甘南地区牦牛曲拉中细菌群落结构

甘南地区牦牛曲拉中细菌群落结构

论文摘要

基于Illumina MiSeq高通量测序平台,对甘南牦牛曲拉样品中细菌16S rRNA V3-V4区进行测序,通过α多样性、物种分类组成及β多样性分析对曲拉中细菌多样性及群落结构进行分析。结果表明:曲拉样品中优势门为厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),优势属为乳杆菌属(Lactobacillus)、醋酸杆菌属(Acetobacter)、乳球菌属(Lactococcus),不同来源的样品中群落组成存在差异;细菌的功能基因预测表明,不同来源样品的细菌群落之间存在差异。研究结果可为曲拉的利用和食用安全性提供理论依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 曲拉微生物总DNA的提取
  •     1.3.2 PCR扩增及测序
  •     1.3.3 高通量测序数据处理
  •     1.3.4 群落多样性和统计分析
  •   1.4 数据分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PCR扩增、测序序列及OTU基本情况
  •   2.2 稀疏曲线
  •   2.3 α多样性分析
  •   2.4 样品细菌群落在门水平的分类及比较
  •   2.5 样品细菌群落在属水平的分类及比较
  •   2.6 物种丰度热图
  •   2.7 基于UniFrac距离的样本聚类分析
  •   2.8 样品中与细菌的基因代谢有关的功能特征
  • 3结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 曹磊,梁春御,曹瑛瑛,文开勇,文鹏程,杨敏,冯晓蘶,张忠明,张卫兵

    关键词: 曲拉,高通量测序,细菌多样性

    来源: 食品科学 2019年22期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 轻工业手工业

    单位: 甘肃农业大学食品科学与工程学院,兰州资源环境职业技术学院气象学院,甘肃食品药品监督管理局,甘肃农业大学理学院

    基金: 国家自然科学基金地区科学基金项目(31560442,31760466,31960486),企业研究转化与产业化专项(2018-SF-C29),甘肃农业大学学科建设专项基金项目(GAU-XKJS-2018-247)

    分类号: TS252.1

    页码: 103-109

    总页数: 7

    文件大小: 2564K

    下载量: 172

    相关论文文献

    标签:;  ;  ;  

    甘南地区牦牛曲拉中细菌群落结构
    下载Doc文档

    猜你喜欢