猪流行性腹泻病毒河北地方株的分离鉴定及其遗传进化分析

论文摘要

猪流行性腹泻（PED）是由猪流行性腹泻病毒（PEDV）引起的一种急性、高度接触性肠道传染病。该病主要危害哺乳仔猪,5日龄内的仔猪感染后死亡率可达100%。目前该病主要的防治方法是疫苗免疫,但是自2010年PED在中国再次暴发以来,疫苗免疫效果不佳,无法给猪群提供保护,给我国养猪业带来巨大损失。已有的研究发现PEDV变异是疫苗失效的主要原因,因此研究地方毒株的组织培养特性及遗传进化具有重要意义。本研究采集河北省规模养猪场腹泻仔猪的小肠及肠内容物,经RT-PCR检测,将阳性病料过滤处理后,接种于Vero细胞盲传,结果直至第5代出现典型病变;进一步经RT-PCR检测、间接免疫荧光试验和透射电镜观察后,最终证实成功分离到PEDV,将其命名为HBQHD1株。参照PEDV AJ1102株的全基因序列,设计16对引物,对HBQHD1株全基因组进行测定。提取HBQHD1株的RNA模板,经RT-PCR扩增后,得到16个片段目的基因,经克隆、测序、拼接后,得到HBQHD1株的全基因序列,并将其提交至NCBI,GenBank登陆号为MK606368.1。HBQHD1株基因组全长28038bp,经与25株具有代表性的PEDV毒株对比后,发现HBQHD1株与CV777等经典毒株亲缘性较远,与BJ-2011等变异株亲缘性较近,与经典株的同源性在96.5%-97.6%之间,与变异株的同源性在98%-99%之间。同样以这25株PEDV为参考,对HBQHD1株的各个片段进行同源性和遗传进化分析,结果表明HBQHD1株与经典株CV777、DR13等毒株的差异较大,与变异株差异小,亲缘性高。本研究为掌握PEDV流行株进化的动向提供参考并且为疫苗的研发提供一定的参考依据。

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文章来源

类型: 硕士论文

作者: 辛树阳

导师: 芮萍,陈国宇

关键词: 河北省,病毒分离鉴定,遗传进化分析

来源: 河北科技师范学院

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 河北科技师范学院

分类号: S852.651

总页数: 61

文件大小: 4174K

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