基于互模式熵的DNA序列相似性分析

基于互模式熵的DNA序列相似性分析

论文摘要

随着基因组计划的开展,DNA序列相似性分析成了现代生物学研究不可缺的一部分。本研究以H5N1、H1N1和H2N2等7种病毒的DNA序列作为研究对象,使用整数法将DNA序列编码成时间序列信息,计算时间序列之间的互模式熵(Mutual Mode Entropy,MME)。分析不同DNA序列的MME对序列相似性的表达准确性。实验表明通过整数表示方法的DNA序列的M M E能够定性地解释7种DNA序列之间的相似性关系。

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类型: 期刊论文

作者: 安相静,周小安,张静,沈冲冲

关键词: 相似性分析,序列,表示方法,互模式熵

来源: 智能计算机与应用 2019年06期

年度: 2019

分类: 信息科技,基础科学

专业: 数学,生物学

单位: 深圳大学信息工程学院

基金: 中央财政支持地方高校专项资金(8060000260205)

分类号: Q811.4;O211.61

页码: 52-54

总页数: 3

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基于互模式熵的DNA序列相似性分析
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