蓖麻WOX转录因子家族成员的全基因组分析及逆境胁迫响应

蓖麻WOX转录因子家族成员的全基因组分析及逆境胁迫响应

论文摘要

WOX是植物中特有的一类转录因子,参与植物发育和应激反应。为探究蓖麻基因组WOX转录因子信息,本研究通过生物信息学方法鉴定出11个蓖麻WOX转录因子家族成员,并对其系统发育、基因结构、保守基序及理化性质等基本信息进行鉴定与分析。结果显示,11个WOX成员被分为三个进化支,在古代进化支、中间进化支和现在进化支分别有2、2和7个成员,同一进化支成员的外显子、基因结构具有相似性,但理化性质差异较大。利用RT-qPCR检测根、茎、叶不同组织中5个蓖麻RcWOXs基因在干旱与盐胁迫下表达情况,结果表明,RcWOXs在不同组织中的表达具有特异性;除RcWOX10受干旱胁迫抑制外,RcWOX2、RcWOX4、RcWOX8和RcWOX9在干旱和盐胁迫下均被诱导表达,表明RcWOX转录因子在蓖麻逆境胁迫中起调控作用。本研究结果为进一步探究蓖麻WOX转录因子家族在逆境胁迫中的功能提供了一定的理论参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 蓖麻WOX转录因子家族的鉴定与理化性质分析
  •   1.3 蓖麻WOX转录因子系统发育分析
  •   1.4 基因结构与保守基序分析
  •   1.5 前处理试验
  •   1.6 蓖麻WOX家族基因的表达分析
  •   1.7 数据统计与分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 WOX转录因子家族成员的鉴定及其理化性质分析
  •   2.2 蓖麻WOX转录因子家族系统发育分析
  •   2.3 蓖麻WOX转录家族基因结构及保守基序分析
  •   2.4 蓖麻WOX基因在干旱胁迫下的表达模式分析
  •   2.5 蓖麻WOX基因在盐胁迫下的表达分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 韩雯毓,李国瑞,风兰,闫星伊,白英俊,李孟建,孙佳欣,陈永胜

    关键词: 蓖麻,转录因子,生物信息学分析,逆境胁迫

    来源: 核农学报 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 内蒙古民族大学,内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心/内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室/内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心

    基金: 国家自然科学基金项目(31460353),内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金项目(MDK2018017,MDK2018018),内蒙古民族大学自治区科技储备项目(2018NDCB05)

    分类号: Q943.2;S565.6

    页码: 1921-1927

    总页数: 7

    文件大小: 2701K

    下载量: 221

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