和种鸡场的经济效益产生很大影响。因此,调查研究目前导致雏鸡胚胎病的主要病原菌的种类,对雏鸡胚胎病和提高雏鸡的成活率具有重要的意义。1、为调查病、弱感染雏鸡胚胎的主要病原菌,采集了90只刚出壳的病、弱雏鸡。解剖观察其病理变化,从肝脏分离细菌,观察细菌的菌落菌体形态,提取分离菌株的DNA、进行16SrDNA基因序列的扩增并测序,再将测序结果与GenBank数据库的标准株序列比对,最终将比对结果与菌落菌体形态相结合,对分离菌株进行鉴定。结果发现病、弱雏鸡腹围较大;解剖发现皮下胶冻样,卵黄吸收不良,肝呈土黄色;显微镜下显示肝充血,脂肪变性。从病、弱雏鸡的肝脏分离出菌株56株,分离率为62.2%(56/90)。其中粪肠球菌分离率为46.4%(26/56),大肠杆菌为16.1%(9/56),金色葡萄球菌为14.3%(8/56),奇异变形杆菌为8.9%(5/56),鲍氏不动杆菌为5.3%(3/56),沼泽考克氏菌为3.6%(2/56),柠檬酸细菌属为1.8%(1/56),无色杆菌为1.8%(1/56),地衣芽胞杆菌为1.8%(1/56)。结果提示刚出壳雏鸡感染的细菌有9种,主要有粪肠球菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌,为雏鸡胚胎细菌感染的防治奠定了基础。2、为探究粪肠球菌毒力的大小及耐药性,本试验测定了粪肠球菌对鸡胚的半数致死量,并对粪肠球菌做了8类抗生素15种药物的药敏试验。结果发现10倍系列浓度梯度粪肠球菌液,尿囊绒毛膜接种后,鸡胚的存活时间和死亡率呈明显的剂量依赖,粪肠球菌对鸡胚半数致死量为3.03×103cfu/mL;药敏试验发现鸡源粪肠球菌对头孢类药物有较强的耐药性,对青霉素和万古霉素较敏感。成功建立了粪肠球菌鸡胚毒力模型,同时筛选出粪肠球菌有效药物。3、为建立一种快速检测鸡源粪肠球菌的方法,参照GenBank中已发表的鸡粪肠球菌全基因组,采用Primer Express 5.0软件设计了一对特异引物,进行了敏感性、特异性、重复性试验,并通过临床组织样品检测评价其临床实用性。结果显示所建立的方法标准曲线线性关系良好,相关系数R2=0.955;该方法灵敏度高,可检测粪肠球菌的最低限度可达101 cfu/mL;特异性强,不与其他鸡源致病菌发生交叉反应;重复性试验中变异系数小于5%,比较稳定。将患雏肝脏组织块提取的DNA作模板,经建立的SYBR GreenⅠLC-PCR方法检测,结果出现了特异性扩增曲线。此方法可用于临床上粪肠球菌的检测。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 英文缩写表
  • 第一章 绪论
  •   1.1 雏鸡成活率低的原因
  •     1.1.1 细菌性因素
  •     1.1.2 病毒性因素
  •     1.1.3 饲养管理因素
  •   1.2 本研究的目的意义
  • 第二章 出壳雏鸡感染病原菌分析
  •   2.1 材料与方法
  •     2.1.1 样品
  •     2.1.2 仪器设备
  •     2.1.3 试剂与耗材
  •     2.1.4 培养基的制作
  •     2.1.5 病料的采集
  •     2.1.6 病理切片的制作
  •     2.1.7 细菌的纯化方法
  •     2.1.8 菌落菌体的观察
  •     2.1.9 分离菌株的DNA提取
  •     2.1.10 分离菌株的PCR扩增
  •     2.1.11 分离菌株的序列测定与分析
  •   2.2 结果
  •     2.2.1 病、弱雏鸡的病理变化
  •     2.2.2 分离菌株的PCR扩增结果
  •     2.2.3 分离菌株的鉴定
  •   2.3 鉴定结果与分析
  •   2.4 讨论
  •   2.5 小结
  • 第三章 粪肠球菌的鸡胚致死率测定及药物敏感性分析
  •   3.1 材料与方法
  •     3.1.1 菌株和鸡胚来源
  •     3.1.2 材料
  •     3.1.3 鸡胚攻毒
  •     3.1.4 药敏试验
  •   3.2 结果
  •     3.2.1 鸡胚模型攻毒结果
  •     3.2.2 药敏试验结果
  •   3.3 讨论
  •   3.4 小结
  • 第四章 粪肠球菌SYBR Green I荧光定量PCR检测方法建立与应用
  •   4.1 材料与方法
  •     4.1.1 仪器设备
  •     4.1.2 试剂与耗材
  •     4.1.3 菌株来源
  •     4.1.4 DNA提取
  •     4.1.5 引物设计与合成
  •     4.1.6 引物的特异性检测
  •     4.1.7 线型范围测定和定量标准曲线制作
  •     4.1.8 特异性试验
  •     4.1.9 敏感性比较试验
  •     4.1.10 重复性试验
  •     4.1.11 临床组织样品检测
  •   4.2 结果
  •     4.2.1 粪肠球菌引物的特异性
  •     4.2.2 线性范围与标准曲线
  •     4.2.3 定量PCR的特异性试验结果
  •     4.2.4 SYBR GreenⅠLC-PCR与常规PCR敏感性比较
  •     4.2.5 重复性试验结果与分析
  •     4.2.6 临床样本检测结果
  •   4.3 讨论
  •   4.4 小结
  • 结论
  • 技术关键及创新点
  • 致谢
  • 参考文献
  • 作者简介
  • 发表论文与参与科研项目
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 李博

    导师: 刘娜

    关键词: 出壳雏鸡,病原菌,毒力,耐药性,鉴定

    来源: 河北工程大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 河北工程大学

    分类号: S852.61

    总页数: 70

    文件大小: 3371K

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