导读:本文包含了蛋白结构分析论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:胶原叁股螺旋重迭蛋白1,肿瘤,理化性质,分子结构
蛋白结构分析论文文献综述
王萱,田九博,张丽娜,马培元,于保锋[1]（2019）在《胶原叁股螺旋重迭蛋白1的理化性质和分子结构分析》一文中研究指出目的分析胶原叁股螺旋重迭蛋白1(collagen triple helix repeat containing 1,CTHRC1)的理化性质和分子结构,为进一步研究CTHRC1的分子功能及促癌机制提供参考。方法利用NCBI、ExPASy、SignalP、TMHMM、PSORTⅡ、SOPMA、Conserved Domain、SWISS-MODEL、STRING等软件对CTHRC1蛋白进行系统分析。结果 CTHRC1为一种碱性不稳定的亲水性蛋白,有信号肽,无跨膜区,定位于细胞外的可能性最大;CTHRC1二级结构的主要形式是无规卷曲,含有1个Collagen结构域,属于Collagen超家族;经GO和KEGG通路分析,CTHRC1相互作用蛋白主要包括FZD、DVL及ROR2。结论 CTHRC1可能参与Wnt、Hippo等信号通路,为进一步研究其分子作用机制提供了参考。(本文来源于《中国生物制品学杂志》期刊2019年11期）
成伟伟,陈伯祥,杨明,赵子惠,常攀峰[2]（2019）在《羊传染性脓疱病毒OVIFNR蛋白结构分析与B细胞表位预测》一文中研究指出本研究应用生物信息学方法,预测分析羊传染性脓疱病毒(ORFV)的OVIFNR蛋白结构与B细胞抗原表位。从羊传染性脓疱病羊嘴唇结痂中扩增出ORFV的OVIFNR基因序列并进行测序鉴定,上传至NCBI;应用生物信息学软件,将扩增所得的OVIFNR基因序列和GenBank公布的参考序列,在核苷酸和氨基酸水平上进行同源性分析和遗传进化树构建,并对OVIFNR蛋白分子的理化特性、跨膜区、信号肽、亲疏水性、二级结构、叁级结构和B细胞抗原表位进行预测分析。结果显示:所扩增序列与Hoping和Nantou毒株的OVIFNR基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为99.6%和100%;通过遗传进化树发现,所扩增序列的毒株与Hoping、ShanX、Nantou毒株处于同一分支;OVIFNR蛋白的理论等电点为4.83,半衰期为30 h,脂肪族指数77.92,总平均疏水性为–0.181,无跨膜区和信号肽,不属于跨膜蛋白;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占68.64%、7.56%、15.13%、9.18%,筛选出了8个优势B细胞表位;OVIFNR蛋白为亲水性蛋白,含有较多B细胞表位,具有抗原性,可以作为ORFV检测的新靶点。本研究为OVIFNR蛋白的功能研究和ORFV检测方法的建立提供了理论依据。(本文来源于《中国动物检疫》期刊2019年11期）
刘晓柱,李银凤[3]（2019）在《拟南芥AtSWEET4基因启动子序列、编码蛋白结构分析及其在病原菌胁迫下表达特性检测》一文中研究指出【目的】分析拟南芥糖运输载体蛋白基因(AtSWEET4)启动子序列及其编码蛋白的结构,并检测病原菌胁迫下AtSWEET4基因的表达特性,为研究AtSWEET4蛋白在拟南芥生长发育和生物胁迫中的作用机制提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析AtSWEET4基因启动子序列及其编码蛋白的结构,并采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)和β-葡萄糖苷酸酶(GUS)组织染色法检测人工接种菜豆晕疫病菌(Pseudomonas syringae pv. phaseolicola,Psp)NPS3121和丁香假单胞菌番茄致病变种(Pseudomonas syringae pathovar tomato,Pst)DC3000后AtSWEET4基因的表达情况。