AtTERT启动子结构特征及其对拟南芥非生物胁迫抗性的影响

AtTERT启动子结构特征及其对拟南芥非生物胁迫抗性的影响

论文摘要

端粒酶是具有逆转录酶活性的维持真核生物中染色体末端DNA完整性的核糖核蛋白复合物,而端粒酶逆转录酶(TERT,Telomerase reverse transcriptase)是端粒酶的核心组分。目前对TERT启动子的研究主要集中在人体的肿瘤细胞方面,而对植物TERT基因启动子的结构及TERT表达调控机理的研究有所缺乏。本研究通过生物信息学技术对拟南芥TERT启动子结构特征进行了系统分析,并构建植物TERT启动子进化树;用半定量PCR检测野生型和AtTERT启动子区突变体拟南芥幼苗在非生物胁迫下的TRET表达模式。结果表明,系统进化分析显示TERT启动子在同一类群植物中有着较高的保守性;TERT基因启动子具有多个与干旱、盐、激素等相关调控元件;突变体AtTERT转录表达量普遍低于野生型;同时突变体对盐、干旱胁迫抗性降低,而对脱落酸处理不敏感。这说明AtTERT启动子含有抗旱、抗盐反应顺式作用元件,而无响应ABA调控机制,验证了对AtTERT基因启动子的顺式作用元件的预测,并初步证明AtTERT启动子对AtTERT的转录表达具有调控作用,对未来探讨该基因的表达调控机制提供了重要参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 试剂及仪器
  •   1.3 生物信息学分析的数据来源与分析方法
  •     1.3.1 启动子序列的获取
  •     1.3.2 程序和数据库
  •     1.3.4 数据分析方法
  •   1.4 拟南芥幼苗非生物胁迫处理
  •   1.5 RT-PCR检测拟南芥AtTERT的表达量
  •     1.5.1 引物设计
  •     1.5.2 提取拟南芥总RNA并反转录获得基因组c DNA
  •     1.5.3 拟南芥AtTERT基因PCR扩增
  •     1.5.4 PCR产物的电泳和半定量分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 拟南芥AtTERT基因启动子分析
  •   2.2 AtTERT启动子顺式作用元件分析
  •   2.3 启动子CpG岛分析
  •   2.4 植物TERT启动子同源性及系统进化
  •   2.5 启动子区域突变对AtTERT基因表达响应非生物胁迫及ABA的影响
  •     2.5.1 盐胁迫下At TERT表达
  •     2.5.2 干旱胁迫下AtTERT表达
  •     2.5.3 ABA处理下AtTERT表达
  •     2.5.4 热激胁迫下AtTERT的表达
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孙玉萍,王杨,门璟煜,董琦,杨颖,于婷乔,吴晓飞,卢存福,陈玉珍

    关键词: 拟南芥,端粒酶逆转录酶启动子,非生物胁迫,非端粒功能

    来源: 植物遗传资源学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 北京林木分子设计育种高精尖创新中心/北京林业大学生物科学与技术学院/林木育种国家工程中心,北京大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31270737),高等学校学科创新引智计划项目(B13007),长江学者和创新团队发展计划项目(IRT13047),北京市自然科学基金项目(6112016)~~

    分类号: Q943.2;Q945.78

    DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20181008001

    页码: 769-780

    总页数: 12

    文件大小: 2489K

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