导读:本文包含了热点突变论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,突变,热点,新生儿,晋城,地中海,耳蜗。
热点突变论文文献综述
耿凯悦,崔亚洲,时良,栾静,周小艳[1]（2019）在《山东省甲基丙二酸血症致病基因热点突变及携带规律研究进展》一文中研究指出甲基丙二酸血症(MMA)是一种由甲基丙二酰辅酶A变异酶(MCM)或细胞内钴胺素代谢障碍引起的常染色体隐性遗传疾病。MMA的发病率在全球范围内约为1:48,000至1:250,000,存在明显的地域差异性。据报道,山东省MMA发病率约为1:3920,与其它地区相比明显偏高。随着串联质谱和气相色谱-质谱(GC-MS)的应用,MMA患儿的死亡率和发病率大大降低,但该疾病急性期的高死亡率和对神经系统的慢性损害都会降低患者的生活质量并增加家庭经济负担。最有效的干预措施是通过产前诊断减少MMA患儿的分娩。目前,多采用生化方法检测与基因诊断相结合的方法进行产前诊断,但基因诊断的费用较高,该技术普遍用于产前诊断较难实现。因此,我们希望通过对山东省MMA患者及山东省健康人群进行基因分析,发现MMA患者中的热点突变及其在健康人群中的携带规律,并分析二者关系,从而缩小基因测序的目标区域,进而为基因检测普遍用于产前诊断提供参考与支持。目前,我们已经收集并检测了16例MMA患者家系以及960例健康人群,结果显示患者中的热点突变分布规律与健康人群中的携带规律基本一致,突变位点集中在MMACHC基因上。另外我们在患者中发现了一个新的突变位点,并构建了其野生型及突变型质粒,通过蛋白免疫印迹和高效液相色谱对其进行体外功能验证。(本文来源于《华东六省一市生物化学与分子生物学会联盟2019年学术与教学交流会摘要集》期刊2019-07-12）
曲凯,张兴,刘昌[2]（2019）在《基于RRA方法的胆道系统肿瘤热点突变基因分析》一文中研究指出目的对胆道系统肿瘤,包括肝内胆管癌(ICC)、肝外胆管癌(ECC)及胆囊癌(GBC)的突变基因进行分析,找出胆道系统肿瘤中热点突变基因。方法检索Web of Knowledge、Scopus、PubMed数据库,根据纳入及排除标准纳入文献。最终纳入14篇符合标准的文献,对每一篇文章中的突变基因情况进行统计,运用RRA方法进行分析,寻找ICC、ECC、GBC的热点突变基因。结果找到ICC的热点突变基因为IDH1(突变频率16.9%)、KRAS(突变频率15.7%);ECC热点突变基因为KRAS(突变频率47.0%)、TP53(突变频率29.4%);GBC热点突变基因为TP53(突变频率36.8%)、KRAS(突变频率18.4%)。同时,发现IDH1基因突变为ICC中特有的基因突变类型。结论胆道系统肿瘤中,IDH1、KRAS、TP53为其热点突变基因。其中,KRAS为胆道系统肿瘤共有热点突变基因,IDH1为ICC中特有的热点突变基因。(本文来源于《西安交通大学学报(医学版)》期刊2019年02期）
赵志军,何学虎,钟利,郭雅琪,董辉[3]（2018）在《新生儿耳聋基因热点突变筛查与分析》一文中研究指出目的分析新生儿进行耳聋基因突变位点、突变类型及携带率情况。方法对住院的患儿2 702例经监护人知情同意后,采集足跟血,提取滤纸血斑基因组DNA;利用耳聋基因热点突变基因芯片进行检测,共包括4个基因9个位点。结果 2 702例新生儿中检出GJB2基因突变58例(携带率2. 15%),GJB3基因突变4例(携带率0. 15%),SLC26A4基因突变38例(携带率1. 41%),线粒体12SrRNA基因突变6例(携带率0. 22%),发现复合突变6例(携带率0. 22%)。此外,研究结果显示,新生儿耳聋基因携带率在民族、性别方面差异无统计学意义(P> 0. 05)。结论 GJB2基因和SLC26A4基因突变率较高,且GJB2突变率高于SLC26A4; GJB3基因、线粒体12SrRNA基因以及复合突变率较低;实施新生儿耳聋基因热点突变筛查有助于对新生聋儿进行精准诊断和及时防治。(本文来源于《宁夏医学杂志》期刊2018年12期）
