论文摘要
从大量基因中识别出致病基因是大数据下十分重要的高维统计问题。基因间网络结构的存在使得对于致病基因的识别从单个基因识别扩展到基因模块识别。从基因网络中挖掘出基因模块就是所谓的社区发现(或节点聚类)问题。绝大多数社区发现方法仅利用网络结构信息,而忽略节点本身的信息。Newman和Clauset于2016年提出了一个将二者有机结合的基于统计推断的社区发现方法(简称为NC方法)。本文以NC方法为案例,介绍统计方法在实际基因网络中的应用和取得的成果,并从统计学角度提出了改进措施。通过对NC方法的分析可以看出,对于以基因网络为代表的非结构化数据,统计思想和原理在数据分析中仍然处于核心地位,但相应的统计方法则需要针对数据的特点及关心的问题进行相应的调整和优化。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 孙怡帆,吴梦云,史兴杰
关键词: 基因网络,社区发现,元数据
来源: 统计研究 2019年03期
年度: 2019
分类: 社会科学Ⅱ辑,基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,生物医学工程
单位: 中国人民大学统计学院,上海财经大学统计与管理学院,南京财经大学经济学院统计系
基金: 中国人民大学科学研究基金(中央高校基本科研业务费专项资金资助)项目“生物医学大学的统计方法基础研究”(15XNI011)的阶段性成果
分类号: R318
DOI: 10.19343/j.cnki.11-1302/c.2019.03.011
页码: 124-128
总页数: 5
文件大小: 109K
下载量: 399
相关论文文献
- [1].肥胖可使基因网络发生变化而致病[J]. 中华中医药学刊 2008(05)
- [2].摄食低钠盐对三高病人局部基因网络模式的共同影响[J]. 现代食品科技 2009(01)
- [3].植物功能基因网络及其应用[J]. 林业科学研究 2018(01)
- [4].水稻产量基因网络的初步研究[J]. 海南师范大学学报(自然科学版) 2019(02)
- [5].基于惩罚函数的基因网络构建综述[J]. 生物技术世界 2012(12)
- [6].基因网络中基因关系图谱的构建及其应用(英文)[J]. 生物信息学 2008(02)
- [7].细菌能预见未来[J]. 生物工程学报 2009(07)
- [8].果蝇体极性基因网络的稳定性分析[J]. 中国科学:物理学 力学 天文学 2011(04)
- [9].基于文本的人类疾病基因网络的重构和分析[J]. 黑龙江科技信息 2011(27)
- [10].核心基因的重要性[J]. 国际精神病学杂志 2018(02)
- [11].利用生物学网络识别表型相关基因的统计方法研究[J]. 黑龙江大学自然科学学报 2016(02)
- [12].周期信号对受扰人工合成基因网络的影响[J]. 中国科学:化学 2011(07)
- [13].基因网络相继故障机理分析(英文)[J]. 生物信息学 2013(01)
- [14].一种挖掘关键基因的新方法及其应用(英文)[J]. 生物信息学 2012(02)
- [15].利用决策森林构建复杂疾病驱动的基因网络[J]. 中国生物医学工程学报 2009(02)
- [16].乳腺癌局部基因网络模型及其与营养代谢模块的耦联[J]. 现代食品科技 2009(10)
- [17].基于文本挖掘的基因网络分析[J]. 电子技术与软件工程 2017(20)
- [18].利用eQTL构建基因-基因网络挖掘类风湿性关节炎风险基因[J]. 现代生物医学进展 2014(08)
- [19].拟南芥APETALA1基因在花发育中的网络调控及其生物学功能[J]. 中国农学通报 2011(08)
- [20].基于熵值的冠心病基因网络模块划分方法评价与模块功能相似度分析[J]. 中国药理学与毒理学杂志 2018(05)
- [21].一个合成基因网络的电路模型构建[J]. 天津科技大学学报 2011(04)
- [22].基于基因网络的产品形态设计研究[J]. 浙江工业大学学报 2016(05)
- [23].Tup1突变对转录抑制局部网络中基因表达的非线性影响[J]. 生物信息学 2009(04)
- [24].生物信息学中途径研究进展[J]. 生物技术通报 2008(01)
- [25].个体化营养产品研制相关的基因网络技术平台研究[J]. 现代食品科技 2010(02)
- [26].基于偏最小二乘回归的基因网络数学建模[J]. 系统仿真学报 2009(04)
- [27].基于KEGG通路和基因网络对肝纤维化靶点基因的筛选[J]. 辽宁中医杂志 2019(07)
- [28].基于全基因组关联分析研究的2型糖尿病局部基因网络构建初探[J]. 中国慢性病预防与控制 2016(02)
- [29].低能离子束辐照诱导的水稻差异表达基因的调控网络研究[J]. 郑州大学学报(理学版) 2014(03)
- [30].乳腺癌转移相关microRNA-200c调控的基因网络分析[J]. 肿瘤 2013(02)