密码子使用频率论文_刘晶,于浩,杨润军,鲍永华,李俊雅

导读:本文包含了密码子使用频率论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:密码子,使用频率,基因,蛋白,病毒,痘苗,催乳素。

密码子使用频率论文文献综述

刘晶,于浩,杨润军,鲍永华,李俊雅[1](2011)在《牛乳蛋白的遗传密码子使用频率分析》一文中研究指出研究牛乳蛋白不同氨基酸的密码子使用频率对利用乳腺生物反应器表达目标蛋白过程中密码子的优化具有重要意义。本试验运用ENBOSS的CHIPS和SMS中的密码子使用工具对7种牛乳蛋白编码的基因进行了分析,并将这7个编码序列拼接在一起进行了乳蛋白全基因组的密码子偏爱性研究,同时与绵羊、猪及小鼠的乳蛋白密码子偏爱性进行了比较。结果表明:牛乳蛋白的CHIPS分析Nc值为51.867,αs1-CN、αs2-CN、-βCN、-κCN、α-LB、-βLG、LTF的Nc值分别为52.005、49.967、48.746、58.113、55.514、36.274、47.646,编码牛乳蛋白氨基酸的密码子出现频率较均一;牛乳蛋白V、A、R、I、T、L、Q、P等氨基酸的密码子使用频率与其他物种有较大差异。牛乳蛋白的密码子偏爱性与绵羊最为接近。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2011年02期)

刘汉梅,何瑞,张怀渝,黄玉碧[2](2010)在《玉米叶绿体基因密码子使用频率分析》一文中研究指出本研究应用软件CodonW,对玉米叶绿体蛋白编码基因的密码子用法进行了初步分析,计算了位于密码子3个位置的GC含量和同义密码子的使用频率,并确定了玉米叶绿体基因组的最优密码子。结果显示玉米叶绿体基因GC含量低,密码子第叁位的GC含量最低,偏好使用以A或T碱基结尾的密码子;且确定的25种最优密码子也主要以A或T碱基结尾。分析结果对指导外源基因进行分子改造,提高其在玉米叶绿体中的表达效率及细胞器分子进化研究等具有重要意义。(本文来源于《四川农业大学学报》期刊2010年01期)

刘华贵,王小花,刘玉方,赵兴波,李宁[3](2007)在《五个鸡群中催乳素基因密码子使用频率与产蛋量的关系分析》一文中研究指出通过鸡催乳素基因编码区基因扫描,发现3个SNP位点,分别是外显子2的C1607T、外显子5的C5749T和T5821C,3个SNP均没有改变氨基酸的编码.同时发现不同的单倍型间存在不同的密码子使用频率.对5个鸡群共370只鸡进行SSCP的基因型检测,共发现7种单倍型,结合44周龄产蛋量分析,发现不同单倍型的平均产蛋量存在显着性差异.结合密码子使用频率分析,发现使用高频密码子的单倍型个体产蛋量相对高.通过酶联免疫方法检测催乳素表达量,结果显示,使用高频密码子的个体,激素水平较高,其中使用2个高频密码子的单倍型个体和使用1.5个密码子的单倍型个体之间存在极显着差异.研究结果表明,密码子使用频率与产蛋量在一定的范围内呈现正相关趋势.(本文来源于《生物化学与生物物理进展》期刊2007年10期)

周猛,童春发,施季森[4](2007)在《杨树派间不同种的遗传密码子使用频率分析(英文)》一文中研究指出遗传密码子的简并性特征造成了不同物种使用的密码子存在偏爱性。了解不同物种的密码子使用特点,可以为外源基因导入过程中的基因改造提供依据,从而实现外源基因的高效表达。杨树是世界上广泛栽培的重要造林树种之一,已经成为林木基因工程研究的模式植物。本研究采用高频密码子分析法,对美洲山杨P.tremuloides,毛白杨P.tomentosa,美洲黑杨P.deltoids和毛果杨P.trichocarpa 4种杨树的蛋白质编码基因序列(CDS)进行了分析,计算出了杨树同义密码子相对使用频率(RFSC),确定了4种杨树的高频率密码子,发现虽然不同种类的杨树密码子使用上有一些差别,但是偏爱密码子的差别却很小,共性的密码子占绝大多数。仅有Pro,Thr和Cys等少数几个氨基酸的偏爱密码子有差别。这种“共性”提示我们,用不同种的杨树中任何一种杨树的偏爱密码子所设计的外源基因在其他杨树中也可以使用。(本文来源于《遗传学报》期刊2007年06期)

王小花,刘华贵,刘玉方,赵兴波,李宁[5](2006)在《密码子使用频率影响产蛋性状:鸡催乳素基因叁个SNP位点的研究》一文中研究指出通过对鸡催乳素基因编码区DNA序列分析,发现3个SNP。在五个鸡群中进行SSCP共发现7种单倍型,不同的单倍型有不同的密码子使用频率。结合44周龄产蛋量性状,发现不同单倍型的平均产蛋量存在显着差异。结合密码子使月频率分析,发现高频密码子的单倍型其产蛋量也相对高。ELISA 检测结果也证实高频密码子个数越多的单倍型其激素水平越高。实验结果表明PRL基因密码子的使用频率是影响鸡产蛋量的重要因素。(本文来源于《第十次全国畜禽遗传标记研讨会论文集》期刊2006-10-01)

