论文摘要
多种雄性生殖性疾病和精子发生的过程息息相关,探究精子发生的分子调控机理具有重要的研究价值。长链非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,其表达在不同的生长发育过程以及组织、细胞类型中具有时空特异性。已有研究表明,一些lncRNA在睾丸组织中特异性表达,预示其在精子发生过程中可能具有潜在的调控功能。然而,其中只有小部分lncRNA有功能上或者机制上的研究,尚缺乏针对其在精子发生过程中的系统性分析。近年来有研究发现,lncRNA可作为竞争性内源RNA（ceRNA）参与基因的表达调控。其通过与miRNA结合,从而充当miRNA的分子“海绵”,消除miRNA对相应靶基因的抑制和降解效果,在细胞发育、分化和疾病等生物学现象中扮演重要的调控角色。然而,精子发生过程中特异性表达的lncRNA是否会作为ceRNA发挥调控作用尚不明确。因此,本研究基于小鼠精子发生过程中的RNA-seq数据,构建小鼠精子发生过程中的lncRNA作为ceRNA的调控网络,探索ceRNA网络和精子发生转录调控的关系。1.基于RNA-seq数据分析小鼠精子发生过程中基因的动态表达基于GEO数据库中获取的公开数据,我们通过分析发育过程中的动态表达变化,分别获得了3478个和851个在精原细胞和精母细胞中差异表达的mRNA和lncRNA,941个和489个在精母细胞和圆形精子中有差异表达mRNA和lncRNA。功能富集分析显示,阶段特异mRNA显著富集在精子发生相关的通路中。2.小鼠精子发生过程相关ceRNA网络的构建整合miRDB和DIANA-LncBase等数据库提供的miRNA-靶基因调控关系,结合精子发生过程中的表达数据,本研究构建了精子发生过程中的lncRNA作为ceRNA的调控网络。最终,本研究挖掘到了1343对精子发生过程阶段特异的ceRNA关系对,包括324个lncRNA和430个mRNA。功能富集分析结果显示,ceRNA网络中的mRNA富集在精子发生相关的通路中。3.小鼠精子发生过程中ceRNA网络的分析本研究对ceRNA网络中的mRNA进行了聚类分析,结果表明,不同的簇呈现不同的表达模式,并与不同的生物学功能相关。结合相关的文献报道和数据库发现,网络中的一部分基因是已被证实的与精子发生相关的转录因子。这说明精子发生过程中的ceRNA调控和转录因子调控网络密切相关,它们协同地发挥作用。最后,本研究从其中筛选了一些置信度更高、更敏感的ceRNA关系对,供下游实验验证参考。本研究通过构建精子发生过程中lncRNA作为ceRNA的调控网络,探索了lncRNA在精子发生中的潜在调节作用,扩展了对lncRNA调控方式的认识,为进一步地探索精子发生的分子调控机理提供了初步的理论基础。
论文目录
文章来源
类型: 硕士论文
作者: 章鹏
导师: 廖明帜
关键词: 精子发生,内源竞争性,长链非编码,调控网络
来源: 西北农林科技大学
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学,生物学
单位: 西北农林科技大学
基金: 国家自然科学基金(NO. 61772431)
分类号: Q78;Q132.1
总页数: 59
文件大小: 8402K
下载量: 155
相关论文文献
- [1].表没食子儿茶素没食子酸酯对小鼠精子畸形的影响[J]. 中华男科学杂志 2014(12)
- [2].丙酸睾酮注射液对小鼠精子畸形的影响[J]. 齐鲁药事 2012(10)
- [3].间歇低氧对小鼠精子生成数量及活力的影响[J]. 中国继续医学教育 2015(18)
- [4].可乐对小鼠精子畸形及睾丸酶的影响[J]. 吉林医药学院学报 2015(05)
- [5].β高效氯氰菊酯对雄性小鼠精子运动的影响[J]. 中国民康医学 2014(12)
- [6].连翘对小鼠精子畸形率的影响[J]. 西安文理学院学报(自然科学版) 2012(01)
- [7].芹菜对小鼠精子运动能力的急性影响及可复性观察[J]. 中国实用医药 2010(08)
- [8].外来化合物氰戊菊酯(杀虫剂)、苯对小鼠精子畸形率影响的观察和研究[J]. 昆明医学院学报 2009(07)
- [9].高脂饮食诱导的肥胖对小鼠精子线粒体及活动力损伤的机制研究[J]. 中国男科学杂志 2019(03)
- [10].电磁辐射对雄性小鼠精子质量的影响[J]. 黑龙江畜牧兽医 2015(16)
- [11].可食用黄酮芹菜素对小鼠精子质量亚急性影响的研究[J]. 中国现代医学杂志 2014(11)
- [12].芹菜对小鼠精子运动参数的亚急性影响及可复性观察[J]. 中国民族民间医药 2010(03)
- [13].pcDNA3.1-preS1-GFP重组质粒构建及其小鼠精子表达[J]. 青岛大学医学院学报 2010(05)
- [14].萘乙酸对小鼠精子的影响作用[J]. 中国误诊学杂志 2010(25)
- [15].苯甲酸钠对小鼠精子畸形率的影响[J]. 当代畜牧 2013(21)
- [16].小鼠精子顶体发生的形态学研究[J]. 解放军医学杂志 2012(03)
- [17].无液氮冷冻小鼠精子的研究[J]. 西北农业学报 2012(06)
- [18].可乐对小鼠精子质量影响[J]. 中国公共卫生 2008(01)
- [19].芸豆植物凝集素对昆明白小鼠精子畸形的影响[J]. 生殖医学杂志 2010(03)
- [20].双补汤对环磷酰胺诱导弱精子症小鼠精子运动障碍的影响及作用机制研究[J]. 中国中医基础医学杂志 2015(03)
- [21].氟化钠对雄性小鼠精子畸形的影响[J]. 广东微量元素科学 2012(03)
- [22].氧化型染发剂对小鼠精子畸形和骨髓细胞微核的影响[J]. 新乡医学院学报 2010(06)
- [23].补肾中药复方对小鼠精子受精能力影响的研究[J]. 四川大学学报(医学版) 2011(06)
- [24].小鼠精子激活力减弱模型制备技术的初步研究[J]. 中山大学学报(医学科学版) 2013(04)
- [25].氯化镧对雄性小鼠精子质量及睾丸酶活力的影响[J]. 四川动物 2012(03)
- [26].低剂量三聚氰胺对小鼠精子质量影响的研究[J]. 四川动物 2010(03)
- [27].芹菜汁对小鼠精子运动参数的影响[J]. 毒理学杂志 2009(05)
- [28].钙调蛋白抑制剂对小鼠精子获能影响的研究[J]. 中华男科学杂志 2008(03)
- [29].夹竹桃麻素对双酚a诱导的成年雄性小鼠精子损伤作用的实验研究[J]. 现代生物医学进展 2016(12)
- [30].盐酸优克那非对雄性小鼠精子质量的影响[J]. 毒理学杂志 2016(02)