转录子论文-戈春城,汪羽,何叁纲,徐佳,王曦

转录子论文-戈春城,汪羽,何叁纲,徐佳,王曦

导读:本文包含了转录子论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:口腔鳞状细胞癌,DNA损伤诱导转录子4,预后,生物标志物

转录子论文文献综述

戈春城,汪羽,何叁纲,徐佳,王曦[1](2019)在《DNA损伤诱导转录子4基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义》一文中研究指出目的:探讨DNA损伤诱导转录子4(DNA damage inducible transcript 4,DDIT4)基因在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达水平及其临床意义。方法:分别下载癌症和肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的OSCC队列数据(n=362)及基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中的GSE42743数据集(n=103)。比较OSCC组和正常对照组中DDIT4的表达水平,并分析DDIT4与OSCC患者临床特征和预后的关系。此外,利用生物信息学方法寻找DDIT4可能参与的生物学功能。结果:DDIT4在OSCC组中的表达水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.001)。在OSCC患者中,DDIT4的表达水平与肿瘤分期呈正相关(P<0.001),且OSCC高表达组的总生存率明显低于低表达组(Log-rank检验,P<0.01)。进一步行Cox回归分析,结果提示DDIT4高表达是OSCC患者预后不良的独立预测因素(P<0.05)。生物信息学分析表明,DDIT可能与低氧反应、糖酵解、雷帕霉素靶蛋白C1(mammalian target of rapamycin C1,mTORC1)信号通路、核因子-κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)介导的肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)信号通路、G2M检查点、p53信号通路等生物学功能有关。结论:DDIT4基因在OSCC患者中呈高表达状态,并且其表达水平与肿瘤分期有关。高表达DDIT4基因的OSCC患者预后不佳。因此,DDIT4可作为OSCC预后评估的一种标记物。(本文来源于《口腔医学研究》期刊2019年11期)

盛明辉,孙登群[2](2019)在《长链非编码RNA及肺腺癌转移相关转录子1在肿瘤学中研究进展》一文中研究指出非编码RNA为不能翻译成蛋白质的RNA,随着非编码RNA在肿瘤发生发展中生物学功能研究不断开展,肺腺癌转移相关转录子1(the metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)在肿瘤的相关研究也获得突破性进展,本文拟对其在肿瘤增殖、侵袭、转移等生物医学行为中的作用机制进行归纳总结。(本文来源于《安徽医学》期刊2019年07期)

