盘基网柄菌早衰蛋白结构与功能生物信息学分析

论文摘要

早衰蛋白（presenilin, PS）是γ分泌酶的组成成分,其突变可造成阿尔兹海默病（Alzheimer disease,AD）的形成。因PS所造成AD的发病机理较复杂,因而我们想探究一下模式生物盘基网柄菌（Dictyostelium discoideum）是否能够作为研究早衰蛋白的模型。从NCBI网站中得到盘基网柄菌早衰蛋白DdPsenA和DdPsenB氨基酸序列,随后利用ProtScale、ProtParam理化性分析工具、保守结构域、TMHMM2跨膜区分析网站、进化树软件MEGA6.0、二级结构PredictProtein以及三级结构SWISS-Model服务器对上述蛋白进行生物信息学分析。DdPsenA的氨基酸长度为622,是亲水性蛋白,其相对分子质量为69 502.79,等电点为4.53。DdPsenB的氨基酸长度为473,属于疏水性蛋白,其相对分子质量为52 558.74,等电点为4.49,与DdPsenA同属于PeptidaseA22B超家族。跨膜分析出DdPsenA和DdPsenB均有8个跨膜区。DdPsenA与人类presenilin-2序列相似性为67%,Dd PsenB与人类presenilin-1序列相似性分别为60%。盘基网柄菌可以作为研究早衰蛋白功能和作用机制的模型。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 薛楠,郭倩楠,刘坚,徐存拴,薛德明

关键词: 早衰蛋白,盘基网柄菌,生物信息学分析

来源: 基因组学与应用生物学 2019年06期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学

单位: 河南师范大学附属中学,河南师范大学生命科学学院,贝勒医学院分子细胞生物系,河南赛诺特生物技术有限公司

基金: 河南省国际科技合作计划项目(No.152102410038),河南省基础与前沿技术研究计划项目(No.132300410135)共同资助

分类号: Q936;Q811.4

DOI: 10.13417/j.gab.038.002567

页码: 2567-2573

总页数: 7

文件大小: 3565K

下载量: 93

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