SDSL-EPR技术检测LC3B蛋白功能结构域中特定位点的运动特性

SDSL-EPR技术检测LC3B蛋白功能结构域中特定位点的运动特性

论文摘要

目的用定点自旋标记-电子顺磁共振(SDSL-EPR)技术检测自噬相关蛋白LC3B功能结构域上特定氨基酸位点的运动特性。方法采用序列重叠延伸PCR(SOE-PCR)法对LC3B蛋白NHD结构域α1螺旋Q9位点、ULD结构域α3螺旋N59位点以及口袋结构内部β1折叠135位点引入半胱氨酸(cysteamine,Cys)突变,表达纯化获得LC3B突变体蛋白;甲烷硫代磺酸(2,2,5,5-tetramethyl-1-oxyl-3-methyl methanethiosulfonate,MTSL)自旋标记后进行电子顺磁共振(EPR)检测,通过计算EPR波谱旋转相关时间τc,分析不同氨基酸位点的运动特性。结果构建了LC3B突变体基因的原核表达载体pET-22b-LC3B,实现了蛋白的可溶性高效表达;Q9C和N59C位点EPR波谱呈现双成分叠加谱,Q9C位点不同运动成分的τc值分别为1和3.8 ns,N59C位点为1和3.4 ns;I35C位点为三成分叠加谱,其τc值分别为0.7、2.9和8.1 ns。结论存在于特定氨基酸位点的运动性差别,预示着溶液状态下LC3B蛋白各功能结构域的同一氨基酸位点处可能存在不同的构象特征。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1 .1 材料
  •   1 .2 方法
  •     1 .2.1 pET-22b-LC3B突变体重组载体构建
  •     1 .2.2 LC3B突变体蛋白表达与纯化
  •     1 .2.3 MTSL标记与波谱检测
  •     1 .2.4 EPR波谱拟合
  • 2结果
  •   2.1 LC3B突变体重组载体构建
  •   2.2 LC3B突变体蛋白表达与纯化
  •   2.3 LC3B突变体蛋白不同位点的EPR波谱检测与模拟解析
  • 3讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赵曦,董国福,马蕾,郭俊旺,吴可

    关键词: 自噬相关蛋白质类,旋转相关时间,运动性

    来源: 军事医学 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 基础医学

    单位: 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所

    基金: 国家自然科学基金项目(31800053)

    分类号: R341

    页码: 664-668

    总页数: 5

    文件大小: 1825K

    下载量: 28

    相关论文文献

    标签:;  ;  ;  

    SDSL-EPR技术检测LC3B蛋白功能结构域中特定位点的运动特性
    下载Doc文档

    猜你喜欢