蚕豆萎蔫病毒论文_王宝霞,齐永红,辛敏,崔丽艳,王德富

导读:本文包含了蚕豆萎蔫病毒论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:蚕豆,病毒,基因组,太子参,花叶,芜菁,序列。

蚕豆萎蔫病毒论文文献综述

王宝霞,齐永红,辛敏,崔丽艳,王德富[1](2019)在《蚕豆萎蔫病毒2号板蓝根分离株全基因组序列测定与分析》一文中研究指出板蓝根(Isatidis Radix)病毒病害的发生已对其产量和品质造成了严重影响。因此,建立一套灵敏、快速、有效的板蓝根病毒病害检测手段十分重要。本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)等技术对感病板蓝根进行鉴定,确定其被蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus 2, BBWV2)所侵染。为明确BBWV2板蓝根分离物(BBWV2-IR)的进化关系,对其全基因组进行序列扩增与分析,获得其RNA1序列全长为5 955 bp,RNA2序列全长为3 602 bp,分别编码由1 870和1 064个氨基酸组成的多聚蛋白质。序列比对发现,BBWV2-IR RNA1与BBWV2-Am分离物的同源性最高,RNA2与BBWV2-SN分离物的同源性最高。全基因组变异情况分析表明,BBWV2-IR RNA1和RNA2分别与其同源性最高的株系存在多个氨基酸变异位点。系统进化分析表明,BBWV2-IR RNA1与BBWV2-Am RNA1聚为一簇,RNA2与BBWV2-SN RNA2聚为一簇,亲缘性最近。本研究获得了BBWV2板蓝根分离株的全基因组序列,并明确其在进化过程中的地位和区域变化情况,为进一步研究BBWV2-IR致病性变异提供一定的理论基础。(本文来源于《中国生物化学与分子生物学报》期刊2019年03期)

严丹侃,郑红英,张海珊,沈艳,顾江涛[2](2018)在《蚕豆萎蔫病毒2号安徽分离物全基因组序列测定与分析》一文中研究指出利用酶联免疫和RT-PCR技术对采自安徽地区的蚕豆病株进行检测,确定其病原为蚕豆萎蔫病毒2号Broad bean wilt virus 2(BBWV2)。为明确BBWV2安徽分离物(BBWV2-AH)的分类地位,克隆了该分离物的全基因组序列,分析了其基因组特征。结果表明,BBWV2-AH RNA1全长为5 944 bp(GenBank登录号:KY606992),含有1个ORF;BBWV2-AH RNA2全长3 587bp(GenBank登录号:KY606993),含有1个ORF。全序列核苷酸和氨基酸相似性分析显示,BBWV2-AH RNA1与BBWV2其他分离物的核苷酸、氨基酸相似性分别为78.4%~96%和87.1%~99%;BBWV2-AH RNA2与BBWV2其他分离物的核苷酸、氨基酸相似性分别为76.8%~95.5%和88.2%~98.3%。全基因组核苷酸序列系统发育分析显示,BBWV2-AH RNA1与中国的BBWV2-Hunan RNA1的亲缘关系最近,而BBWV2-AH RNA2与韩国的多个分离物聚集在一起,再与中国的分离物BBWV2-B935形成一个分支。(本文来源于《植物保护》期刊2018年01期)

郑庆伟[3](2018)在《双重RT-PCR检测方法可检测出太子参芜菁花叶病毒和蚕豆萎蔫病毒》一文中研究指出宁德师范学院生物系和福建省特色药用植物工程技术研究中心研究人员针对不同产地栽培的太子参中主要存在芜菁花叶病毒和蚕豆萎蔫病毒侵染且为害严重的情况,建立能同时检测这2种病毒的双重RT-PCR快速检测方法。根据GenB ank数据库中的TuM V、BBWV外壳蛋白基因核苷酸序列的保守区域分别设计简并引物,在单一RT-PCR检测体系的基础上,建立(本文来源于《农药市场信息》期刊2018年02期)

匡云波,陈满足,陆伊荣,陈晶,叶祖云[4](2017)在《太子参芜菁花叶病毒和蚕豆萎蔫病毒的双重RT-PCR检测》一文中研究指出针对不同产地栽培的太子参(Pseudostellaria heterophylla)中主要存在芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,Tu MV)和蚕豆萎蔫病毒(Broad bean wilt virus,BBWV)侵染且为害严重的情况,建立能同时检测这2种病毒的双重RT-PCR快速检测方法。根据Gen Bank数据库中的Tu MV、BBWV外壳蛋白(coat protein,CP)基因核苷酸序列的保守区域分别设计简并引物,在单一RT-PCR检测体系的基础上,建立和优化双重RT-PCR检测体系。双重RT-PCR的优化结果显示,最佳扩增循环数为35,最佳引物浓度为0.4μmol·L~(-1),最佳退火温度为51℃。其灵敏度测定结果显示,2种病毒在样品c DNA稀释至原液的10-4倍后仍能扩增出特异条带。应用该方法对7份栽培太子参样品和4份脱毒苗样品进行了检测,结果表明,建立的双重RT-PCR检测方法可稳定、准确、灵敏地同时检测Tu MV和BBWV。(本文来源于《园艺学报》期刊2017年04期)

