洋葱伯克霍尔德菌群3种鉴定方法的比较

论文摘要

为了比较VITKE 2 COMAPCT、 VITEK MS质谱、 16s rDNA基因测序3种方法鉴定洋葱伯克霍尔德菌群的异同,挑选15株从米面制品、淀粉及其制品中分离得到的洋葱伯克霍尔德菌群的菌,分别用VITEK 2 COMPACT、 VITEK MS质谱和16s rDNA基因测序进行鉴定。结果显示, VITEK 2COMPACT只能鉴定到群水平,可信度88%—99%; VITEK MS质谱可鉴定到种水平,鉴定置信度99%;16s rDNA基因测序可鉴定到种水平,序列同源性能达到99%以上,但每株菌16s序列能匹配到2种以上洋葱伯克霍尔德菌群里的菌。所以, 3种鉴定方法中, VITEK MS质谱法可鉴定出洋葱伯克霍尔德菌群里的不同种,该方法结果准确,时效性高,操作步骤简单。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 杨丹婷,苏嘉妮,李婉珊,钟卫烨,王曦,韦云,丁清龙,周露

关键词: 洋葱伯克霍尔德菌群,基因测序

来源: 检验检疫学刊 2019年02期

年度: 2019

分类: 经济与管理科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 广东省食品检验所

基金: 广东省食品药品监督管理局科技创新项目(2018ZDZ07,2018ZDZ06)

分类号: TS207.4

页码: 13-18+31

总页数: 7

文件大小: 267K

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