潘小婷[3](2019)在《柑橘CitERF108转录子的克隆及抗旱功能研究》一文中研究指出柑橘是我国重要的水果类作物,经济价值高,种植面积大。由于我国柑橘主要种植在丘陵山区,因此常面临干旱胁迫,影响其产量和品质。为抵御逆境胁迫,植物进化出大量抗逆相关基因,其中转录因子尤为重要,如:NAC、ERF、CAMTA、MYB、MYC、bZIP等。ERF是植物特有的一类转录因子,广泛参与生长发育和抗逆胁迫,近年来在拟南芥、水稻和番茄等模式植物上关于ERF抗逆性研究较多,但在柑橘中却很少报道。可见,解析柑橘ERF成员在抗逆中的生物功能,对改良柑橘抗逆性具有重要理论意义。本试验从资阳香橙(Citrus junoscv.“Ziyang”)中克隆获得CitERF108基因及其启动子(Q108)序列。利用生物信息学对CitERF108的基因结构、亲缘关系、预测蛋白特性等进行了分析,同时对Q108上的顺式作用元件进行了预测。采用基因表达、亚细胞定位和遗传转化等手段,研究了CitERF108在抵抗干旱胁迫中的生物功能和响应机制。主要结果如下:(1)从资阳香橙中克隆获取柑橘CitERF108(ID:Ciclev10001138)全长,运用生物信息学对其预测蛋白分子量、等电点、不稳定系数、结构域等分析,结果表明该基因含1个内含子,可编码448个氨基酸。CitERF108属于亲水蛋白,含有ERF家族特有的AP2保守结构域,且AP2保守结构域内第14和第19位分别是丙氨酸和天冬氨酸,含有WLG、YRG、RAYD保守元件;聚类分析发现,CitERF108与拟南芥AtERF111亲缘关系较近,推测柑橘CitERF108可能参与了ABA依赖型应激反应,并能增强植株的抗旱、抗盐性;亚细胞定位表明:CitERF108位于细胞核中。(2)基因表达分析结果表明,CitERF108在根、叶、子叶、果皮和种子中均有表达,其中在种子中表达量最高,而在茎中几乎不表达;激素和非生物胁迫处理结果表明,在根中该基因受SA、ETH、6-BA、IAA、ABA、JA、GA_3以及非生物胁迫干旱和盐害的诱导;在叶中受ETH、JA诱导,而在SA处理条件下是呈现先上升再下降又上升的趋势,其中3h时表达量最高,6h、12h表达量急剧下降,24h时又上调;在6-BA、ABA、GA_3条件下是先上调后下调的表达模式,都是在24h时表达量下降,其中,在6-BA和ABA处理条件下都是在6h时达到峰值,GA_3处理条件下是在3h时达到最高点;在IAA处理条件下呈现出先下降后上升的趋势,在3h时表达量下降,6h时又开始逐步上升,在盐害处理条件下,3h、6h、12h时上调趋势不明显,24h时骤然上调达到最高点,在干旱处理条件下,3h时略有下降,6h时有所上升,12h达到峰值,上述结果表明,CitERF108在柑橘的生长发育和逆境响应中发挥着重要作用。(3)将CitERF108转化烟草,获得T0代转基因植株。转基因植株较野生型表现出更强的抗旱性。在干旱处理后,转基因株系叶片中脯氨酸含量高于野生型,其中,野生型株系脯氨酸含量为109.5μg,而转基因的叁个株系达到117.3μg、221.5μg和112.3μg;在转基因株系中NtSOD和NtCAT的表达量明显高于野生型,表明CitERF108调控了抗旱相关基因的表达;台盼蓝染色结果表明,干旱处理后的转基因植株叶片显色较野生型浅,表明野生型株系细胞膜的完整性较转基因差。上述结果表明,CitERF108主要通过提高转基因植株的脯氨酸含量和抗氧化能力来抵御干旱逆境。(4)对启动子顺式作用元件预测发现,Q108启动子序列中含有响应水杨酸、生长素、茉莉酸、脱落酸、乙烯以及温度和光等顺式作用元件;构建携带GUS基因的Q108表达载体,并转化烟草,通过GUS组织化学染色显示,6mmol/L的ACC溶液处理24h后,叶脉部位被染成蓝色,但蓝色较深的部位在叶缘;1mmol/L的ABA溶液处理24h后,叶脉部位被染成蓝色,且染色较为均匀;4℃冷害处理3h后,叶脉部位被染成蓝色;20%PEG6000处理24h后染色部位均在烟草腺体顶端,而无处理及对照处理均未被染成蓝色。(本文来源于《西南大学》期刊2019-05-20)

陈君霖,李海清,刘妍霖,李冰肖,张占会[4](2018)在《人SLC25A13基因内含子突变IVS6-11A>G导致转录子剪接异常》一文中研究指出目的:通过minigene剪接实验分析SLC25A13基因内含子突变IVS6-11A> G是否导致转录子剪接异常,并确定其剪接方式,进而明确其在Citrin缺陷病的致病性.方法:构建携带突变的目的片段外显子捕获载体,转染293T细胞后逆转录PCR扩增转录产物,测序并分析.结果:IVS6-11A> G突变导致SLC25A13基因内含子6的3'端10个碱基保留于转录子中,致蛋白翻译提前终止,Citrin蛋白功能丧失.结论:SLC25A13基因IVS6-11A> G突变为剪接突变,其剪接方式为可变3'剪接,该突变为Citrin缺陷病致病突变.(本文来源于《暨南大学学报(自然科学与医学版)》期刊2018年05期)

蔡兆阳,俞淑文[5](2018)在《免疫球蛋白样转录子3研究进展》一文中研究指出免疫球蛋白样转录子3(ILT3)是ILT超家族中的抑制性受体,特异性表达于单核细胞、巨噬细胞和树突状细胞等,通过免疫受体酪氨酸抑制基序(ITIM)传导抑制信号,发挥免疫抑制作用。该文主要综述ILT3对免疫细胞、肺癌、胃癌、卵巢癌、白血病、心脏和胰岛等器官移植以及自身免疫性疾病的影响,并探讨影响ILT3表达的因素,以期为ILT3进一步的研究与开发应用提供理论依据。(本文来源于《新医学》期刊2018年06期)