匡云波,叶炜,李金辉,于静静,叶祖云[5](2017)在《太子参蚕豆萎蔫病毒2号CP基因的遗传多样性及分子进化分析》一文中研究指出为了解太子参蚕豆萎蔫病毒2(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)的遗传多样性及分子进化关系,本研究对5个不同地理来源的6份太子参病叶样品进行了BBWV2外壳蛋白(coat protein,CP)基因的RT-PCR扩增和克隆。序列分析结果表明,所得13条太子参BBWV2 CP基因序列均为1 345 bp,其核苷酸序列同一性在81.0%~99.0%之间,氨基酸序列同一性在93.5%~99.3%之间;核苷酸多样性为0.084 00;存在280个核苷酸多态性位点,其中232个为地域特异性位点;总变异数为278个,其中同义突变29个,异义突变249个。不同地理来源的太子参BBWV2分离物之间遗传分化程度较高,基因交流不频繁,遗传漂变可能导致分离物间明显的遗传分化。在系统进化树中,太子参分离物的聚类呈现出明显的地域特异性,江苏、贵州、湖南、福建分离物均聚类在I-a亚组,而山东分离物聚类在II-c亚组,遗传距离较远。研究表明,太子参BBW V2存在很高的遗传变异,基因突变是其产生遗传多样性的主要驱动力,而地理因素与其具有较高的核苷酸多样性密切相关。(本文来源于《植物病理学报》期刊2017年04期)

牛颜冰,时晓丽,张西梅,赵慧琪,赵保佳[6](2015)在《侵染白术的蚕豆萎蔫病毒2号的分子检测与序列分析》一文中研究指出为鉴定引起山西绛县白术花叶、黄化等症状的病原,利用生物学接种、非序列依赖性PCR扩增(SIA)和RTPCR的研究方法,对白术病样进行了研究,结果表明:接种感病白术病汁液的指示植物昆诺藜表现退绿枯斑,经单斑分离后转接健康白术植株呈现出与病样类似的症状,初步证明白术病害可能为病毒引起的;SIA检测表明感病白术为蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)侵染所致;为明确BBWV2白术分离物(BBWV2-Am)的分类地位,进一步克隆了BBWV2-Am RNA2外壳蛋白大亚基基因(LCP)和外壳蛋白小亚基基因(SCP)序列;序列同源性分析表明,LCP基因和SCP基因与已发表的BBWV2其它株系相应基因核苷酸序列的同源性分别为79.3%~87.2%和80.1%~89.2%,氨基酸序列同源性分别为91.2%~95.7%和89.4%~95.5%;系统进化树分析显示,BBWV2-Am与BBWV2地黄分离物(BBWV2-Rg)形成一个独立分支,二者亲缘关系最近。这是BBWV2侵染白术的首次报道。(本文来源于《病毒学报》期刊2015年01期)

牛颜冰,赵欣,赵慧琪,张西梅[7](2014)在《蚕豆萎蔫病毒2号山西分离株的全基因组序列测定与分析》一文中研究指出本试验在生物学接种的基础上,利用非序列依赖性PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)对感病青椒(Capsicum annuum)进行了分子鉴定.序列测定及分析发现,侵染青椒的病毒为蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus 2,BBWV2).为明确BBWV2青椒分离物(BBWV2-Ca)的分类地位,对BBWV2-Ca的全基因组序列进行了分段克隆、序列测定和分析.BBWV2-Ca RNA1全长5 929 bp,含有1个ORF.BBWV2-Ca RNA2全长3 559 bp,含有1个ORF,编码3种蛋白:VP53/VP37、外壳蛋白大亚基(large coat protein,LCP)和外壳蛋白小亚基(small coat protein,SCP).全序列核苷酸同源性分析显示,BBWV2-Ca RNA1与BBWV2其它分离物核苷酸同源性在77.9%~93.7%之间;RNA2与BBWV2其它分离物核苷酸同源性在80.2%~93.8%之间.全序列系统进化分析显示,BBWV2-Ca RNA1与BBWV2-XJ14-3以及BBWV2-RP3株系聚为一簇,亲缘关系最近;RNA2与BBWV2-Am形成一个独立分支,亲缘关系最近.(本文来源于《中国生物化学与分子生物学报》期刊2014年09期)

