导读:本文包含了免疫共沉淀论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:免疫,受体,蛋白,染色质,蛋白质,顺式,白介素。
免疫共沉淀论文文献综述
李建宁,李旺,杨玲玲,李雨涵,祁慧[1](2019)在《改进后的验证SREBP-1c下游调控基因的染色质免疫共沉淀方法》一文中研究指出目的以SREBP-1c下游调控基因为例,对HEK 293T细胞进行染色质免疫共沉淀(chromatin co-immunoprecipitation, CHIP)实验改进,获得更好实验结果。方法对常规CHIP改进方法包括细胞洗涤时添加蛋白酶抑制剂PMSF、免疫沉淀复合物采用3步洗涤法、解交联采用蛋白酶K 56℃水浴10 min、样品DNA采用基因组提取试剂盒回收。结果与常规CHIP相比,改进后的CHIP获得纯度更高的样品DNA。结论改进后方法更适用于细胞染色质免疫共沉淀,使细胞中基因表达调控研究中DNA提取与鉴定更高效。(本文来源于《广东医学》期刊2019年17期)
张平平,龚清秋[2](2019)在《免疫共沉淀与质谱联用检测拟南芥SIK1/Hippo互作蛋白》一文中研究指出Hippo通路是迄今为止发现的最重要的负调控动物器官大小的信号通路之一,其核心由两对级联的激酶-脚手架蛋白复合物构成.本实验室在前期工作中首次发现了拟南芥Hippo(Hpo)的同功能基因SIK1,并建立了与Hpo-Mats对应的SIK1-MOB1模块,发现其通过促进退出细胞分裂与细胞延展,参与植物侧生器官大小的调控.为进一步探究SIK1调控器官大小的分子机制,构建了SIK1-GFP转基因株系,用GFP-Trap免疫共沉淀方法捕获与SIK1内源互作的蛋白,并进行质谱分析,获得了SIK1的候选互作蛋白.研究结果将为后续建立完整的植物Hippo信号通路打下基础.(本文来源于《南开大学学报(自然科学版)》期刊2019年04期)
李瑞林,孟峻,刘儒[3](2019)在《免疫共沉淀法测定14-3-3ε蛋白与Cdc25B的相互作用》一文中研究指出目的研究14-3-3ε蛋白与Cdc25B的相互作用及其作用位点,为小鼠卵母细胞减数分裂G2期阻滞的机制研究提供实验依据。方法本实验依次构建pc DNA3.1-ZEO-HA-14-3-3ε、p EGFP-Cdc25B-WT、p EGFP-Cdc25B-Ser321A、p EGFPCdc25B-Ser321D表达载体,分别转染HEK293细胞,分为四组,分别为Cdc25B-vector+14-3-3ε组(空载体组),Cdc25B-WT+14-3-3ε组,Cdc25B-Ser321A+14-3-3ε组,Cdc25B-Ser321D+14-3-3ε组。通过免疫共沉淀法获得各组细胞裂解液及免疫沉淀物,用Western blotting检测Cdc25B-vector、Cdc25B-WT、Cdc25B-Ser321A、Cdc25B-Ser321D与14-3-3ε蛋白是否有共沉淀,如有共沉淀,说明两蛋白存在相互作用。结果本实验构建的4种表达载体经验证均构建成功。免疫共沉淀实验得出14-3-3ε能与野生型Cdc25B结合,当Cdc25B的S321突变成S321A时,这种结合不发生;而具有模拟磷酸化作用的Cdc25B-S321D也能与14-3-3ε结合。结论 Cdc25B S321是14-3-3ε蛋白与Cdc25B相互作用的特异性结合位点,此结合位点可能成为14-3-3ε蛋白与Cdc25B共同调控小鼠卵母细胞减数分裂进程及G2期阻滞的重要靶点,为后期哺乳动物生殖细胞的相关研究奠定实验基础。(本文来源于《山西医科大学学报》期刊2019年07期)
