滇牡丹中3个类查尔酮合成酶基因的克隆与表达

滇牡丹中3个类查尔酮合成酶基因的克隆与表达

论文摘要

从开黄花的滇牡丹转录组中分离了3个CHS基因,利用生物信息学预测其基因功能,并比较不同花发育时期CHS基因的表达量。结果显示:3个CHS基因的cDNA全长分别为1 173、1 185、1 128 bp,依次命名为PdCHS1(GenBank登录号MK516264)、PdCHS2(GenBank登录号MK516265)和PdCHS3(GenBank登录号MK516266),分别编码390、394和375个氨基酸;这3个CHS基因编码的蛋白均为无信号肽的非分泌蛋白,均含查尔酮合成酶活性位点基序(G/A) FGPG。聚类结果显示,滇牡丹中的3个CHS蛋白归属于不同分支。基因表达结果显示,PdCHS1基因在花蕾期和花蕊中表达量较高,PdCHS2基因在末花期和初花期表达量较高,PdCHS3基因在末花期和花蕾期表达量较高。这3个CHS基因分别参与不同次生代谢产物的合成,推测PdCHS1参与柚皮素查尔酮,PdCHS2参与芪类化合物,PdCHS3参与聚酮类化合物的生物合成。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 器材与试剂
  •   1.3 总RNA提取和cDNA合成
  •   1.4 CHS基因的克隆
  •   1.5 滇牡丹CHS基因的生物信息学分析
  •   1.6 滇牡丹CHS基因的转录水平分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 滇牡丹的CHS基因序列
  •   2.2 滇牡丹CHS蛋白的生物信息学分析
  •   2.3 滇牡丹CHS基因的表达模式
  • 3 结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 原晓龙,李云琴,王毅

    关键词: 滇牡丹,查尔酮合成酶基因,生物信息学,次生代谢

    来源: 浙江农业学报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,园艺

    单位: 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

    基金: 国家自然科学基金(31860177),云南省应用基础研究青年项目(2016FD100),云南省林业科学院创新基金(QN2018-01)

    分类号: S685.11;Q943.2

    页码: 1478-1484

    总页数: 7

    文件大小: 914K

    下载量: 123

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