K亚群禽白血病病毒分离株全基因组测序及序列分析

K亚群禽白血病病毒分离株全基因组测序及序列分析

论文摘要

K亚群禽白血病病毒(ALV-K)是近年来从地方品种鸡分离鉴定的新亚群ALV。本试验在对江苏某原种鸡场保存的琅琊鸡开展禽白血病净化过程中,分离并鉴定1株ALV-K,命名为JS13LY19。为探明其基因组来源及特征,对JS13LY19分离株前病毒DNA进行了分段克隆和测序,获得全长基因组序列,并与各亚群ALV参考株进行比对分析。结果显示,JS13LY19分离株符合复制完整型C型反转录病毒特征,缺乏肿瘤基因。其gp85基因相较于其他亚群ALV,与ALV-K参考株遗传进化关系最为接近,与ALV-K原型株JS11C1一致性最高(99.2%);而gag、pol、gp37、LTR、UTR及JS13LY19与内源性ALV显示出更高的一致性(92.0%~99.4%);其LTR U3区比大部分外源性ALV LTR少了1个CAAT enhancer盒、PRE盒、CArG盒及Y盒。JS13LY19分离株极有可能是JS11C1与内源性ALV重组产生,且具有内源性ALV LTR及U3区转录调控元件的部分缺失,可能使JS13LY19转录能力下降而致病性降低。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品与细胞
  •   1.2 主要试剂
  •   1.3 病毒分离与鉴定
  •   1.4 前病毒全基因组克隆与测序
  •   1.5 前病毒全基因组序列分析
  • 2 结果
  •   2.1 病毒分离与鉴定
  •   2.2 前病毒全基因组测序
  •   2.3 前病毒全基因组序列分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 俞燕,周生,徐步,邵红霞,钱琨,叶建强,秦爱建

    关键词: 亚群禽白血病病毒,序列分析,转录调控元件,地方品种鸡

    来源: 中国兽医学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 扬州大学兽医学院教育部禽类预防医学重点实验室/江苏省动物预防医学重点实验室,江苏省家禽科学研究所

    基金: 江苏省自然科学基金青年基金资助项目(BK20170478),公益性行业(农业)科研专项资助项目(201203055)

    分类号: S852.65

    DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2019.06.09

    页码: 1091-1098

    总页数: 8

    文件大小: 3685K

    下载量: 256

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