导读:本文包含了石刁柏论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:座子,序列,雄花,叶绿体,逆转录,质体,辽西。
石刁柏论文文献综述
黄玲,赖佳,韦树谷,代顺冬,李琼英[1]（2019）在《石刁柏两性花与雄花的抗氧化酶活性及其相关基因可变剪接的差异分析》一文中研究指出石刁柏(Asparagus officinalis),别名芦笋,其两性株是培育石刁柏全雄品种的重要资源材料。为探明引起石刁柏两性花与雄花之间性别差异的原因,首先测定了两性花与雄花性别分化前期、中期、后期叁个时期花蕾的过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)的活性,同时采用转录组测序(RNA-seq)技术,分析了两性花与雄花叁个不同发育时期花蕾中抗氧化酶基因的可变剪接及表达量的差异。结果发现,抗氧化酶活性与两性花、雄花的发育关系密切。在性别分化前期,两性花蕾中POD和SOD的活性均低于雄花蕾,CAT活性略高于雄花蕾,但在性别分化的中、后期,两性花蕾中POD和SOD的活性均高于雄花蕾,其中POD活性分别高出雄花蕾1.1和2.4倍, CAT活性略低于雄花蕾。通过RNA-seq及基因功能分类(GO)分析,表明其中有35个抗氧化活性相关基因只在两性花蕾中发生可变剪接,并且在石刁柏花器官性别分化前、中期,这35个抗氧化活性相关基因中分别有62.9%和65.7%的基因表达量高于雄花蕾。以上两方面的变化可能同时引起了石刁柏两性花蕾中抗氧化酶活性的升高。由此说明,抗氧化酶活性及相关基因的可变剪接与石刁柏两性花、雄花的发育紧密相关。(本文来源于《植物生理学报》期刊2019年08期）
程广前,贾克利,李娜,邓传良,李书粉[2]（2019）在《石刁柏核质体DNA的生物信息学分析及染色体定位》一文中研究指出在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT)。NUPTs在植物染色体(包括性染色体)的演化过程中具有重要作用,但目前相关研究比较缺乏。以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)2个片段进行染色体定位。结果表明,石刁柏核基因组中有2239个NUPTs序列的插入,总长度为565970bp,占核基因组的0.047%。不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其它染色体,表明NUPTs在石刁柏性(Y)染色体上累积的更多。石刁柏叶绿体基因组中的IR区、大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)序列均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高。此外,对2个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异性分布在Y染色体上。研究结果为深入揭示石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础。(本文来源于《植物学报》期刊2019年03期）
谭亮萍[3]（2018）在《石刁柏高产高效栽培技术》一文中研究指出石刁柏,别名芦笋、荻笋等,为百合科,天门冬属多年生宿根性草本植物,是一种营养保健型高档蔬菜,富含人体所需的矿物质、维生素、氨基酸和膳食纤维等营养物质,素有"蔬菜之王"的美誉。另外,石刁柏还具有极高的药用保健功能,石刁柏中含有黄酮、芦丁、皂甙、类胡萝卜素和多糖等生物活性物质。石刁柏栽培不同于其他普通蔬菜,一次种植可连续多年采收,一般(本文来源于《科学种养》期刊2018年05期）
张雪瑾[4]（2018）在《基于转录组数据的石刁柏性别差异基因的克隆及表达分析》一文中研究指出石刁柏(Asparagus officinalis)是一种广泛栽培的经济作物,同时也是研究性别决定机制的模式植物之一。但是对于其性别决定的分子机制,尤其是其单性性别决定及发育相关基因目前仍不清楚。本研究以石刁柏为材料,在高通量转录组测序数据的基础上,利用生物信息学、RT-PCR、荧光定量PCR、RACE及组织原位杂交技术分析了石刁柏雌雄性别差异表达基因,并对其中3个稳定的性别发育相关基因进行了克隆和表达分析。主要研究结果如下:1、以发育早期的雌雄花为材料,利用Illumina双末端测序技术进行转录组测序,经过整理后得到260 G高质量数据,组装获得平均长度为979 bp的unigenes 72,626个。通过对雌性、雄性和超雄株转录组数据比较分析后获得性别差异表达基因4876个。其中,433个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)与花的发育相关,包括了285个雄性/超雄性偏向和149个雌性偏向基因。