李景林,李正龙,黄立宁,冷开明,纪道林[6](2018)在《结肠癌相关转录子2的调控机制及与消化系统肿瘤关系的研究进展》一文中研究指出结肠癌相关转录子2(CCAT2)是新近发现的肿瘤相关长链非编码RNA(lncRNA)中的一个重要成员。异常表达于肿瘤组织细胞中的CCAT2在肿瘤病理过程中,尤其是消化道肿瘤发生发展中发挥着重要的调控作用,有望成为新型的肿瘤标志物和治疗靶点。阐明CCAT2的作用机制将为肿瘤的诊断和治疗提供可行的理论依据与潜在的干预靶点。本文就CCAT2在消化系统肿瘤中的研究现状作一综述。(本文来源于《中国医师杂志》期刊2018年05期)

朱丽萍,杨文浩,任婷婷,丛霞,李华涛[7](2016)在《脂多糖诱导奶牛乳腺上皮细胞中炎性因子和核转录子-κB的表达》一文中研究指出试验预探索脂多糖(LPS)刺激奶牛乳腺上皮细胞炎性因子产生时间、浓度以及其对NF-κB信号通路的激活情况。用酶消化法培养奶牛乳腺上皮细胞(b MEC);CCK-8法筛选LPS最佳刺激浓度(IR≤10%),并用其处理对数期生长的b MEC。ELISA试剂盒检测0~24 h不同处理时间细胞培养液上清中TNF-α和IL-1β表达变化,以确定炎症模型是否建立成功;用Western-Blot检测核转录因子NF-κB(p-p65和p65)及其抑制蛋白(p-IκBα和IκBα)的表达。结果显示,用酶消化法成功培养原代b MEC;CCK-8法筛选LPS的最佳致炎浓度为1μg/m L;LPS处理后3~24 h可极显着增加奶牛乳腺上皮细胞中TNF-α和IL-1β表达,并在处理后15 min极显着提高b MEC中p-p65和p-IκBα的表达。上述结果说明,LPS能够在3~24 h内有效诱导b MEC炎症模型的建立,并能在15 min时活化奶牛乳腺上皮细胞中的NF-κB信号通路。(本文来源于《中国兽医杂志》期刊2016年05期)

陆文昕,葛奕辰,肖丽英,李燕[8](2016)在《WD40编码的P53 RNA反义转录子基因和蛋白及其功能》一文中研究指出WD40编码的P53 RNA反义转录子(WRAP53)基因有1α、1β和1γ三个起始外显子,1α与P53的第一外显子反向互补,其表达产物能稳定P53 RNA水平,从而促进P53蛋白表达,最终参与调控肿瘤的生物学行为;1β转录翻译生成的WRAP53蛋白,涉及细胞程序性死亡、周期调控以及蛋白酶降解和RNA代谢等多个重要生化过程。WRAP53蛋白主要通过与端粒酶复合体等多种组分结合参与端粒酶卡侯体(CB)的形成、端粒酶全酶的组装定位、端粒酶的运输,指导运动神经元生存蛋白定位至CB等。WRAP53基因在肿瘤细胞系和临床肿瘤样本中普遍高表达,且表达越高,肿瘤的预后越差。沉默WRAP53基因,可明显抑制肿瘤细胞的生长和成瘤能力。先天性角化不良综合征与端粒长度的缩短有关,WRAP53基因表达降低最终会导致端粒的缩短。(本文来源于《国际口腔医学杂志》期刊2016年02期)

潘伟,冯晓萍,廖华[9](2016)在《免疫球蛋白样转录子4表达与卵巢癌淋巴结转移的关系》一文中研究指出目的探讨免疫球蛋白样转录子4(ILT4)表达与卵巢癌淋巴结转移的关系。方法采用免疫组化方法对60例卵巢癌病理组织中ILT4基因的表达进行检测,其中淋巴结转移组34例,无淋巴结转移组26例,比较两组患者肿瘤组织淋巴结中ILT4表达情况分析其与卵巢癌淋巴结转移、组织分化关系。结果淋巴结转移组中ILT4在肿瘤组织和淋巴结中的表达水平分别为(15.7±2.2)%和(17.2±3.7)%,显着低于无淋巴结转移组[分别为(31.3±6.8)%和(41.3±9.1)%],差异均有统计学意义(P<0.05)。淋巴结转移组中ILT4阳性表达率为32.4%,显着低于无淋巴结转移组(84.6%),差异有统计学意义(P<0.01)。ILT4在高、中、低分化肿瘤组织中的阳性表达率分别为100.0%、58.3%和11.8%,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 ILT4表达与卵巢癌淋巴结转移密切相关,可作为临床诊断与治疗卵巢癌的一项重要指标。(本文来源于《中国肿瘤临床与康复》期刊2016年01期)

