夏枯草PvDXS基因的克隆和表达分析

夏枯草PvDXS基因的克隆和表达分析

论文摘要

该研究在夏枯草转录组测序的基础上设计特异引物,采用逆转录PCR技术获得该基因的全长核苷酸序列,并进行生物信息学分析,采用qRT-PCR法分析PvDXS在夏枯草不同组织及不同外源性物质诱导下的表达量。结果表明:克隆得到的PvDXS基因开放阅读框2 181 bp,编码726个氨基酸,理论分子量为78 040.47 D,等电点为6.75,PvDXS蛋白具有TransketolaseC结构域和Transketpyr结构域,系统进化树结果表明,PvDXS蛋白与丹参、长春花的DXS(SmDXS2、CrDXS2)亲缘关系较近,推测PvDXS属于第Ⅱ类DXS蛋白。qRT-PCR分析表明,PvDXS基因在叶中表达量高于果穗及茎。对果穗施加7种外源性物质处理24 h后,GA3处理组该基因表达量升高,其他6种外源性物质处理后表达量均降低,其中CaCl2、SNP、SA处理后该基因的表达量显著降低。PvDXS基因在不同组织中表达量差异较大,且受外源物质诱导表达。这为进一步研究PvDXS基因对夏枯草萜类成分合成途径中的功能及表达调控奠定基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料和试剂
  •   1.2 总RNA提取与cDNA第一条链的合成
  •   1.3 cDNA全长克隆
  •   1.4 生物信息学分析
  •   1.5 夏枯草DXS基因的特异性表达分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PvDXS基因克隆
  •   2.2 PvDXS基因编码蛋白的生物信息学分析
  •     2.2.1 理化性质
  •     2.2.2亚细胞定位和功能域
  •     2.2.3 PvDXS蛋白的二级、三级结构预测
  •     2.2.4 系统进化树构建和多序列比对
  •   2.3 组织特异性及外源性物质诱导后表达
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李璐,董诚明,张梦佳,朱畇昊

    关键词: 夏枯草,基因,基因克隆,表达分析

    来源: 广西植物 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,农作物

    单位: 河南中医药大学药学院,呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心呼吸疾病中医药防治省部共建协同创新中心

    基金: 国家自然科学基金(81603232),国家重点研发计划项目(2017YFC1702800),河南中医学院博士科研基金(BSJJ2015-13)~~

    分类号: Q943.2;S567.239

    页码: 1619-1627

    总页数: 9

    文件大小: 1164K

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