在雄性/超雄偏向表达基因中,102个DEGs可能与花药发育相关。此外,我们发现了43个性别差异表达基因和调控性别发育的激素调节和生物合成相关;在性别差异表达的基因中包括128个转录因子,说明转录因子可能在石刁柏性别决定和分化调控网络中发挥重要作用。2、为了验证所获得的性别差异表达基因的稳定性,我们随机对30个性别差异表达基因进行了根、茎、花和叶的逆转录PCR和荧光定量PCR表达分析。结果表明,有26个性别差异表达基因的结果和测序结果是一致的,包括20个雄性差异和6个雌性差异基因,其中8个雄性差异基因仅在雄花中表达,12个基因在雌花和雌株的其他组织中有少量的表达;6个雌性差异基因在雄花和雌花中均有表达,在雌花的表达量远远高于雄花。3、为了进一步获得性别发育相关基因的全长cDNA序列,我们利用cDNA末端快速扩增技术从26个稳定的差异表达基因中选择5个进行全长基因克隆。结果表明,5个基因中成功获得3个基因的全长cDNA序列,分别命名为AoM1、AoM2和AoM10。3个基因的cDNA全长分别为669 bp、1435 bp和1884 bp,编码141、382和532个氨基酸。AoM2编码了III型聚酮化合物合酶B-类,基因AoM10编码了糖载体蛋白C-类。通过和刚公布的石刁柏基因组序列进行mapping分析发现,AoM2基因位于4号染色体上,包含5个外显子6内含子,基因全长3732 bp。AoM10基因位于5号染色体上,包括5个内含子和6个外显子,基因全长3241 bp。AoM1未检索到。4、利用组织原位杂交技术对基因AoM1、AoM2和AoM10在花发育过程中的表达进行分析。结果表明,AoM1基因只在雄性花蕾中有杂交信号,在雄花的雌蕊和花药部分信号较强,说明该基因是典型的雄性发育促进和雌花发育的抑制基因。AoM2基因在雄花的雌蕊和雄蕊部分上有明显的杂交信号,在雌花的花托也存在信号,并且在雌花的雄蕊和雄蕊上有微弱的信号。AoM10在雄花的信号强度大于雌花,其信号都集中在花的雌蕊和雄蕊位置。这说明AoM2和AoM10是两个雌雄差异表达基因,可能参与了雌雄蕊的发育调控。(本文来源于《河南师范大学》期刊2018-05-01）
贾克利[5]（2018）在《石刁柏核基因组NUPTs组成和染色体定位研究》一文中研究指出在植物中,质体DNA向核基因组的转移是一种普遍的遗传物质水平转移现象,转移到核基因组的质体DNA称为核质体DNA(Nuclear plastid DNA,NUPTs),NUPTs在核基因组中的插入可以引起核基因组变异及染色体结构重排,是基因组及染色体组演化的重要推动因素之一。石刁柏(Asparagus officinalis)为雌雄异株经济作物,具有2n=20条染色体,同型XY性染色体决定性别,其染色体组处于演化的不稳定阶段。但是哪些因素引起了石刁柏染色体组的不稳定尚不清楚。因此,本文利用生物信息学及分子细胞遗传学技术对石刁柏核基因组中的NUPTs进行注释及分析,对包括Y染色体在内的不同染色体上的NUPTs分布模式进行中期染色体定位。主要结果如下:1、生物信息学分析表明,石刁柏核基因组中共有2,239个NUPTs序列的插入,总长度为565,970 bp,占核基因组的0.047%。NUPTs在不同染色体上的插入长度不同,Y染色体插入平均长度最长,显着高于其他染色体,每Mb基因组中有778 bp的NUPTs序列,且存在一个插入热点区域。其次,不同染色体上插入的NUPTs数量也存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量最多,每100 Mb基因组中有272个NUPTs,这说明NUTPs在石刁柏Y染色体上具有更多的累积。同一染色体上NUPTs的插入位置是不均匀的。对10条染色体上基因密度、NUPTs长度和转座子长度的共定位模式分析表明,石刁柏基因组中NUPTs和转座子存在显着的共定位关系,2,239个NUPTs中有1,690个NUPTs侧翼序列为转座子序列,比例达到75.5%,显着高于随机序列和转座子共定位的比例(51.6%)。对NUPTs的叶绿体基因组来源分析表明,石刁柏叶绿体基因组中的反向重复区(Inverted repeat,IR)、短单拷贝区(Small single copy,SSC)和长单拷贝区(Large single copy,LSC)均能够向核基因组转移,但是转移的频率不同,IR、LSC和SSC区来源的NUPTs频率分别为27.9个/Kb、14.6个/Kb和15.9个/Kb,这说明IR区序列更容易向核基因组转移。2、为了对NUPTs在染色体上的位置进行定位,我们将叶绿体基因组进行按照约每4,000 bp为一序列单元进行扩增,将回收纯化的序列进行中期染色体荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)。结果表明,共28个探针序列中有23个探针获得稳定的中期染色体FISH杂交信号。其中LSC区来源的15个;IR区来源的6个;SSC区来源的2个。NUPTs在染色体上的分布位置存在叁种模式,其中4个序列定位于着丝粒及着丝粒侧翼区,12个序列在染色体上弥散分布,7个序列特异分布于某特定染色体。根据NUPTs序列的来源来看,LSC和SSC区来源序列主要定位于染色体臂和着丝粒位置,IR区序列主要定位于染色体的着丝粒位置。更为重要的是,我们获得了3个Y染色体特异的NUPTs序列,主要定位于Y染色体的着丝粒区,这也说明NUPTs的插入可能参与了石刁柏性染色体的演化过程。(本文来源于《河南师范大学》期刊2018-05-01）