孟卫京,薛晋杰,郝伟明,李红霞[4]（2018）在《晋城地区40240例新生儿药物敏感性耳聋热点突变基因筛查结果分析》一文中研究指出目的:分析山西省晋城地区新生儿群体中药物敏感性耳聋基因12S rRNA 1555A>G和1494C>T热点突变情况。方法:采集晋城市40240例新生儿足跟血制成干血斑,提取基因组DNA,经PCR扩增目的基因片段后,利用低密度基因芯片-导流杂交平台进行检测。结果:40240例新生儿中发现12SrRNA热点突变携带者135例(3.4‰),1555A>G突变133例(3.3‰)、高平市47例(4.5‰)。1494C>T突变者仅2例(0.05‰)。结论:与全国其它省市相比,晋城地区尤其是高平市为药物敏感性耳聋基因12S rRNA热点突变高发地区,可能与其所在坏境有关。突变主要形式为1555A>G,1494C>T突变较为罕见。(本文来源于《中国计划生育学杂志》期刊2018年09期）
敖睿,朱学强,刘浩,蔡丽君,杨柳[5]（2018）在《叁阴乳腺癌P53突变热点及与预后的关系》一文中研究指出目的:探讨叁阴乳腺癌(TNBC)P53基因热点突变的情况及其与预后的关系。方法:选取2007年1月至2010年12月四川省人民医院收治的71例TNBC患者作为研究对象,采用免疫组化法检测71例TNBC患者手术石蜡标本的P53蛋白表达情况,采用ADx-ARMS方法检测P53基因突变热点情况,并分析两者与TNBC复发转移的关系。结果:71例患者总共有14例出现复发或转移,复发或转移发生率为19.7%。71例患者P53蛋白阳性表达率为69.0%,P53蛋白表达阳性患者的复发或转移率为18.4%,与P53蛋白表达阴性患者的复发或转移率22.7%比较,差异无统计学意义(P>0.05)。总共有5例患者检出P53热点突变,P53热点突发生率为7.0%。P53热点突变全部都在P53蛋白阳性表达的患者中检出,而有P53热点突变的患者均没有出现复发或转移。结论:P53热点突变在TNBC患者中发生率不高,均出现在有P53蛋白阳性表达的患者中,而出现P53热点突变的患者预后较好。(本文来源于《现代生物医学进展》期刊2018年15期）
江泰峰,彭皎皎,郑虹,陈晓丽,孔维丽[6]（2018）在《四川地区277例人工耳蜗植入患者耳聋基因热点突变筛查结果分析》一文中研究指出目的:筛查四川地区277例人工耳蜗植入(CI)患者中我国耳聋基因热点突变,初步了解该地区CI患者中耳聋基因热点突变谱系及发生频率,为临床耳聋防治提供参考。方法:对接受CI的277例患者的耳聋基因热点突变筛查数据及病历资料进行回顾性分析。采集受检者外周静脉血5ml,使用北京博奥生物集团有限公司的晶芯九项遗传性耳聋基因检测试剂盒(微阵列芯片法)检测样本中4个常见耳聋基因的9个常见突变位点:GJB2(35delG、176del16、235delC、299delAT)、GJB3(538C>T)、SLC26A4(2168A>G、IVS7-2A>G)、线粒体12SrRNA(1494C>T、1555A>G)。结果:(1)接受CI的277例患者中检测出耳聋基因热点突变者122例(44.04%,122/277),其中GJB2 235delC纯合突变39例(14.08%,39/277)、GJB2 235delC杂合突变23例(8.30%,23/277)、GJB2 299delAT纯合突变1例(0.36%,1/277)、GJB2 176del16和235delC复合杂合突变2例(0.72%,2/277)、GJB2 235delC和299delAT复合杂合突变13例(4.69%,13/277);SLC26A4 2168A>G杂合突变2例(0.72%,2/277)、SLC26A4 IVS7-2A>G纯合突变16例(5.78%,16/277)、SLC26A4 IVS7-2A>G杂合突变22例(7.94%,22/277)、SLC26A4 2168A>G和IVS7-2A>G复合杂合突变1例(0.36%,1/277);线粒体12SrRNA 1555A>G均质突变2例(0.72%,2/277);GJB2 235delC&SLC26A4 IVS7-2A>G复合杂合突变1例(0.36%,1/277)。(2)277例CI患者中有大前庭导水管综合征(LVAS)患者49例。