翅碱蓬响应高盐胁迫的分子机制研究

翅碱蓬响应高盐胁迫的分子机制研究

论文摘要

为研究翅碱蓬Suaeda heteroptera响应高盐胁迫的分子机制,试验将翅碱蓬植株在高盐胁迫(856 mmol/L NaCl)和无盐(0 mmol/L NaCl)条件下处理2 h后,对植株分别进行全转录组测序。结果表明:通过RNA-seq分析共获得转录本147 176个,拼接后获得单基因(Unigene)84 545个;比较转录组学分析显示,与无胁迫组(对照)相比,高盐胁迫下翅碱蓬共检出144个差异表达基因,其中发生表达上调的有55个,发生表达下调的有89个;GO富集分析显示,差异表达基因主要分布在次生代谢、信号转导、光合作用电子传递等途径;KEGG富集分析显示,差异表达基因涉及的代谢通路有14个;对差异表达基因发生富集的5个主要代谢通路(光合作用、蔗糖与海藻糖代谢、植物激素信号转导、苯丙基类生物合成、半胱氨酸与甲硫氨酸代谢)进行了详细阐述,从分子水平探讨了翅碱蓬响应高盐胁迫的机制。本研究结果可为更深入研究翅碱蓬耐盐分子机制、挖掘耐盐关键基因提供数据资料。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 翅碱蓬植株幼苗的水培
  •     1.2.2 盐胁迫浓度的筛选及处理
  •     1.2.3 高盐胁迫试验
  •     1.2.4 RNA提取及cDNA合成
  •     1.2.5 测序文库制备及转录组测序
  •     1.2.6 生物信息学分析
  •     1.2.7 实时定量PCR
  • 2 结果与分析
  •   2.1 盐胁迫浓度筛选结果
  •   2.2 测序结果分析
  •   2.3 差异表达基因
  •   2.4 差异表达基因的GO功能显著性富集分析
  •   2.5 差异表达基因的代谢通路富集分析
  •   2.6 实时定量PCR验证比较转录组数据
  •   2.7 5个主要通路中差异表达基因编码的蛋白
  • 3 讨论
  •   3.1 光合作用途径
  •   3.2 淀粉与蔗糖代谢途径
  •   3.3 植物激素信号转导途径
  •   3.4 苯丙基类生物合成途径
  •   3.5 半胱氨酸与甲硫氨酸途径
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 谢欠影,曹晟阳,赵晨阳,伊凯,戴峰,秦会发,秦玉雪,方蕾

    关键词: 翅碱蓬,高盐胁迫,比较转录组学,分子机制,代谢通路

    来源: 大连海洋大学学报 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 大连海洋大学海洋科技与环境学院

    基金: 国家自然科学基金资助项目(41606133),辽宁省高等学校科学研究项目(QL201706),国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室2016年度开放基金资助项目(201601)

    分类号: Q945.78

    DOI: 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019.02.002

    页码: 160-167

    总页数: 8

    文件大小: 1352K

    下载量: 255

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