李旭[6]（2018）在《石刁柏基因组转座子的组成与定位》一文中研究指出转座子(Transposable elements,TEs)是真核生物基因组中重要的组成部分,能够引起染色体结构重排,因此在染色体进化中发挥着重要的作用。石刁柏(Asparagus officinalis)又名芦笋,为天门冬科天门冬属多年生雌雄异株草本植物,具有同型XY性染色体,是研究植物性染色体尤其是性染色体起源及演化的模式材料之一。石刁柏基因组测序已经完成,然而,对于其基因组中转座子组成及特征,尤其是染色体分布模式等仍不清楚。因此,本文利用生物信息学技术对石刁柏基因组中转座子进行了注释,分析了其组成类型及在基因组中的比例,同时利用中期染色体FISH(Fluorescence in situ hybridization,荧光原位杂交)技术对主要类型的转座子在染色体上的分布模式进行了研究。主要研究结果如下:1、基于一系列重复序列分析工具,我们对石刁柏已发表的全基因组序列进行了重复序列注释及分析。结果表明,石刁柏基因组中转座子比例为60.92%,主要由Ty1-copia和Ty3-gypsy两类反转座子组成,比例分别达到基因组的18.13%和37.82%。DNA转座子含量较少,比例为1.28%。对10条染色体上基因密度和转座子长度进行的分析表明,所有染色体上转座子主要富集在染色体中部,而染色体末端含量较少,与基因的分布负相关。对Y染色体的MSY区(Male-specific region of Y chromosome,雄性特异区)转座子含量分析表明,其转座子比例达到86.95%,显着高于基因组中转座子的比例,且这部分转座子主要为LTR(Long terminal repeat,长末端重复)类反转座子,这说明LTR类反转座子可能参与了石刁柏性染色体的起源和演化过程。为了了解不同雌雄异株植物基因组中转座子组成特征,我们对已测序的11种雌雄异株植物基因组中转座子含量进行比较发现,11种雌雄异株植物基因组中反转座子含量均显着高于转座子含量,且反转座子中均主要为Ty1-copia和Ty3-gypsy两大类型。但是,从桑树(Morus alba)的17.70%到菠菜(Spinacia oleracea)的67.84%,11种雌雄异株植物基因组中转座子含量变异范围较大,且基因组大小和转座子含量相关性也存在较大差异,这与雌雄异株植物独立起源的特点是一致的。2、为了对所获转座子序列进行中期染色体定位,对石刁柏基因组中51个转座子进行了克隆,其中包括14个Ty1-copia类反转座子,17个Ty3-gypsy类反转座子,8个其他类型的反转座子序列和12个DNA转座子。对这些转座子的中期染色体FISH结果表明,51个转座子序列均获得清晰稳定的杂交信号。反转座子中,LTR类反转座子在染色体上的分布位置主要有四种模式,包括分布在着丝粒、着丝粒及其侧翼区、除着丝粒与端粒外的染色体臂和整条染色体上弥散分布;LINE(Long interspersed nuclear elements,长散在重复元件)类反转座子在染色体上主要呈现着丝粒特异和着丝粒及其侧翼区的分布特点。DNA转座子主要出现在着丝粒及其侧翼区和染色体臂上。这说明反转座子和DNA转座子在染色体上的分布存在差异。虽然不同类型的反转座子在染色体上的分布也存在一定位置特异性,但是其杂交信号均在着丝粒及其侧翼异染色质区域广泛,说明着丝粒及其侧翼区域的异染色质区是转座子分布的热点区域。比较转座子在不同染色体上的分布结果表明,石刁柏前7对较大染色体上分布的反转座子显着多于3对小染色体,这说明反转座子的不断复制插入可能是染色体体积膨胀的主要原因。(本文来源于《河南师范大学》期刊2018-05-01）
梁寒峭,王卓月,尹俊玉,白飞荣,刘洋[7]（2018）在《石刁柏内生真菌的多样性研究》一文中研究指出为探索百合科天门冬属石刁柏内生真菌的多样性及组织分布特点,为进一步深入研究内生真菌与宿主活性成分互作机制奠定基础。研究采用组织块分离法,对石刁柏不同部位的内生真菌进行了分离鉴定。通过分离率、分离频率、多样性指数和丰富度指数等分析石刁柏内生真菌的分布特点和多样性。共分离得到内生真菌88株,经形态和分子生物学鉴定归属为5纲8目10科13属,其中,镰孢菌属和青霉菌属为根和茎部优势菌群,分别占总菌株数量的37.50%和31.82%;不同组织的石刁柏中,根部位的Shannon-Wiener多样性指数(H')和Margalef丰富度指数(R)最高,分别为1.45和2.03,均匀度(E)最低为0.59。叶与茎的相似性系数稍高,达到0.55。表明石刁柏不同部位中内生真菌分布及组成存在较大差异,且具有一定的组织的专一性。(本文来源于《食品科技》期刊2018年02期）