49例LVAS患者中检测出耳聋基因热点突变者41例(83.67%),包括IVS7-2A>G纯合突变15例(30.61%)、IVS7-2A>G杂合突变22例(44.90%)、2168A>G杂合突变1例(2.04%)、2168A>G和IVS7-2A>G复合杂合突变1例(2.04%)、GJB2235delC纯合突变1例(2.04%)及GJB2 235delC和299delAT复合杂合突变1例(2.04%),剩下的8例LVAS患者通过上述筛查方法未检测出耳聋基因热点突变。(3)277例CI患者中,40例有明确耳聋家族史,其中检测出耳聋基因热点突变者23例(57.50%),237例无明确家族史者中检测出耳聋基因热点突变者99例(41.77%)。2组耳聋基因热点突变检出率比较差异无统计学意义(P>0.05,χ~2=3.4351)。(4)277例CI患者中,273例皆为双耳极重度聋,有3例右耳极重度聋、左耳重度聋的患者,其中2例检测出IVS7-2A>G杂合突变,1例检测出235delC杂合突变;另有1例左耳极重度聋、右耳重度聋患者,检测出235delC杂合突变。结论:(1)本研究277例CI患者中我国耳聋基因热点突变的携带率是44.04%(122/277),其中与GJB2基因有关的热点突变的检出率最高,其次是与SLC26A4基因有关的热点突变,与线粒体12SrRNA基因有关的热点突变检出率较低,未检出GJB3 538C>T位点的热点突变。(2)SLC26A4基因突变可能不是LVAS的唯一病因。(3)本研究结果提示:CI植入患者的遗传背景对常见耳聋基因热点突变检出率影响不大。(本文来源于《临床耳鼻咽喉头颈外科杂志》期刊2018年15期）
钟娟芳,李双飞,杨晓文,谢云兵,廖怡[7]（2018）在《345例非典型地中海贫血HBB基因测序发现多种非热点突变》一文中研究指出目的:探讨非典型地中海贫血中HBB基因突变的类型方法:我院收集的地贫基因检测样本,经血红蛋白电泳筛查,针对HBA2处于中间区域(即2.5-3.5%)的病例,采用PCR-反向斑点杂交法对HBA基因6种常见突变及HBB基因19种常见突变进行检测,进一步对尚未检测到变异的病例进行HBB基因测序。结果:自2015年06月08日至2018年06月29日共收集约15000多例,HBA2处于中间区域(即2.5-3.5%)的共614例,PCR-反向斑点杂交示146例为HBA基因异常,HBA基因并HBB基因异常共23例,203例为HBB基因突变,242例未见(本文来源于《第十一届全国遗传病诊断与产前诊断学术交流会暨第二届海峡两岸医药卫生交流协会遗传与生殖专业委员会年会论文集》期刊2018-08-03）
张彦,刘晶晶,叶秋萍,李印淑[8]（2018）在《聚合酶链反应-反向点杂交法检测遗传性耳聋相关基因的热点突变》一文中研究指出目的探讨聚合酶链反应-反向点杂交(PCR-RDB)法对遗传性耳聋相关基因突变检测的准确性和实用性。方法选择2014年1月至2016年10月,于广东省妇幼保健院临床诊断为非综合征型耳聋(NSHI)的250例患者为研究对象。采用PCR-RDB法检测其外周血遗传性耳聋相关基因突变。PCR-RDB法采用遗传性耳聋基因芯片检测试剂盒,可检测中国人群常见的4个耳聋相关基因的12个热点突变,即GJB2(35del G、176_191del 16、235del C、299_300del AT),GJB3(538C>T),SLC26A4(1174A>T、1226G>A、1229C>T、IVS7-2A>G、2168A>G)及线粒体MTRNR1(1494C>T、1555A>G)。同时,所有DNA样本均采用金标准Sanger测序法进行对比验证。本研究符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》,并征得受试者知情同意。结果 (1)本研究来自250例受试者的250例DNA样本中,耳聋相关基因突变检出率为51.6%(129/250),其中GJB2基因突变检出率为28.4%(71/250),SLC26A4基因突变为19.2%(48/250),线粒体MTRNR1基因突变为4.4%(11/250),GJB3基因突变为2.0%(5/250);129例检出的耳聋相关基因突变中,符合遗传病致病特征的耳聋相关基因突变的几率为86.8%(112/129)。(2)PCR-RDB法与Sanger测序法,对12个耳聋相关基因热点突变的检测结果均相同。(3)PCR-RDB法检测12个耳聋相关基因热点突变的灵敏度、特异度、总一致性、阳性预测值及阴性预测值均为100.0%。结论虽然PCR-RDB法检测耳聋相关基因突变的结果与金标准Sanger测序法一致,但是本研究样本量尚小,因此是否可满足临床对遗传性耳聋基因检测的需求,则需多中心、大样本随机对照试验进一步研究、证实。(本文来源于《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》期刊2018年03期）
