猪瘟病毒贵州株E2基因序列分析

猪瘟病毒贵州株E2基因序列分析

论文摘要

为了解猪瘟病毒贵州株GZPD E2基因变异情况,为贵州猪瘟疫苗的选择提供参考依据,试验采用RT-PCR方法对GZPD E2基因进行扩增,并对目的基因进行克隆、测序和序列分析。结果:(1)RT-PCR扩增获得大小为1 343 bp的基因片段,与预期扩增大小相符。(2)目的基因克隆、测序分析显示,GZPD与国内毒株shimen株、C株等在 E2基因上存在较高的同源性,为94.9%~99.9%;与国外毒株GPE、Koslov等的核苷酸同源性为95.1%~95.3%。(3)进化分析显示,GZPD与HuBei、C-ZJ-2008、C-strain、HCLV处于同一进化分支,而与shimen、CSFV-GZ-2009、Koslov、GPE处于不同的进化分支。结果表明:猪瘟病毒贵州株GZPD在 E2基因上存在一定变异,提示贵州猪瘟病毒存在一定的进化。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 试剂
  •   1.3 引物设计与合成
  •   1.4 CSFV E2基因的RT-PCR扩增
  •   1.5 CSFV E2基因克隆与测序
  •   1.6 目的基因序列分析
  • 2 结果
  •   2.1 CSFV E2基因的RT-PCR扩增结果
  •   2.2 CSFV E2基因克隆与筛选
  •   2.3 CSFV E2基因序列测定与分析
  •     2.3.1 CSFV E2基因测序与变异分析:
  •     2.3.2 CSFV E2基因核苷酸同源性分析:
  •     2.3.3 CSFV E2基因进化树分析:
  • 3 结论
  • 4 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 岳筠,杨美,皮泉,周敏会,李梅,何玲,谢晓东,王柏林,程振涛

    关键词: 猪瘟病毒贵州株,基因,克隆,序列分析

    来源: 贵州畜牧兽医 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 贵州省动物疫病预防控制中心,贵州大学动物科学学院,贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室

    基金: “贵州省预防兽医专业硕士研究生工作站”贵州省研究生教育创新计划项目(GZZ2017002),“贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队”贵州省科技创新人才团队项目(黔科合人才团队[2015]4016号)

    分类号: S852.651

    页码: 26-29

    总页数: 4

    文件大小: 1452K

    下载量: 66

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