【结果】AtSWEET4蛋白由251个氨基酸组成,分子量为27.8 kD,分子式为C1300H2038N304O346S11,理论等电点(pI)为8.71,脂肪氨基酸指数为118.76,不稳定指数为38.72,平均亲水性指数为0.629,为稳定的亲水蛋白,且含有7个跨膜结构域,无信号肽,为非分泌型蛋白。AtSWEET4蛋白与芥属的亚麻荠和荠菜SWEET4蛋白亲缘关系最近,其次是十字花科的甘蓝和萝卜SWEET4蛋白,与禾本科的二穗短柄草SWEET4蛋白亲缘关系最远。AtSWEET4基因启动子序列中包含核心元件TATA-box、增强子元件CAAT-box、调控植物生长发育相关元件、激素响应相关元件、非生物胁迫响应相关元件和生物胁迫响应相关元件。Psp NPS3121和Pst DC3000均可诱导AtSWEET4基因表达,但表达模式不同:接种Psp NPS3121后6和12 h的AtSWEET4基因表达明显上调,但至接种后24 h又迅速下降;接种Pst DC3000后AtSWEET4基因表达量逐渐增加。【结论】AtSWEET4基因的启动子序列特征及其编码蛋白结构与其参与植物免疫反应密切相关。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年09期）
姜伊悦,张小勇,崔泰花,李官浩,崔福顺[4]（2019）在《元蘑蛋白的超声辅助提取及结构分析》一文中研究指出以长白山元蘑子实体为原料,构建超声辅助提取元蘑蛋白质的最佳工艺,并对蛋白质的结构进行初步分析。以元蘑蛋白质提取率为指标,在单因素试验基础上利用响应面对提取条件进行优化,并分析比较不同提取方法对元蘑蛋白氨基酸组成、红外光谱以及蛋白微观结构的影响。结果表明,元蘑蛋白超声辅助提取最佳条件为料液比1:85(g/mL)、超声功率350W、提取时间60 min、NaOH碱液浓度0.14 mol/L,提取率达26.83%;超声碱提蛋白的氨基酸含量高于常规碱提以及常规水提方法;不同提取方法元蘑蛋白的空间结构、表面和粒度大小均有一定差异。元蘑蛋白提取的方法对含量组成及结构均有影响,超声辅助碱提法最有利于元蘑蛋白的提取。(本文来源于《食品科技》期刊2019年08期）
吴长玲,和铭钰,韩瑞,史志玲,王中江[5]（2019）在《大豆蛋白-磷脂酰胆碱纳米乳液的显微观测及界面结构分析》一文中研究指出超声及高压均质制备的大豆蛋白-磷脂酰胆碱纳米乳液球状形态,大豆蛋白完全吸附于纳米乳液的界面,呈现核壳状结构。在大豆蛋白-磷脂酰胆碱纳米乳液形成中,界面吸附重排作用下,大豆蛋白结构趋向于α-螺旋及无规卷曲的二级结构组成。超声制备纳米乳液的界面蛋白疏水性基团暴露程度高于高压均质制备的。在高压均质制备纳米乳液的界面,磷脂酰胆碱与大豆蛋白表现出较强的疏水交互作用。拉曼显微观测证实大豆蛋白-磷脂酰胆碱在纳米乳液界面均匀分布,更多的大豆蛋白在超声纳米乳液乳滴界面分布。(本文来源于《中国食品学报》期刊2019年08期）