刘璇[9]（2018）在《EGFR 19和21外显子热点突变检测的新方法研究》一文中研究指出目的:利用EGFR19外显子15,18碱基缺失和21外显子L858R突变的生物学特性,以及PCR等技术对上述突变基因进行富集,研发出两种快速、简便、灵敏的检测方法,提高肺癌的靶向治疗。方法:博来霉素抗性基因是一种广泛用于筛选质粒成分的报告基因。当博来霉素报告基因中插入一段外源基因序列时,若插入片段含有终止密码子,则博来霉素抗性基因失活;若插入的外来片段不含有终止密码子,则博来霉素抗性基因的阅读框架得以保留,抗性基因仍具有活性。EGFR基因19外显子Del E746-A750,Del L747–S752 ins S缺失突变型不包含TAA碱基序列,利用PCR技术调整阅读框使插入野生序列片段的阅读框形成终止密码子TAA。将上述野生型和缺失突变型DNA插入到p ZAmp B质粒的博来霉素抗性基因序列中,再将重组质粒转化到大肠杆菌中,野生型菌落在含有博来霉素的培养板上不生长,而突变型含有博来霉素的培养板上菌落在生长。另外,L858R由GGCTGG>GGCGGG,利用Taq DNA聚合酶引入酶切位点。野生型变成GGATGG含有Bse GI酶切位点,而突变型GGAGGG不含该酶切位点。利用基因型转换开关技术(PCR耦合限制性内切酶)检测该位点突变,敏感性较高。结果:利用博来霉素作为报告基因检测EGFR19外显子15和18缺失突变,敏感性可以达到0.1%,利用基因型转换开关检测L858R突变灵敏度高达0.01%,上述结果经Sanger’s测序测序验证为可靠结果,可用于ct DNA的稀有突变检测。结论:利用博来霉素作为报告基因检测EGFR19外显子缺失突变以及基因型转换开关检测L858R突变的方法敏感性高,操作简单,可用于临床ct DNA稀有突变的检测。(本文来源于《苏州大学》期刊2018-06-01）
刘玲[10]（2018）在《蛋白质—核酸界面丙氨酸突变效应数据库与热点残基研究》一文中研究指出蛋白质和核酸的相互作用在生物体的众多生命活动中发挥着非常重要的作用,例如基因的转录,翻译,DNA修复和DNA组装等过程。了解相互作用中氨基酸的替换对蛋白质-核酸结合亲和力的影响,可能有利于阐明蛋白质-核酸识别的分子机制;也有助于寻找一些涉及到蛋白质-核酸相互作用紊乱而产生的复杂疾病的解决方法。然而时至今日,仍然没有一个全面的最新的包含蛋白质-核酸界面丙氨酸突变定量结合数据的数据库可以公开访问。基于此,我们建立了一个新的用于研究蛋白质-核酸相互作用丙氨酸突变效应的数据库(dbAMEPNI)。dbAMEPNI是一个基于文献的,由人工管理的数据库。数据库包含一个核心数据集(Core set),这个数据集中包含了 577个由实验测定的蛋白质-核酸界面丙氨酸突变的结合亲和力数据,它们包含了很多重要的组分,如解离常数(Kd),以及吉布斯自由能的变化(AAG),实验条件和蛋白质界面中突变残基的结构参数。另外,数据库还包含了一个扩展数据集(Extended set),这一数据集仅包含282个单丙氨酸突变的热力学效应的定性(或者描述性)数据。数据库公开访问网址为:http://zhulab.ahu.edu.cn/dbAMEPNI/。基于此数据集,我们进一步发展了一种基于知识的蛋白质-核酸界面热点残基预测方法。热点残基是蛋白质-核酸相互作用界面残基中的一小部分残基,他们贡献了蛋白质-核酸结合中绝大部分的亲和性。蛋白质-蛋白质界面热点残基已经被广泛的研究,与之相比,对蛋白质-核酸相互作用界面热点残基的研究仍然很少,其中一个很重要的原因是蛋白质-核酸相互作用的突变数据不像蛋白质-蛋白质界面那么多。在本文的研究中,我们从我们自己构建的dbAMEPNI数据库中获取503个丙氨酸突变数据,这些数据都有热力学记录。然后使用PISCES去除冗余后,得到了 358个蛋白质-核酸界面的丙氨酸突变数据。