薛露[10](2015)在《GR基因多态性及其转录子与儿童急性淋巴细胞白血病GC抵抗的相关性研究》一文中研究指出研究背景:糖皮质激素(GC)耐药是临床急性淋巴细胞白血病(ALL)治疗中常见的难题,也是导致治疗失败的主要原因之一。GC耐药机制复杂,目前为止尚未明确,GR作为GC的直接作用分子成为GC耐药的研究热点。GR基因编码区的单核苷酸多态性(SNP)位点在多种疾病中均与GC敏感性相关,同时体外实验研究表明在白血病细胞株中GR基因5'及3'端的转录子差异表达与GC敏感性相关。但针对GR基因非编码区SNP位点与儿童ALL糖皮质激素敏感性研究较少,另外在儿童ALL原代细胞中GR基因5'及3'端的转录子差异表达是否与GC敏感性相关。本研究试图探讨上述问题,本课题的完成将进一步揭示GC抵抗的分子机制,可能为GC的个体化治疗提供科学依据。研究一:GR基因多态性与儿童急性淋巴细胞白血病体内糖皮质激素反应的相关性研究目的:探讨GR基因单核苷酸多态性(包括编码区和非编码区)及其构成的单倍型与儿童急性淋巴细胞白血病体内糖皮质激素反应的相关性。方法:1.以63例儿童ALL患者和33例同龄健康儿童为研究对象。ALL患儿依据治疗最初一周强的松窗口试验结果分为反应良好组(PGR)及反应不良组(PPR)。采用病例对照研究的方法,研究GR基因多态性与中国汉族人群儿童ALL患者体内GC反应的相关性。本研究共选择5个SNP位点(rs7701443、rs10052957、rs41423247、rs6189/6190和rs6198)。2.争得家属及患儿本人同意,签署知情同意书,采集标本,初诊ALL儿童采集骨髓1ml,健康体检儿童标本收集体检剩余的血样(外周血200ul),进行基因组DNA提取,运用普通PCR及基因测序技术检测SNP位点的基因型。3.应用SPSS16.0软件进行统计分析,应用拟合优度χ2检验SNP位点基因型分布频率是否符合哈迪-温伯格遗传平衡定律,采用χ2检验法比较两组间等位基因频率、基因型频率的分布差异,并用Logistic回归做相关分析,应用SHEsis软件进行单倍型分析,检验水准α=0.05。结果:1.所研究的5个SNP位点在本研究人群中出现的频率GR基因非编码区的3个SNP位点(rs7701443,rs10052957,rs41423247)在本研究人群中均存在多态性,叁者在病例组MAF分别为0.404、0.103、0.246,对照组MAF分别为0.454、0.09、0.287,基因型分布频率符合哈-温平衡。其余两个位点在病例组及对照组中均未检测到多态性。2.多态性位点rs41423247、rs7701443及rs10052957与儿童ALL体内强的松反应的相关性位点rs41423247在PGR及PPR两组间等位基因频率的分布差异具统计学意义,odds ratio(OR)=9.58,95%可信区间(CI):1.23-74.21,P=0.01;两组间基因型频率的分布无明显差异(P>0.05);合并CG+GG基因型,与CC基因型相比,两组间分布差异具统计学意义,OR=9.778,95%CI:1.174-81.433,P=0.032。位点rs7701443在PGR及PPR两组间等位基因频率的分布差异具统计学意义,OR=3.12,95%CI:1.08-9,P=0.029;两组基因型频率分布差异无统计学意义。位点rs10052957等位基因及基因型频率在两组间的分布无明显差异(P>0.05)。3.单倍型(rs7701443、rs10052957、rs41423247叁个位点构成)与儿童ALL体内强的松反应的相关性由上述3个SNP位点构成的频率大于3%的单倍型共有4个,分别为CCC、TCG、TCC和TTG。单倍型CCC在PPR组的分布频率明显高于PGR组(P=0.013);而单倍型TCG在PGR组的分布频率明显高于PPR组(P=0.028)。结论:GR基因非编码区单核苷酸多态性位点(rs7701443、rs41423247)及其所构建的单倍型可能与中国东北地区汉族人群儿童急性淋巴细胞白血病体内强的松反应相关。研究二:GR基因转录子与儿童ALL原代细胞体外GC抵抗的相关性研究目的:探讨GR基因5'及3'端转录子的差异表达与儿童ALL原代细胞体外对GC抵抗的相关性。方法:1.以初次确诊为急性淋巴细胞白血病患者为研究对象,在争得家属及患儿本人同意及签署知情同意书的前提下,采集骨髓标本1ml用于后续研究。2.儿童ALL原代细胞进行体外培养(96孔板),体外给予prednisolone进行细胞毒试验,应用CCK-8法检测细胞增殖情况并计算IC50值,依据IC50值分为GC敏感组和耐药组(每组9个样本)。3.另一部分原代白血病细胞进行体外培养(24孔板),同样给予prednisolone干预,分别在干预的H0、H3、H8、H24四个时间点收集细胞,提取总RNA,逆转录成c DNA,然后应用实时定量PCR的方法对GR基因5'及3'端转录子(1A、1B、1C、GRα、GRβ)进行相对定量检测。4.应用SPSS16.0软件进行统计分析,采用均值±标准差形式表示数据,两组均数比较采用t检验,多组均数比较用方差分析,组间比较采用S-N-K法。结果:1.GC体外诱导ALL原代细胞GR-1A、1B、1C转录子表达变化与GC抵抗的相关性。体外给予prednisolone作用后,GC敏感组和GC耐药组外显子1A、1B、1C均表达上调,H24时间点上调水平最明显(P<0.001)。以H24时间点表达量为研究对象,GC敏感组与耐药组相比外显子1A、1B、1C的表达上调幅度无明显差异(P>0.05)。且GC敏感组及耐药组1A、1B、1C的差异表达无统计学意义(P>0.05)。2.GC体外诱导儿童ALL原代细胞GRα、GRβ转录子的表达变化与GC抵抗的相关性。体外给予prednisolone作用后,GC敏感组和GC耐药组GRα、GRβm RNA表达均上调,H24时间点上调水平最明显(P<0.001)。以H24时间点表达量为研究对象,GC敏感组GRαm RNA表达上调幅度明显高于GC耐药组(P=0.026),GRβm RNA的表达变化在两组间无明显差异(P>0.05)。且GC敏感组及耐药组GRα的表达明显高于GRβ(P<0.05)。结论:GC在体外可诱导儿童ALL原代细胞GR基因转录子1A、1B、1C、GRα、GRβm RNA表达上调,GC诱导GRα的上调幅度可能与GC敏感性相关。(本文来源于《吉林大学》期刊2015-10-01)