赵欣[8](2014)在《蚕豆萎蔫病毒2号山西分离株的全基因组序列测定与分析》一文中研究指出青椒(Capsaicam annuum)为菊亚纲(Asteridae),茄科(Solanaceae)一年生或多年生草本植物,是我国深受人们喜爱的蔬菜之一。现如今,青椒的种植面积越来越大,使得其被病毒侵染的现象逐渐严峻,造成了农业经济的极大损失。本研究对山西太谷范村蔬菜种植基地具有典型病毒病症状的青椒病样进行了分子生物学检测以及鉴定,发现青椒被蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus2, BBWV2)所侵染,并克隆了BBWV2的全基因组序列。依据生物学检测法,利用dsRNA、非序列依赖性PCR扩增(sequence-independent amplification, SIA)、RT-PCR对感病青椒进行了检测。结果发现侵染青椒的病毒为蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus2, BBWV2),将青椒分离物命名为BBWV2-Ca。为了进一步明确青椒BBWV2-Ca的分类地位,对BBWV2-Ca的全基因组序列进行分段克隆、序列测定和分析。结果显示BBWV2-Ca具有蚕豆病毒属(Fabavirus)的典型特征,它是二分体病毒,包括RNA1和RNA2。RNA1全长5929nt,含有1个ORF。BBWV2-CaRNA1与BBWV2其它分离物的氨基酸同源性为86.8%-97.3%。系统进化显示,BBWV2-Ca RNA1与中国的BBWV2-XJ14-3以及韩国的BBWV2-RP3株系聚为一簇,同源性最高,而与西班牙的BBWV1-Ben株系同源性最低。BBWV2-Ca RNA2全长3559nt,含有1个ORF,编码叁种蛋白,分别是运动蛋白(VP53/VP37),外壳蛋白大亚基(Large Coat Protein, LCP)和外壳蛋白小亚基(Small Coat Protein, SCP)。BBWV2-Ca RNA2与BBWV2其它分离物的氨基酸同源性为89.9%-97.1%。系统进化表明,BBWV2-Ca RNA2与来自中国的BBWV2-Am同源性最高,形成一个独立分支,而与来自西班牙的BBWV1-Ben株系同源性最低。(本文来源于《山西农业大学》期刊2014-06-01)

王晓燕[9](2014)在《侵染一串红的蚕豆萎蔫病毒2号的分子鉴定》一文中研究指出【目的】一串红(Salvia splendens)观赏价值高,是城市和园林中普遍栽培的草本花卉。在石河子观察到一些叶片花叶、植株矮化、花序减少、变小,提前枯死的一串红,降低观赏价值。本研究论文对病原进行检测鉴定,明确其病原病毒及分子特性,为进一步控制该病害提供理论基础。【方法】采集表现花叶的一串红样品,在防虫温室中接种测试寄主观察症状表现和提取dsRNA初步确定病毒类型;以dsRNA/RNA为模板,合成特异性引物进行RT-PCR、克隆、序列测定和分析,明确其分子特性。【结果】在防虫温室摩擦接种3科5种植物,在心叶烟、叁生烟、假酸浆、鸡冠花、蚕豆产生明显的局部或系统性症状,经过筛选获得S4分离物。提取S4分离物的dsRNA,得到大小约4700bp和6300bp的片段,以此dsRNA为模板,用蚕豆病毒属(Fabavirus)的兼并引物进行RT-PCR,扩增得到一条约400bp片段,序列测定片段长为391nts,NCBI中经blast比对,与蚕豆萎蔫病毒2号(Bean broad wilt virus2,BBWV2)的相似性为78%100%,表明S4分离物为BBWV2。设计合成特异性引物,以S4分离物的总RNA为模板分段进行RT-PCR,PCR产物经回收、克隆和测序,得到S4分离物RNA1基因组全序列为5957nt(不包括poly A),编码一个大的开放阅读框(Open reading frame,ORF);序列相似性结果表明,S4分离物与已报道BBWV2的RNA1序列相似性在78.4%100.0%,与来自同一地区辣椒分离物XJP1-1序列同源性为100%。基因组RNA2大小为3618个核苷酸(不包括poly A),同样编码一个大的开放阅读框(ORF),与BBWV2的RNA2序列相似性在80.4%93.0%,其中与中国新疆的辣椒分离物XJP1-1同源性最高,达93.0%,而与来自同一地区加工番茄分离物XJ14-3a的同源性最低,仅为80.4%。【结论】通过本论文的研究,初步明确了石河子地区一串红花叶病毒病是由BBWV2侵染所致,并明确了其分子特性,这是首次系统的对BBWV2侵染一串红进行的研究。(本文来源于《石河子大学》期刊2014-06-01)