裴建新,唐驰,秦剑秋,潘海西,栾苑[6]（2019）在《南宁市HIV-1/AIDS人群治疗前pol区遗传特性及蛋白结构分析》一文中研究指出为探讨南宁市某县艾滋病病毒1型(HIV-1)感染人群中治疗前pol区遗传特性及蛋白结构变化情况,本研究通过RT-PCR扩增pol区部分序列并进行测序,将序列同源比对构建系统进化树;分型确定毒株亚型和斯坦福大学HIV耐药性数据库比对,分析耐药相关位点;SWISS-MODEL蛋白质同源数据库进行建模分析氨基酸的突变对蛋白质结构和功能的影响。本研究在90份HIV-1标本中获得46个pol区有效序列,共发现4种亚型,其中CRF01_AE占76.08%(35/46)、CRF08_BC占15.22%(7/46)、CRF07_BC占(3/46) 6.52%、CRF59_01B1占2.17%(1/46);46个序列中有4例(8.69%)出现耐药突变位点,没有针对核苷酸反转录酶抑制剂(NRTI)的耐药突变;针对蛋白酶类抑制剂(PIs) 1例,PR蛋白酶的柔性部位I47V位点发生突变,β折叠结构的I84V位点发生突变,都是异亮氨酸突变为缬氨酸;针对非核苷酸反转录酶抑制剂(NNRTI)有3例,2例位于活性中心的Y181C位点由酪氨酸突变为半胱氨酸,1例位于转角处的E138G位点由谷氨酸突变为甘氨酸。研究表明,南宁市某县HIV-1病毒CRF01_AE重组亚型比例最大,未经抗病毒治疗HIV1感染者中已经出现pol区耐药突变株,突变位点主要位于活性中心及柔性部位,传播水平已经处于中等流行状态。深入分析蛋白质与抑制剂相互作用机制,有助于为艾滋病抗病毒及耐药性监测方案提供科学依据。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年07期）
徐建林[7]（2019）在《我国羊巴贝斯虫AMA1和RON2蛋白基因结构分析及检测方法的建立》一文中研究指出巴贝斯虫感染人和动物引起巴贝斯虫病,其主要通过硬蜱传播。患病动物主要表现发热、贫血、黄疸和血红蛋白尿等症状,甚至会导致器官衰竭引起死亡。该病呈全国性流行,对我国养殖业造成巨大的经济损失。本研究以在我国广泛分布的两种羊巴贝斯虫为研究对象,通过PCR扩增,获得两种6株羊巴贝斯虫“运动连接环”(Moving Junction,MJ)主要组件蛋白AMA1和RON2的基因全长序列,分析其结构特征;并以其为靶标分子,研究我国羊巴贝斯虫的分类地位;最后以AMA1为靶基因或抗原,建立检测两种羊巴贝斯虫的分子生物学和血清学诊断方法。为开展我国羊巴贝斯虫病的流行病学调查提供了检测技术,同时为深入研究我国羊巴贝斯虫的分类关系和MJ对巴贝斯虫入侵宿主细胞的作用提供基础数据。主要研究内容和结果如下:1.从我国6株羊巴贝斯虫基因组DNA和cDNA中成功扩增获得RON2和AMA1基因全长序列。生物信息学分析结果显示,羊巴贝斯虫RON2和AMA1基因均没有内含子。RON2编码的蛋白有一个信号肽和叁个跨膜结构域;羊巴贝斯虫AMA1与其他顶复门原虫一样,是典型I型跨膜蛋白,由3个区域组成:胞外区、跨膜区和胞质区。两个基因核苷酸序列和氨基酸序列比对及MP系统发生树构建结果显示:我国羊巴贝斯虫有两个种——巴贝斯虫未定种和莫氏巴贝斯虫。莫氏巴贝斯虫又被分为两小枝Bm——LT/BmTZ和BmNX/BmHB。2.在巴贝斯虫未定种和莫氏巴贝斯虫AMA1基因序列的保守区、种间高变区分别设计两个种的通用引物和种间特异引物,通过反应条件的筛选,建立可同时鉴别检测两种羊巴贝斯虫的套式-多重PCR方法。在优化好的反应条件下,在PCR仪中一步法两个过程扩增,可得到两个种大小不同的目的片段,该方法最低可检测到5 pg/μL的羊巴贝斯虫基因组DNA。且与尤氏泰勒虫、吕氏泰勒虫、绵羊无浆体、边缘无浆体、双芽巴贝斯虫、牛巴贝斯虫、大巴贝斯虫、环形泰勒虫和中华泰勒虫的基因组均无交叉反应。应用建立的套式-多重PCR方法对采自甘肃武威的232份绵羊血液样本进行检测。