虎斑颈槽蛇肠道微生物组成和分布特征

虎斑颈槽蛇肠道微生物组成和分布特征

论文摘要

蛇类是一种研究能量平衡的模型动物,而肠道微生物则帮助宿主获取能量和营养。大多数肠道微生物的研究集中在圈养动物上,而对于野生蛇类的研究很少。本研究从3只野生虎斑颈槽蛇(Rhabdophistigrinus)的大肠、小肠和泄殖腔内容物提取微生物总DNA,进行16SrRNA基因V4区域扩增子测序,分析虎斑颈槽蛇肠道核心微生物组成和分布特征。结果表明,阿尔法指数在不同肠道区域的多样性不存在显著性差异。大肠、小肠和泄殖腔3个肠道部位共享534个操作分类单元(OTUs),大肠包含最多特有OTUs(388个)。门水平,梭杆菌门(Fusobacteria)在小肠(52.87%±14.49%)、大肠(41.12%±22.60%)和泄殖腔(65.70%±10.44%)均为优势菌。属水平,鲸杆菌属(Cetobacterium)在小肠(46.36%±13.86%)、大肠(21.95%±9.82%)和泄殖腔(58.18%±14.29%)为优势菌,柠檬酸杆菌属(Citrobacter)在小肠和泄殖腔中有显著性差异。此外,在其肠道检测到很多潜在的致病菌,例如,柠檬酸杆菌属、明串珠菌属(Trichococcus)和丹毒丝菌属(Erysipelothrix),了解了潜在致病菌在虎斑颈槽蛇肠道中的分布情况。在聚类分析中发现泄殖腔的数据重复性较好,将本研究泄殖腔数据与前人研究过的食鱼蝮(Agkistrodonpiscivorus)泄殖腔高通量测序数据进行联合分析,为更广泛开展不同蛇类肠道微生物组成的差异性分析提供理论借鉴依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 实验方法
  •   1.3 测序数据分析方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 虎斑颈槽蛇肠道微生物的组成和结构特征
  •   2.2 肠道3个部位间微生物群落的异同
  •   2.3 虎斑颈槽蛇和食鱼蝮泄殖腔微生物群的差异性
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 汤文娇,羊世俊,程雨琦,石倩,张程,朱广香

    关键词: 虎斑颈槽蛇,肠道菌群,梭杆菌门,鲸杆菌属

    来源: 动物学杂志 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学

    单位: 四川农业大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金项目(No.SFC31401959),中国博士后基金项目(No.2016M592688)

    分类号: Q48

    DOI: 10.13859/j.cjz.201904016

    页码: 589-598

    总页数: 10

    文件大小: 870K

    下载量: 147

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