地衣芽孢杆菌几丁质酶的生物信息学分析

地衣芽孢杆菌几丁质酶的生物信息学分析

论文摘要

目的应用生物信息学的方法预测地衣芽孢杆菌几丁质酶的结构与功能。方法登陆NCBI数据库搜索目标酶的氨基酸序列,用生物信息学软件ProtParam、SIGNALIP、SWISS-MODEL等预测该酶的理化性质、信号肽及跨膜区、空间结构等。结果该酶是由693个氨基酸组成的蛋白质,相对分子质量为77803.79,分子式为C3483H5251N937O1059S19,理论等电点为5.42,不稳定系数为33.82,亲水性系数为-0.590,二级结构中α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲所占比分别为15.73%、26.55%和57.72%。结论地衣芽孢杆菌几丁质酶为一种亲水性蛋白,有磷酸化、乙酰化位点,有信号肽,可分泌,可能作为一种胞外因子与其他物质共同作用,为其进一步研究提供新方向。

论文目录

  • 1 数据
  • 2 几丁质酶的生物信息学分析
  •   2.1 蛋白结构特征与进化树构建
  •   2.2 理化性质预测
  •   2.3 蛋白质信号肽与跨膜位点预测
  •   2.4 蛋白质翻译后修饰位点预测
  •   2.5 蛋白结构预测
  •   2.6 互作蛋白分析
  • 3 结果
  •   3.1 蛋白结构特征与分子进化分析
  •   3.2 几丁质酶的理化性质分析
  •   3.3 蛋白质信号肽、跨膜区及修饰位点分析
  •   3.4 二级结构分析
  •   3.5 三级结构分析
  •   3.6 互作蛋白分析
  • 4 讨论与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 左一萌

    关键词: 几丁质酶,生物信息学,预测

    来源: 青海农技推广 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 兰州交通大学化学与生物工程学院

    分类号: Q936;Q811.4

    页码: 52-56

    总页数: 5

    文件大小: 1612K

    下载量: 174

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