CRISPR/Cas9系统介导的miR-155基因敲除细胞的制备

CRISPR/Cas9系统介导的miR-155基因敲除细胞的制备

论文摘要

为研究miR-155基因在猪肺泡巨噬细胞系(3D4/21)中的功能,采用CRISPR/Cas9系统构建miR-155敲除的猪肺泡巨噬细胞系。首先,采用sgRNA-cas9程序,设计4个靶向miR-155的特异性sgRNA引物序列。然后构建sgRNA表达载体,与pEGFP-C1-cas9载体共转染3D4/21细胞,进行流式分选并富集表达绿色荧光蛋白GFP的细胞。最后,采用T7E I酶酶切、Sanger测序、实时荧光定量PCR(qPCR)、western blot等方法检测敲除效率,发现miR-155基因可以被以上4个sgRNA编辑,其中sgRNA39的敲除效率最高,T7E I酶酶切检测流式分选后的敲除效率有42%;Sanger测序显示sgRNA39细胞系敲除31个碱基;RT-qPCR结果显示miR-155-5p/3p表达量均有下降;western blot结果表明miR-155靶基因SHIP1的蛋白表达量升高。成功构建miR-155敲除的3D4/21细胞为进一步探讨miR-155在巨噬细胞发挥的调控功能研究提供细胞模型。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 sgRNA设计及表达载体构建
  •     1.2.2 细胞培养,质粒转染及流式分选
  •     1.2.3 PCR扩增与T7E I酶酶切鉴定、测序分析
  •     1.2.4 细胞RNA提取及qRT-PCR
  •     1.2.5 Western blotting
  •     1.2.6 数据分析
  • 2 结果
  •   2.1 合成sgRNA引物并构建载体
  •   2.2 miR-155基因敲除的3D4/21细胞的制备
  •   2.3 MiR-155在3D4/21细胞基因组中敲除效率的检测
  •   2.4 敲除miR-155的3D4/21细胞中缺失或插入位点测序验证
  •   2.5 敲除miR-155的3D4/21细胞中miR-155相对表达量的检测
  •   2.6 免疫印迹检测敲除miR-155的3D4/21细胞中靶基因表达水平
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李聪聪,张永辉,赵婉霞,吴姣,韩浩园,李梦云,牛晖,宋素芳,李婉涛

    关键词: 敲除,猪肺泡巨噬细胞

    来源: 生物技术通报 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学

    单位: 河南牧业经济学院动物科技学院,郑州市动物生殖分子调控重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31702102),河南省高等学校重点科研项目(18A230002),河南牧业经济学院博士启动资金项目(53000139),郑州市1125创新领军人才项目(2016XL003)

    分类号: Q78

    DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0609

    页码: 231-239

    总页数: 9

    文件大小: 3656K

    下载量: 361

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