结果显示,羊巴贝斯虫未定种的阳性率为1.72%,莫氏巴贝斯虫的阳性率为6.03%。3.分别从羊巴贝斯虫未定种新疆株和莫氏巴贝斯虫临潭株cDNA中成功扩增AMA1截短目的基因片段,构建原核表达载体pET-XJ-AMA1和pET-LT-AMA1,转化、诱导表达、纯化和鉴定该重组蛋白,并进行反应原性分析。ELISA试验结果表明rBspAMA1和rBmAMA1都具有良好的反应性,两个蛋白均能与感染我国羊的两个种的6株巴贝斯虫阳性血清反应,而与吕氏泰勒虫、尤氏泰勒虫及绵羊无浆体阳性血清均不反应。因此选择rBspAMA1为靶标抗原,建立羊巴贝斯虫的通用间接ELISA方法。对实验室感染羊巴贝斯虫后收集的血清进行抗体动态检测,7天均可以检测到特异性抗体的产生。羊巴贝斯虫未定感染后28～42天抗体达到最高水平,然后开始逐渐下降,到170天时基本降到感染前水平;莫氏巴贝斯虫感染后12～28天抗体达到最高水平,然后逐渐下降,到230天时基本降到感染前水平。对采自甘肃省古浪、天祝、凉州和景泰的554份羊血清样品进行检测,抗体平均阳性率为51.98%。(本文来源于《中国农业科学院》期刊2019-05-01）
施圆圆,张声祥,赵德蕊,王晨凯,马克龙[8]（2019）在《异叶天南星苯丙氨酸解氨酶基因的克隆与蛋白结构分析》一文中研究指出以异叶天南星(Arisaema heterophyllum Blume)为材料,采用逆转录PCR(RT-PCR)法扩增其苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase,PAL)基因Ah PAL,获得该基因的开放读码框(ORF),并通过系统的生物信息学软件分析Ah PAL的结构和理化性质。结果显示,Ah PAL的ORF全长为2184 bp,编码727个氨基酸;Ah PAL与郁金香(Tulipa fosteriana W. Irving) PAL的亲缘关系最近,序列相似性达88%。空间结构模型分析结果显示,Ah PAL为同型四聚体,每个单体由3个结构域组成,其中MIO结构域含有PAL酶家族的保守序列和Ala-Ser-Gly叁肽活性中心,是Ah PAL酶活性的决定性结构域。利用荧光定量PCR方法检测3个Ah PAL Unigene在根、块茎和叶中的表达情况,发现它们在根中表达量均最高,而在叶和块茎中表达较低。(本文来源于《植物科学学报》期刊2019年02期）
方磊,李国明,贾福怀,陆路,曹珂路[9]（2019）在《牡蛎过敏原Crag1蛋白的结构分析》一文中研究指出通过生物信息学方法,分析牡蛎过敏原Crag1蛋白的理化性质和各级结构。结果显示,牡蛎Crag1蛋白由284个氨基酸组成,其酸性氨基酸和亲水性氨基酸较多; Crag1蛋白氨基酸序列与角蝾螺、九孔螺原肌球蛋白(Tropomyosin, Tm)的同源性较高,亲缘关系较近,亲疏水性区域相似; DNA Star分析可知α-螺旋是Crag1蛋白二级结构的主要部分; Swiss-Model建模的结果表明,模拟形成的Crag1叁维构象有较高的稳定性和合理性,且空间结构比较简单,没有复杂的叁四级结构;此次试验为研究牡蛎Crag1蛋白结构和过敏性的关系及不同物种过敏原间的交叉反应提供了理论依据。(本文来源于《食品工业》期刊2019年02期）
徐愈强[10]（2019）在《SOD1突变蛋白性质与结构分析》一文中研究指出SOD1突变蛋白是最常见的引起肌萎缩性脊髓侧索硬化症(AmyotrophicLateralSclerosis,ALS)的原因之一,本文对SOD1基本特征进行了初步的分析,通过分析其核酸组成与疏水性发现其具有酸性蛋白质以及显着的胶原蛋白的特征,整体呈现亲水性。利用PSORTⅡ工具对SOD1亚细胞定位进行预测,数据表明,其在细胞中的分布均匀,在细胞质、细胞核中都有。使用MEGA我们做了进化树分析,结果表明人SOD1与灵长类动物进化关系最近。在最后,利用比较建模的方法构建了SOD1蛋白的叁级结构,从结构来看表明预测结果准确。(本文来源于《当代化工研究》期刊2019年01期）
