海南产和广东产沉香木中真菌的多样性分析

论文摘要

目的研究海南产和广东产沉香木中真菌的组成及差异。方法利用Illumina HiSeq测序平台对沉香木中真菌基因组测序并进行生物信息学分析。结果海南省内各地区沉香木中真菌的菌落结构接近,广东省内沉香木的真菌菌落结构接近。广东产和海南产沉香木中真菌组成存在明显差异,海南产沉香木真菌多样性和丰富度高于广东产沉香木的真菌。子囊菌亚门Ascomycota为沉香木的优势门,担子菌亚门Basidiomycota次之。子囊菌亚门是海口、万宁、乐东、儋州和东莞沉香木真菌的优势种群,担子菌亚门是化州沉香木真菌的优势种群。伞菌纲Agaricomycetes为广州化州沉香木的优势种群。粪壳菌纲Sordariomycetes为东莞和儋州沉香木的优势种群。座囊菌纲Dothideomycetes为海口、乐东和万宁地区沉香木的优势种群。Pleosporales分别为东莞、海口、万宁和乐东地区沉香木真菌的优势目,Trechisporales为化州沉香木真菌的优势目,Polyporales为儋州沉香木真菌的优势目。Lignosphaeria为海口和万宁沉香木真菌的优势属,Perenniporia和Pyrigemmula分别为儋州和乐东沉香木真菌的优势属,Phaeoacremonium为化州和东莞沉香木真菌的优势属。不同地区沉香木的优势种群不同。结论海南产沉香木真菌多样性和丰富度高于广东产沉香木,不同地区沉香木真菌分布有差异。

论文目录

1 材料和方法

1.1 材料

1.2 方法

1.2.1 基因组DNA提取

1.2.2 PCR扩增及文库的构建

1.3 数据分析

1.3.1 测序数据处理

1.3.2 OTU聚类和物种注释

2 结果与分析

2.1 海南产和广东产沉香木真菌多样性分析

2.2 海南产和广东产沉香木真菌OTU聚类分析

2.3 海南产和广东产沉香木真菌的组成及分布

2.4 海南产和广东产沉香木真菌UPGMA聚类分析

2.5 海南产和广东产沉香木真菌的bata多样性分析

3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈旭玉,杨云,刘小敏,刘杨,冯剑,肖梦君,魏建和

关键词: 白木香,沉香木,真菌,多样性,丰富度

来源: 中国药学杂志 2019年23期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,农业科技

专业: 农作物

单位: 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所海南省南药资源保护与开发重点实验室国家中医药管理局沉香可持续利用重点研究室,中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室濒危药材繁育国家工程实验室

基金: 国家重点研发计划项目资助(2018YFC1706401),中组部“万人计划”项目资助(99950534),国家中药材产业技术体系资助(CARS-21),国家自然科学基金项目资助(81303312,81173481),中国医学科学院医学与健康科技创新工程资助(2016-I2M-2-003,2017-I2M-1-013)

分类号: S567.19

页码: 1933-1938

总页数: 6

文件大小: 224K

下载量: 101

海南产和广东产沉香木中真菌的多样性分析

论文摘要

论文目录

文章来源

相关论文文献

猜你喜欢