转录子论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

非编码RNA为不能翻译成蛋白质的RNA,随着非编码RNA在肿瘤发生发展中生物学功能研究不断开展,肺腺癌转移相关转录子1(the metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)在肿瘤的相关研究也获得突破性进展,本文拟对其在肿瘤增殖、侵袭、转移等生物医学行为中的作用机制进行归纳总结。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

转录子论文参考文献

[1].戈春城,汪羽,何叁纲,徐佳,王曦.DNA损伤诱导转录子4基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义[J].口腔医学研究.2019

[2].盛明辉,孙登群.长链非编码RNA及肺腺癌转移相关转录子1在肿瘤学中研究进展[J].安徽医学.2019

[3].潘小婷.柑橘CitERF108转录子的克隆及抗旱功能研究[D].西南大学.2019

[4].陈君霖,李海清,刘妍霖,李冰肖,张占会.人SLC25A13基因内含子突变IVS6-11A>G导致转录子剪接异常[J].暨南大学学报(自然科学与医学版).2018

[5].蔡兆阳,俞淑文.免疫球蛋白样转录子3研究进展[J].新医学.2018

[6].李景林,李正龙,黄立宁,冷开明,纪道林.结肠癌相关转录子2的调控机制及与消化系统肿瘤关系的研究进展[J].中国医师杂志.2018

[7].朱丽萍,杨文浩,任婷婷,丛霞,李华涛.脂多糖诱导奶牛乳腺上皮细胞中炎性因子和核转录子-κB的表达[J].中国兽医杂志.2016

[8].陆文昕,葛奕辰,肖丽英,李燕.WD40编码的P53RNA反义转录子基因和蛋白及其功能[J].国际口腔医学杂志.2016

[9].潘伟,冯晓萍,廖华.免疫球蛋白样转录子4表达与卵巢癌淋巴结转移的关系[J].中国肿瘤临床与康复.2016

[10].薛露.GR基因多态性及其转录子与儿童急性淋巴细胞白血病GC抵抗的相关性研究[D].吉林大学.2015

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