论文摘要
背景:Micro RNAs（miRNA）是多种真核生物基因表达的负调节因子,在RNA沉默和基因转录后调控中发挥作用。几乎所有类型的恶性肿瘤中均发生miRNA失调,可影响多种基因表达。目的:构建胃癌核心miRNA调控网络,为解析miRNA在胃癌发生、发展中的分子机制提供理论依据。方法:利用miRNA和m RNA表达谱芯片筛选差异表达miRNA和m RNA,应用miRWalk 2. 0预测miRNA相互作用的基因,并与表达谱芯片筛选出的基因进行交叉匹配,确定核心差异表达miRNA,构建miRNA-m RNA调控网络。对靶基因进行GO分析和KEGG分析。结果:表达谱芯片筛选出21个上调miRNA和36个下调miRNA,交叉匹配后发现1 042个低表达基因和711个高表达基因,最终确定10个核心miRNA-m RNA调控网络。受核心miRNA调控的差异表达基因主要参与肿瘤相关通路,高表达基因主要富集于ECM-受体作用通路等9个信号通路,而低表达基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用等5个信号通路。GO分析结果显示上调基因涉及315个功能、下调基因涉及88个功能,其中细胞外基质组织的相关性最高。结论:基于生物信息学的miRNA-m RNA调控网络分析为研究胃癌提供了新的视角,有助于系统性阐明miRNA在胃癌发生、发展中的分子作用机制,可为胃癌诊断标志物的筛选和药物治疗精准靶点的选择提供理论基础。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 周荃,孙丽萍
关键词: 胃肿瘤,信使,基因调控网络
来源: 胃肠病学 2019年10期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技,基础科学
专业: 生物学,肿瘤学,生物医学工程
单位: 中国医科大学附属第一医院肿瘤病因与筛查研究室辽宁省高校肿瘤病因与预防重点实验室
基金: “十三五”国家重点研发计划(2016YFC1303200)
分类号: R735.2;Q811.4
页码: 603-609
总页数: 7
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