魏红[8]（2017）在《长白山野生石刁柏在辽西地区的无公害生产技术》一文中研究指出随着社会的发展和人类的进步,养生理念日益深入人心,人们越来越关心食品安全问题,对绿色无公害食品青睐有加。我们要增强市场的安全元素,让天然、绿色、无公害的产品摆上百姓的餐桌。(本文来源于《农技服务》期刊2017年23期）
凤桐,王玉彦,秦成华,张宇航,石晓华[9]（2016）在《石刁柏家庭室内盆栽关键技术》一文中研究指出为了装饰、美化城市居民日益改善的居住环境,满足自己动手生产无公害蔬菜的广泛需求,通过近年来对石刁柏家庭室内栽培装置、材料和关键技术的研究,总结出一套包括优良品种、栽培容器、盆土配方、种苗准备、浇水施肥、越冬管理、采收时间等完整的技术措施,以期与石刁柏盆栽生产及爱好者分享、交流。(本文来源于《蔬菜》期刊2016年10期）
石晓卫,李书粉,邓传良,卢龙斗,高武军[10]（2016）在《石刁柏Ty1-copia反转座子逆转录酶序列克隆及异质性分析》一文中研究指出对石刁柏(Asparagus officinalis)品种UC309及TD818的两个反转座子逆转录酶序列进行了PCR扩增并对其在基因组中的异质性进行了分析。结果表明,s101366和s107518两个转座子序列均属于Ty1-copia反转座子,是Ty1-copia反转座酶的部分保守区序列,其长度分别为636和653 bp。对随机获得的两个反转座子测序表明两个反转座子存在一定的异质性,其突变主要是由于发生了碱基置换,其中碱基转换分别占到80.4%和80.0%,T圮C和G圮A转换的比例差异不显着。通过对两个石刁柏品种(TD818和UC309)中获得的序列聚类分析发现,s101366和s107518均未表现出性别间、品种间及近缘种间的保守性,甚至表现出了种内异质性大于种间的异质性特征。这说明了两个反转座子处于高度变异的状态,是产生染色体不稳定的重要因素之一。(本文来源于《湖北农业科学》期刊2016年18期）
石刁柏论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT)。NUPTs在植物染色体(包括性染色体)的演化过程中具有重要作用,但目前相关研究比较缺乏。以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)2个片段进行染色体定位。结果表明,石刁柏核基因组中有2239个NUPTs序列的插入,总长度为565970bp,占核基因组的0.047%。不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其它染色体,表明NUPTs在石刁柏性(Y)染色体上累积的更多。石刁柏叶绿体基因组中的IR区、大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)序列均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高。此外,对2个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异性分布在Y染色体上。研究结果为深入揭示石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
石刁柏论文参考文献
[1].黄玲,赖佳,韦树谷,代顺冬,李琼英.石刁柏两性花与雄花的抗氧化酶活性及其相关基因可变剪接的差异分析[J].植物生理学报.2019
[2].程广前,贾克利,李娜,邓传良,李书粉.石刁柏核质体DNA的生物信息学分析及染色体定位[J].植物学报.2019
[3].谭亮萍.石刁柏高产高效栽培技术[J].科学种养.2018
[4].张雪瑾.基于转录组数据的石刁柏性别差异基因的克隆及表达分析[D].河南师范大学.2018
[5].贾克利.石刁柏核基因组NUPTs组成和染色体定位研究[D].河南师范大学.2018
[6].李旭.石刁柏基因组转座子的组成与定位[D].河南师范大学.2018
[7].梁寒峭,王卓月,尹俊玉,白飞荣,刘洋.石刁柏内生真菌的多样性研究[J].食品科技.2018
[8].魏红.长白山野生石刁柏在辽西地区的无公害生产技术[J].农技服务.2017
[9].凤桐,王玉彦,秦成华,张宇航,石晓华.石刁柏家庭室内盆栽关键技术[J].蔬菜.2016
[10].石晓卫,李书粉,邓传良,卢龙斗,高武军.石刁柏Ty1-copia反转座子逆转录酶序列克隆及异质性分析[J].湖北农业科学.2016
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