冯德江,蔡华雅,刘翔,徐军望,朱祯[6](2003)在《马铃薯X病毒外壳蛋白的表达水平与变偶密码子使用频率的相关性》一文中研究指出把经密码子修饰的马铃薯X病毒 (PotatoVirusX ,PVX)外壳蛋白 (CoatProtein,CP)基因和未修饰的野生型外壳蛋白基因与CaMV 3 5S启动子融合后 ,构建成相应的植物表达载体 ,利用农杆菌介导转化烟草。分别对修饰CP和野生CP的转基因烟草进行Westernblot和ELISA分析 ,结果表明经密码子修饰的PVX外壳蛋白的表达量是野生型蛋白表达量的 1 3~1 5。Northernblot结果表明修饰和未修饰的外壳蛋白在转录水平上是一致的。以上结果暗示外源基因中稀有密码子的数量可能是限制外源基因表达的一个因素。改变基因中稀有密码子的数量有可能成为控制基因表达的一种有效途径(本文来源于《微生物学报》期刊2003年05期)

祝志展,刘觉平[7](2003)在《猪瘟病毒基因表达水平与同义密码子使用频率的关系》一文中研究指出用信息类聚方法研究了猪瘟病毒基因表达水平与同义密码子使用频率的关系 ,求出了猪瘟病毒基因组各同义密码子的相对使用频率 ,得到了作为表征基因表达水平的各类基因的信息熵 ,所得结果与已有的研究结论相符 .本研究表明 :对于猪瘟病毒的单股正链RNA结构 ,同义密码子的使用频率对于基因表达水平有重要影响(本文来源于《武汉大学学报(理学版)》期刊2003年02期)

王世峰,阮力[8](2003)在《病毒密码子使用频率研究进展》一文中研究指出密码子使用频率的研究多集中在自养生物中,对于寄生生物如病毒的研究相对较少。近些年的研究表明某些病毒基因的密码子使用频率和宿主细胞不完全匹配,密码子使用在病毒和宿主的相互作用中起了重要的作用。本文对病毒密码子使用频率的特点、影响病毒密码子使用频率的因素、几种典型病毒的密码子使用特点和密码子使用频率研究的方法做了论述。(本文来源于《生物技术通讯》期刊2003年01期)

王世峰,许洪林,陆柔剑,孟昕,王文玲[9](2002)在《痘苗病毒基因组密码子使用频率分析》一文中研究指出密码子使用的差别是普遍存在的现象 ,每一个密码子被某些生物偏爱 ,而在另一些生物中则很少使用。以往这方面的研究多集中在自养生物中 ,而对纯寄生的病毒本身及其与宿主细胞基因密码子使用频率关系的研究则很少。分析痘苗病毒哥本哈根株 189个基因的密码子使用频率发现 :总体上痘苗病毒偏爱使用以A/U为结尾的密码子 ;基因的异质性不强 ,没有影响密码子使用的主要趋势 ;在不同转录方向上和表达时相上 ,基因密码子使用略有不同 ;不同功能的基因其密码子使用上差别较大 ;晚期基因比早期基因与宿主密码子使用频率的差别大。上述结果表明 :密码子是影响病毒和细胞相互作用、保证其自身生存的重要机制(本文来源于《病毒学报》期刊2002年03期)

特木尔巴根[10](2000)在《同义密码子非均匀使用频率的研究》一文中研究指出〔1〕中所建立的相似实变模型推广应用到四个碱基 ,6 4个密码子情况 ,并用叁个具体情形给出了密码子的稳定频率分布。(本文来源于《内蒙古民族师院学报(自然科学版)》期刊2000年02期)

密码子使用频率论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

本研究应用软件CodonW,对玉米叶绿体蛋白编码基因的密码子用法进行了初步分析,计算了位于密码子3个位置的GC含量和同义密码子的使用频率,并确定了玉米叶绿体基因组的最优密码子。结果显示玉米叶绿体基因GC含量低,密码子第叁位的GC含量最低,偏好使用以A或T碱基结尾的密码子;且确定的25种最优密码子也主要以A或T碱基结尾。分析结果对指导外源基因进行分子改造,提高其在玉米叶绿体中的表达效率及细胞器分子进化研究等具有重要意义。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

密码子使用频率论文参考文献

[1].刘晶,于浩,杨润军,鲍永华,李俊雅.牛乳蛋白的遗传密码子使用频率分析[J].中国兽医学报.2011

[2].刘汉梅,何瑞,张怀渝,黄玉碧.玉米叶绿体基因密码子使用频率分析[J].四川农业大学学报.2010

[3].刘华贵,王小花,刘玉方,赵兴波,李宁.五个鸡群中催乳素基因密码子使用频率与产蛋量的关系分析[J].生物化学与生物物理进展.2007

[4].周猛,童春发,施季森.杨树派间不同种的遗传密码子使用频率分析(英文)[J].遗传学报.2007

[5].王小花,刘华贵,刘玉方,赵兴波,李宁.密码子使用频率影响产蛋性状:鸡催乳素基因叁个SNP位点的研究[C].第十次全国畜禽遗传标记研讨会论文集.2006

[6].冯德江,蔡华雅,刘翔,徐军望,朱祯.马铃薯X病毒外壳蛋白的表达水平与变偶密码子使用频率的相关性[J].微生物学报.2003

[7].祝志展,刘觉平.猪瘟病毒基因表达水平与同义密码子使用频率的关系[J].武汉大学学报(理学版).2003

[8].王世峰,阮力.病毒密码子使用频率研究进展[J].生物技术通讯.2003

[9].王世峰,许洪林,陆柔剑,孟昕,王文玲.痘苗病毒基因组密码子使用频率分析[J].病毒学报.2002

[10].特木尔巴根.同义密码子非均匀使用频率的研究[J].内蒙古民族师院学报(自然科学版).2000

论文知识图

公布PE38核苷酸序列同源性比...片段的PCR扩增和重组质粒pcDNA3....Sf301保守序列与岛上基因的密码子使与大肠杆菌、酵母及人的NS1基因密一2家蚕(BombJ夕xmori)及BmNPv总编码序...家族性肥厚型心肌病(图a)和白内障疾...

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