非小细胞肺癌患者外周血外泌体中差异表达的微小RNAs研究

非小细胞肺癌患者外周血外泌体中差异表达的微小RNAs研究

论文摘要

背景目前,临床上尚缺乏早期、有效诊断非小细胞肺癌(NSCLC)的指标,来源于癌组织的外泌体及其内部物质因可反映亲本细胞性质而有望成为早期诊断肿瘤的生物学标志物。目的通过高通量测序技术筛选NSCLC患者外周血外泌体中差异表达的微小RNAs (miRNAs)。方法收集2018年1月—2019年1月于深圳市人民医院就诊的4例NSCLC患者的外周血样品,其中肺腺癌(LUAD) 2例、肺鳞状细胞癌(LUSC) 2例;另收集同期4例健康志愿者的外周血样品作为对照。采用HiSeq 2500高通量测序仪进行miRNAs测序,采用DESeq2软件筛选差异表达的miRNAs;在癌症基因组图谱(TCCGA)中选取并比较39对LUAD组织及其配对癌旁正常组织、45对LUSC组织及其配对癌旁正常组织miRNA-9-3p测序结果。结果 (1)高通量测序结果显示,4例NSCLC患者外周血外泌体中平均检测到776种miRNAs,4例健康志愿者外周血外泌体中平均检测到238种miRNAs。(2) LUAD与LUSC患者外周血外泌体中差异表达最显著的10种miRNAs中有6种是重合的,分别为miRNA-1228-5p、miRNA-129-5p、miRNA-760、miRNA-885-3p、miRNA-9-3p、miRNA-95-3p。(3) LUSC-1、LUSC-2、LUAD-1及LUAD-2外周血外泌体中miRNA-9-3p表达量分别为71.51、15.61、13.99、16.11转录本数,4例健康志愿者外周血外泌体中miRNA-9-3p表达量均为0。TCCGA中LUAD组织和LUSC组织miRNA-9-3p表达量均高于其配对癌旁正常组织(P<0.01)。结论通过高通量测序技术发现miRNA-1228-5p、miRNA-129-5p、miRNA-760、miRNA-885-3p、miRNA-9-3p、miRNA-95-3p可能是NSCLC患者潜在的特异性miRNAs,其中miRNA-9-3p主要来源于NSCLC患者癌组织,这为后续通过外周血外泌体miRNAs测序而实现NSCLC的早期、无创诊断奠定了研究基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 一般材料
  •   1.2 主要试剂与仪器QIAzol
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 外泌体的提取和鉴定
  •     1.3.2 外泌体RNAs提取及miRNAs测序
  •     1.3.3 miRNAs差异表达分析
  •   1.4 统计学方法
  • 2 结果
  •   2.1 外周血外泌体中miRNAs测序结果
  •   2.2 外周血外泌体中差异基因分析结果
  •   2.3 筛选NSCLC患者特异性表达的miRNAs
  •   2.4 TCGA中LUAD组织和LUSC组织与其配对的癌旁正常组织中miRNA-9-3p的表达差异
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张婷,王凌伟

    关键词: 非小细胞肺癌,外泌体,微小,高通量测序,诊断

    来源: 实用心脑肺血管病杂志 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 肿瘤学

    单位: 广东省深圳市人民医院(南方科技大学第一附属医院)呼吸与危重症医学科

    基金: 深圳市科技研发资金基础研究项目(JCYJ20170307095633450)

    分类号: R734.2

    页码: 54-58

    总页数: 5

    文件大小: 1088K

    下载量: 177

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