其中299个数据被用来作为训练数据集训练我们的模型,剩下59个则被用作独立测试集来评价模型的泛化能力。为了构建我们的模型,我们生成了七大类共计97个不同的结构特征,并使用决策树和顺序向前特征选择来选择最优的特征子集。最后利用支持向量机(SVM)构建了一个基于10个特征的模型。这些特征中包含了两个新提出的特征,分别为△SASsa1/2和esp3。前者是残基侧链埋藏的绝对溶剂可及表面积的平方根,后者是目标残基周围小片的静电势。在训练集的交叉验证中,我们模型的敏感度,精确度,准确度和F1 score分别为0.640,0.764,0.840和0.696,而另一种目前已有的用于预测蛋白质-核酸相互作用热力学效应的mCSM-NA模型,它的敏感度,精确度,准确度和F1 score分别为0.419 0.350 0.609和0.381。除此之外,该模型在独立测试集上进行进一步验证,独立测试集中的59个数据中有3个是热点残基,另外的56个为非热点残基。我们的模型在独立测试集中给出的敏感度,精确度,准确度和F1 score分别为0.667,0.400,0.932和0.500,相比较mCSM-NA的1.00,0.100,0.542和0.182而言,我们的模型在预测效果上有一定的优势。(本文来源于《安徽大学》期刊2018-05-01）
热点突变论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的对胆道系统肿瘤,包括肝内胆管癌(ICC)、肝外胆管癌(ECC)及胆囊癌(GBC)的突变基因进行分析,找出胆道系统肿瘤中热点突变基因。方法检索Web of Knowledge、Scopus、PubMed数据库,根据纳入及排除标准纳入文献。最终纳入14篇符合标准的文献,对每一篇文章中的突变基因情况进行统计,运用RRA方法进行分析,寻找ICC、ECC、GBC的热点突变基因。结果找到ICC的热点突变基因为IDH1(突变频率16.9%)、KRAS(突变频率15.7%);ECC热点突变基因为KRAS(突变频率47.0%)、TP53(突变频率29.4%);GBC热点突变基因为TP53(突变频率36.8%)、KRAS(突变频率18.4%)。同时,发现IDH1基因突变为ICC中特有的基因突变类型。结论胆道系统肿瘤中,IDH1、KRAS、TP53为其热点突变基因。其中,KRAS为胆道系统肿瘤共有热点突变基因,IDH1为ICC中特有的热点突变基因。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
热点突变论文参考文献
[1].耿凯悦,崔亚洲,时良,栾静,周小艳.山东省甲基丙二酸血症致病基因热点突变及携带规律研究进展[C].华东六省一市生物化学与分子生物学会联盟2019年学术与教学交流会摘要集.2019
[2].曲凯,张兴,刘昌.基于RRA方法的胆道系统肿瘤热点突变基因分析[J].西安交通大学学报(医学版).2019
[3].赵志军,何学虎,钟利,郭雅琪,董辉.新生儿耳聋基因热点突变筛查与分析[J].宁夏医学杂志.2018
[4].孟卫京,薛晋杰,郝伟明,李红霞.晋城地区40240例新生儿药物敏感性耳聋热点突变基因筛查结果分析[J].中国计划生育学杂志.2018
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[6].江泰峰,彭皎皎,郑虹,陈晓丽,孔维丽.四川地区277例人工耳蜗植入患者耳聋基因热点突变筛查结果分析[J].临床耳鼻咽喉头颈外科杂志.2018
[7].钟娟芳,李双飞,杨晓文,谢云兵,廖怡.345例非典型地中海贫血HBB基因测序发现多种非热点突变[C].第十一届全国遗传病诊断与产前诊断学术交流会暨第二届海峡两岸医药卫生交流协会遗传与生殖专业委员会年会论文集.2018
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[9].刘璇.EGFR19和21外显子热点突变检测的新方法研究[D].苏州大学.2018
[10].刘玲.蛋白质—核酸界面丙氨酸突变效应数据库与热点残基研究[D].安徽大学.2018
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