彭昂惠,李昭强,张燕,冯德龙,郝冰涛[4](2019)在《非交联染色质免疫共沉淀及其二代测序技术建库方法的优化》一文中研究指出目的优化非交联染色质免疫共沉淀及其二代测序(Native ChIP-seq)技术,简化操作步骤,得到高质量ChIP-seq数据。方法裂解细胞,MNase切割DNA释放核小体,用组蛋白修饰的特异性抗体将组蛋白与DNA的复合物进行免疫共沉淀,蛋白酶K消化后进行DNA纯化,染色质免疫共沉淀(ChIP)产物用Tn5转座酶建库与传统建库两种方法进行文库构建并测序。结果与传统建库方法相比,Tn5转座酶建库经过Tn5片段化后直接进行目的DNA的扩增,操作简单,更加省时,效率更高;IGV可视化信号分布峰图显示两种建库方式获得的富集峰基本相同;两种建库方法获得的测序数据中,Tn5转座酶建库比传统建库获得更多的富集峰;Tn5转座酶建库后结果显示重复性良好,信噪比达到50%以上。结论 Tn5转座酶建库能提高建库效率并得到更好的数据质量,适用于组蛋白修饰的检测,为表观遗传研究提供更好的技术选择。(本文来源于《南方医科大学学报》期刊2019年06期)
马迪,王威,许晓英,张秀静,王帅[5](2019)在《基于免疫共沉淀技术探讨涤痰通瘀方对急性脑出血大鼠应激性肝损害的调控作用》一文中研究指出目的研究急性脑出血大鼠应激性肝损害细胞因子信号转导抑制因子1(SOCS1)与白细胞介素-1受体相关激酶(IRAKs)的交叉对话及涤痰通瘀方对其的调控作用。方法将SD大鼠随机分成脑出血组、涤痰通瘀组、正常组。建立大鼠急性脑出血模型,采用免疫共沉淀法检测SOCS1与IRAK-1、2、4、M之间的相互作用,并观察造模后不同时相点各组大鼠肝组织病理染色结果。结果 SOCS1与IRAK-1、2、4、M可以相互作用,对急性脑出血大鼠肝损害起到一定的保护作用,同时涤痰通瘀方对SOCS1/IRAKs交叉对话有一定的调控作用。结论 SOCS1/IRAK-1、2、4、M相互作用,对LPS细胞内信号转导炎性级联反应起到抑制效应,在肝损害保护效应中发挥关键作用。经涤痰通瘀方干预后,可以有效改善肝组织病理学结构,是防治脑出血应激性肝损害的重要途径。(本文来源于《北京中医药大学学报》期刊2019年02期)
李明达[6](2018)在《免疫共沉淀联合质谱鉴定DAI相互作用蛋白》一文中研究指出细胞可以通过胞内的DNA或RNA感受器来识别以病毒为主的微生物病原体释放在胞质中的DNA或RNA,激活下游的干扰素相关信号通路以及NF-KB信号通路,从而促进干扰素及其它炎症因子的产生。经由免疫反应,病毒复制与扩散得到了有效阻滞。在一些情况下,也会施行激发细胞死亡的策略来匹敌入侵的病原体。DAI(ZBP1)是胞内DNA感受器之一,是一种可被干扰素诱导的蛋白。比来的工作表明,DAI也可以辨识某些病原体的RNA。在甲型流感病毒感染的情况下,DAI可以识别该病毒的RNA,并通过RIP3(RIPK3)介导细胞凋亡或坏死。而在不依赖RIP3的情况下,结合了病毒RNA的DAI也可以介导细胞凋亡的发生。然而,其详细的分子机制还没有明晰。为了阐明这一生物学过程的分子机制,我们通过免疫共沉淀联合质谱及生物信息学分析,在不表达RIP3的HEK293T细胞中鉴定出了一种全新的DAI结合蛋白,PKR(eif2ak2)。并且我们利用CO-IP证明了二者的结合。同时,我们的研究结果表明,在HEK293T细胞中过表达全长的DAI及其片段1-194和195-429均能引起细胞凋亡。过表达PKR会增进由DAI介导的细胞凋亡。另外,我们研究了 PKR及DAI对NF-κB转录活性的影响。发现单独过表达PKR或DAI均能不同程度地提高NF-κB的转录活性,这与之前的文献报道相符。令人惊奇的是,同时过表达PKR和DAI则会降低NF-κB的转录活性。其背后的分子机制还有待进一步研究。该项研究加深了我们对于病毒入侵情况下DAI介导的细胞凋亡信号通路的认识,为抗病毒相关的临床治疗提供了新的治疗靶点。(本文来源于《厦门大学》期刊2018-06-30)
