葛根SSR特征及江西粉葛DNA身份证的构建

葛根SSR特征及江西粉葛DNA身份证的构建

论文摘要

使用生物信息学方法分析野葛Pueraria lobata和甘葛藤P. thomsonii基因组SSR(simple sequence repeat)序列。分别获得66 191,71 968个SSR位点,据此开发了20对SSR引物,从中筛选出5对多态性较强、扩增带型稳定的引物,对江西产区9个不同粉葛栽培种进行遗传多样性分析,共得到16个多态信息位点,平均每个SSR引物多态信息含量(PIC)为0. 600 7;对9个粉葛栽培种进行亲缘关系聚类,结果显示9个粉葛栽培种可归为6个种质。该研究利用5对核心引物组合,为江西粉葛种质建立了DNA身份证,为粉葛优良种质筛选和中药材道地性研究提供参考信息。

论文目录

  • 1 材料
  •   1.1 样品
  •   1.2 仪器
  •   1.3 试剂
  • 2 方法
  •   2.1 总DNA提取
  •   2.2 SSR标记来源
  •   2.3 SSR引物设计
  •   2.4 PCR扩增及银染检测
  •   2.5 数据处理
  • 3 结果与分析
  •   3.1 野葛与甘葛藤SSR发掘和特征比较
  •   3.2 SSR引物设计及筛选
  •   3.3 基于SSR的遗传多样性分析
  •   3.4 粉葛DNA身份证的构建
  • 4 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 周荣荣,周骏辉,南铁贵,蒋超,段海燕,赵宇平,黄璐琦,袁媛

    关键词: 野葛,甘葛藤,基因组,身份证

    来源: 中国中药杂志 2019年17期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

    专业: 生物学,农作物

    单位: 南京中医药大学药学院,中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地

    基金: 国家重点研发计划项目(2017YFC170395-01),中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(ZZ10-008),中央本级重大支减项目(2060302)

    分类号: Q811.4;S567.239

    DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20190527.106

    页码: 3615-3621

    总页数: 7

    文件大小: 233K

    下载量: 278

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