蛋白结构分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本研究应用生物信息学方法,预测分析羊传染性脓疱病毒(ORFV)的OVIFNR蛋白结构与B细胞抗原表位。从羊传染性脓疱病羊嘴唇结痂中扩增出ORFV的OVIFNR基因序列并进行测序鉴定,上传至NCBI;应用生物信息学软件,将扩增所得的OVIFNR基因序列和GenBank公布的参考序列,在核苷酸和氨基酸水平上进行同源性分析和遗传进化树构建,并对OVIFNR蛋白分子的理化特性、跨膜区、信号肽、亲疏水性、二级结构、叁级结构和B细胞抗原表位进行预测分析。结果显示:所扩增序列与Hoping和Nantou毒株的OVIFNR基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为99.6%和100%;通过遗传进化树发现,所扩增序列的毒株与Hoping、ShanX、Nantou毒株处于同一分支;OVIFNR蛋白的理论等电点为4.83,半衰期为30 h,脂肪族指数77.92,总平均疏水性为–0.181,无跨膜区和信号肽,不属于跨膜蛋白;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占68.64%、7.56%、15.13%、9.18%,筛选出了8个优势B细胞表位;OVIFNR蛋白为亲水性蛋白,含有较多B细胞表位,具有抗原性,可以作为ORFV检测的新靶点。本研究为OVIFNR蛋白的功能研究和ORFV检测方法的建立提供了理论依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
蛋白结构分析论文参考文献
[1].王萱,田九博,张丽娜,马培元,于保锋.胶原叁股螺旋重迭蛋白1的理化性质和分子结构分析[J].中国生物制品学杂志.2019
[2].成伟伟,陈伯祥,杨明,赵子惠,常攀峰.羊传染性脓疱病毒OVIFNR蛋白结构分析与B细胞表位预测[J].中国动物检疫.2019
[3].刘晓柱,李银凤.拟南芥AtSWEET4基因启动子序列、编码蛋白结构分析及其在病原菌胁迫下表达特性检测[J].南方农业学报.2019
[4].姜伊悦,张小勇,崔泰花,李官浩,崔福顺.元蘑蛋白的超声辅助提取及结构分析[J].食品科技.2019
[5].吴长玲,和铭钰,韩瑞,史志玲,王中江.大豆蛋白-磷脂酰胆碱纳米乳液的显微观测及界面结构分析[J].中国食品学报.2019
[6].裴建新,唐驰,秦剑秋,潘海西,栾苑.南宁市HIV-1/AIDS人群治疗前pol区遗传特性及蛋白结构分析[J].基因组学与应用生物学.2019
[7].徐建林.我国羊巴贝斯虫AMA1和RON2蛋白基因结构分析及检测方法的建立[D].中国农业科学院.2019
[8].施圆圆,张声祥,赵德蕊,王晨凯,马克龙.异叶天南星苯丙氨酸解氨酶基因的克隆与蛋白结构分析[J].植物科学学报.2019
[9].方磊,李国明,贾福怀,陆路,曹珂路.牡蛎过敏原Crag1蛋白的结构分析[J].食品工业.2019
[10].徐愈强.SOD1突变蛋白性质与结构分析[J].当代化工研究.2019
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