冯艳霞,张志红,张少强[7](2018)在《基于染色质免疫共沉淀的高通量测序数据集的顺式调控模体发现算法》一文中研究指出针对新一代测序(NGS)的染色质免疫共沉淀的高通量测序(ChIP-Seq)数据集的模体发现问题,提出一种基于费舍尔(Fisher)精确检验的模体发现算法——Fisher Net。首先运用费舍尔精确检验计算所有k长短序的P值并筛选出模体的种子;然后,构建初始模体的位置赋权矩阵;最后,用位置赋权矩阵扫描所有k长短序形成最终模体。通过小鼠胚胎干细胞(m ESC)和红细胞、人类淋巴母细胞系的ChIP-Seq数据集以及ENCODE数据库的数据进行验证,结果表明所提算法精度和计算速度均高于其他常见的模体发现算法,并且能够发现超过80%的已知转录因子核心模体及其辅调控因子模体。该算法在保证高精度的同时可以应用到大规模测序数据集。(本文来源于《计算机应用》期刊2018年06期)
李朝华,胡明,钱冬萌,王斌[8](2018)在《免疫共沉淀联合质谱分析筛选与HCMV IE86相互作用蛋白》一文中研究指出目的利用免疫共沉淀联合质谱分析的方法,在人胚肺成纤维细胞系MRC-5细胞和胶质瘤细胞系U87MG细胞中,筛选与人巨细胞病毒(HCMV)即刻早期蛋白IE86相互作用的病毒蛋白和剪接相关蛋白。方法通过HCMV感染细胞使IE86蛋白在细胞中表达,采用免疫共沉淀的方法富集两种细胞系中的IE86结合蛋白,SDS-PAGE凝胶电泳分离免疫共沉淀复合物,从胶中切取IE86结合蛋白条带,胶内酶解后进行液相色谱-质谱联用分析及数据库检索,筛选与IE86相互作用蛋白。结果利用免疫共沉淀联合质谱分析,在MRC-5细胞中,共鉴定到与IE86相互作用的病毒编码的蛋白质17种,宿主细胞编码的剪接相关蛋白25种;在U87MG细胞中,共鉴定到病毒编码的蛋白质4种,宿主细胞编码的剪接相关蛋白8种。结论与胶质瘤细胞系U87MG相比,人胚肺成纤维细胞MRC-5中有更多种病毒蛋白及剪接相关蛋白与IE86有相互作用,协同参与IE86的剪接及病毒早、晚期蛋白的表达,这为进一步研究HCMV在不同细胞环境中的复制机制提供了基础。(本文来源于《青岛大学学报(医学版)》期刊2018年01期)
赵爽,姜棋予,孙慧伟,柴燕涛,李晓娟[9](2018)在《基于免疫共沉淀-液质联用技术的新型孕烷X受体配体检测方法的建立》一文中研究指出目的:建立基于免疫共沉淀-液质联用技术的新型孕烷X受体(PXR)配体检测方法。方法:在HEK293细胞中转染带有Flag标签的PXR表达载体,裂解细胞后用偶联Flag抗体的微珠(beads)结合并分离细胞中表达的FlagPXR蛋白;以PXR的已知最为公认的配体/激动剂利福平为模型药物,配制1μmol/L利福平溶液,与结合有Flag-PXR蛋白的微珠孵育形成微珠-蛋白-利福平复合物;将微珠从体系中分离出来,用蛋白印迹实验检测复合物中的蛋白质,用液相色谱-质谱联用技术(液质联用技术)检测复合物中的利福平。在此基础上对利福平的作用进行验证,在肝细胞癌细胞Hep G2中检测系列浓度梯度的利福平对PXR转录因子活性的影响。结果:用免疫共沉淀技术从HEK293细胞中分离鉴定得到Flag-PXR蛋白;用液质联用技术检测到蛋白与小分子复合物中的利福平;利福平能够剂量依赖地诱导PXR的转录因子活性。结论:建立了基于免疫共沉淀-液质联用技术的新型PXR配体检测方法。(本文来源于《生物技术通讯》期刊2018年03期)