许新江[10](2013)在《蚕豆萎蔫病毒2号(BBWV2)基因组RNA_2的序列测定》一文中研究指出以表现顶枯症状的11个辣椒病株的dsRNA为模板,用蚕豆病毒属(Fabavirus)的兼并引物Fab5_R1F和Fab5_R1R进行PCR扩增,其中10个病株扩增到长约400 bp的预期大小的片段,选取其中代表病株XJP1-1的PCR产物进行克隆、测序,得到389 nts的序列片段。基因库检索表明,该片段为蚕豆萎蔫病毒2号(BBWV2)基因组RNA1的片段。说明经PCR检测,具有400 bp片段的10个田间病株均有BBWV2侵染。将基因库中已登陆的BBWV2的RNA2核苷酸序列进行序列比对,然后根据RNA2的序列保守区设计引物R2F-1F和R2F-1R。以病株的总RNA为模板,对分离物XJP1-1进行RNA2组分的克隆、测序,获得1 302 nts的RNA2序列,序列比较显示,该序列与新疆侵染加工番茄的分离物XJ14-1具有最高的序列同源性,为88.9%。(本文来源于《新疆农垦科技》期刊2013年12期)

蚕豆萎蔫病毒论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

利用酶联免疫和RT-PCR技术对采自安徽地区的蚕豆病株进行检测,确定其病原为蚕豆萎蔫病毒2号Broad bean wilt virus 2(BBWV2)。为明确BBWV2安徽分离物(BBWV2-AH)的分类地位,克隆了该分离物的全基因组序列,分析了其基因组特征。结果表明,BBWV2-AH RNA1全长为5 944 bp(GenBank登录号:KY606992),含有1个ORF;BBWV2-AH RNA2全长3 587bp(GenBank登录号:KY606993),含有1个ORF。全序列核苷酸和氨基酸相似性分析显示,BBWV2-AH RNA1与BBWV2其他分离物的核苷酸、氨基酸相似性分别为78.4%~96%和87.1%~99%;BBWV2-AH RNA2与BBWV2其他分离物的核苷酸、氨基酸相似性分别为76.8%~95.5%和88.2%~98.3%。全基因组核苷酸序列系统发育分析显示,BBWV2-AH RNA1与中国的BBWV2-Hunan RNA1的亲缘关系最近,而BBWV2-AH RNA2与韩国的多个分离物聚集在一起,再与中国的分离物BBWV2-B935形成一个分支。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

蚕豆萎蔫病毒论文参考文献

[1].王宝霞,齐永红,辛敏,崔丽艳,王德富.蚕豆萎蔫病毒2号板蓝根分离株全基因组序列测定与分析[J].中国生物化学与分子生物学报.2019

[2].严丹侃,郑红英,张海珊,沈艳,顾江涛.蚕豆萎蔫病毒2号安徽分离物全基因组序列测定与分析[J].植物保护.2018

[3].郑庆伟.双重RT-PCR检测方法可检测出太子参芜菁花叶病毒和蚕豆萎蔫病毒[J].农药市场信息.2018

[4].匡云波,陈满足,陆伊荣,陈晶,叶祖云.太子参芜菁花叶病毒和蚕豆萎蔫病毒的双重RT-PCR检测[J].园艺学报.2017

[5].匡云波,叶炜,李金辉,于静静,叶祖云.太子参蚕豆萎蔫病毒2号CP基因的遗传多样性及分子进化分析[J].植物病理学报.2017

[6].牛颜冰,时晓丽,张西梅,赵慧琪,赵保佳.侵染白术的蚕豆萎蔫病毒2号的分子检测与序列分析[J].病毒学报.2015

[7].牛颜冰,赵欣,赵慧琪,张西梅.蚕豆萎蔫病毒2号山西分离株的全基因组序列测定与分析[J].中国生物化学与分子生物学报.2014

[8].赵欣.蚕豆萎蔫病毒2号山西分离株的全基因组序列测定与分析[D].山西农业大学.2014

[9].王晓燕.侵染一串红的蚕豆萎蔫病毒2号的分子鉴定[D].石河子大学.2014

[10].许新江.蚕豆萎蔫病毒2号(BBWV2)基因组RNA_2的序列测定[J].新疆农垦科技.2013

论文知识图

和Broadbeanwiltvirus2比较显...蚕豆萎蔫病毒具有蛋白水解酶必...豇豆花叶病毒科代表病毒RdRp基因的氨...薇甘菊萎蔫病毒部位侵染薇甘菊30d后茎、...薇甘菊萎蔫病毒形态的电镜观察Fig.4El...红花的WV-prl基因与BBWV2在蛋白水平进...

标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  

蚕豆萎蔫病毒论文_王宝霞,齐永红,辛敏,崔丽艳,王德富
下载Doc文档

猜你喜欢