人转录因子FoxM1B的生物信息学分析

人转录因子FoxM1B的生物信息学分析

论文摘要

目的:分析预测人转录因子FoxM1B启动子及蛋白结构和功能。方法:运用生物信息学软件对人FoxM1B基因的启动子区域及其蛋白的理化性质、跨膜区、信号肽和亲疏水性进行预测分析;利用软件模拟生成人FoxM1B蛋白质的三级结构图像,了解与其相互作用的蛋白网络。结果:采用生物信息学软件预测出人FoxM1B基因5’侧翼存在转录起始位点及启动子,且启动子(1300~1900 bp)的侧翼有1个CpG岛。人FoxM1B蛋白是亲水性蛋白,且不包含跨膜结构域和信号肽;在二级结构中,无规卷曲是其主要折叠方式,模拟生成蛋白质三级结构图像与二级结构预测一致。人FoxM1B蛋白与CCNB1、CCNA2、MYBL2、CDK1和PLK1等蛋白存在相互作用,可能通过这些蛋白参与细胞周期和DNA损伤修复过程。结论:对人FoxM1B基因及其编码蛋白的性质、结构和互作蛋白等进行了预测分析,为后续实验研究提供了依据和线索,奠定了重要的信息基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 人FoxM1B基因序列分析
  •   2.2 人FoxM1B基因启动子预测
  •   2.3 人FoxM1B蛋白一级结构预测
  •     2.3.1 FoxM1B蛋白亲疏水性分析
  •     2.3.2 跨膜区结构预测与信号肽分析
  •   2.4 人FoxM1B蛋白二级结构预测
  •     2.4.1 模体预测
  •     2.4.2 结构域与蛋白相互作用网络
  •     2.4.3 蛋白信息预测
  •     2.4.4 蛋白三级结构预测
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 杨潮,戴京,张欣宇,陈慧

    关键词: 叉头框,转录因子,生物信息学

    来源: 生物技术通讯 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 赣南师范大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金(81860492,81660491,81402304),江西省自然科学基金(20161BAB215221),赣南师范大学创新创业课题(CX170081)

    分类号: Q811.4

    页码: 371-377

    总页数: 7

    文件大小: 3832K

    下载量: 125

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