张媛媛,黄冬梅,邓班,李丹静,张玉[10](2018)在《植物叶片染色质免疫共沉淀方法的优化》一文中研究指出以拟南芥成熟叶片为材料,探索3种不同型号超声破碎仪器的染色质免疫共沉淀(Ch IP)超声破碎条件.根据超声破碎结果推荐使用Covaris M220 Focused-ultrasonicator仪器,并将该仪器破碎条件设置为10%duty cycle、75 Watts Intensity Peak Incident power、200 cycle per Burst、7℃bath temperature、破碎时间12 min时,可获得约500 bp的DNA片段.同时,为检测不同H3K9ac抗体用量对染色质免疫沉淀效率的影响,通过半定量和实时荧光定量PCR检测确定初始量0.25 g的拟南芥叶片所需H3K9ac抗体的最适用量为3μL.此外,以不同衰老程度的水稻旗叶为材料,根据上述破碎条件,进一步优化超声破碎时间,同样可以获得合适的DNA片段,根据优化的样品与抗体用量比例,通过免疫沉淀可以获得适用于后期实时定量PCR(Ch IP-q PCR)和高通量测序(Ch IP-seq)分析的DNA样品.(本文来源于《福建农林大学学报(自然科学版)》期刊2018年03期)
免疫共沉淀论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
Hippo通路是迄今为止发现的最重要的负调控动物器官大小的信号通路之一,其核心由两对级联的激酶-脚手架蛋白复合物构成.本实验室在前期工作中首次发现了拟南芥Hippo(Hpo)的同功能基因SIK1,并建立了与Hpo-Mats对应的SIK1-MOB1模块,发现其通过促进退出细胞分裂与细胞延展,参与植物侧生器官大小的调控.为进一步探究SIK1调控器官大小的分子机制,构建了SIK1-GFP转基因株系,用GFP-Trap免疫共沉淀方法捕获与SIK1内源互作的蛋白,并进行质谱分析,获得了SIK1的候选互作蛋白.研究结果将为后续建立完整的植物Hippo信号通路打下基础.
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
免疫共沉淀论文参考文献
[1].李建宁,李旺,杨玲玲,李雨涵,祁慧.改进后的验证SREBP-1c下游调控基因的染色质免疫共沉淀方法[J].广东医学.2019
[2].张平平,龚清秋.免疫共沉淀与质谱联用检测拟南芥SIK1/Hippo互作蛋白[J].南开大学学报(自然科学版).2019
[3].李瑞林,孟峻,刘儒.免疫共沉淀法测定14-3-3ε蛋白与Cdc25B的相互作用[J].山西医科大学学报.2019
[4].彭昂惠,李昭强,张燕,冯德龙,郝冰涛.非交联染色质免疫共沉淀及其二代测序技术建库方法的优化[J].南方医科大学学报.2019
[5].马迪,王威,许晓英,张秀静,王帅.基于免疫共沉淀技术探讨涤痰通瘀方对急性脑出血大鼠应激性肝损害的调控作用[J].北京中医药大学学报.2019
[6].李明达.免疫共沉淀联合质谱鉴定DAI相互作用蛋白[D].厦门大学.2018
[7].冯艳霞,张志红,张少强.基于染色质免疫共沉淀的高通量测序数据集的顺式调控模体发现算法[J].计算机应用.2018
[8].李朝华,胡明,钱冬萌,王斌.免疫共沉淀联合质谱分析筛选与HCMVIE86相互作用蛋白[J].青岛大学学报(医学版).2018
[9].赵爽,姜棋予,孙慧伟,柴燕涛,李晓娟.基于免疫共沉淀-液质联用技术的新型孕烷X受体配体检测方法的建立[J].生物技术通讯.2018
[10].张媛媛,黄冬梅,邓班,李丹静,张玉.植物叶片染色质免疫共沉淀方法的优化[J].福建农林大学学报(自然科学版).2018