导读:本文包含了混合池论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因组,引物,大麦,文库,桉树,花序,湍流。
混合池论文文献综述
徐建峰,容维中,石福岳,王燕燕,董和[1]（2019）在《样本数量和终质量浓度对DNA混合池PCR扩增质量和测序效果的影响》一文中研究指出为筛选适宜的DNA混合池法,采用两因素交叉分组设计,以混合样本数量(20、60和150个)和终质量浓度(50、100和150 ng/μL)为组合因子,分析不同混合池对PCR扩增质量及SNPs检出率的影响。结果表明:在同一混合样本数量下,以终质量浓度100 ng/μL建立的DNA混合池扩增的PCR产物纯度和OD_(260)/OD_(280)均优于50 ng/μL,但对测序结果无显着影响;以终质量浓度150 ng/μL建立的DNA混合池扩增的PCR产物杂带较多,不符合测序要求。在同一混合样本终质量浓度下,混合样本数越多,SNPs检出率越高。综上,从PCR扩增质量、SNPs检出率和试验成本来分析,以混合样本150个、终质量浓度100 ng/μL组合建立的DNA混合池效果最好。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年05期）
钱慧蓉,陈林,杨国栋,潘婷婷,王贤荣[2]（2019）在《短丝木犀SSR-PCR反应体系优化及基于DNA混合池的引物快速筛选》一文中研究指出本研究采用L9(23)正交试验设计确定短丝木犀的SSR-PCR最佳反应体系,同时设置12个不同的温度梯度优化引物退火温度;利用优化后的体系以50对候选SSR引物为对象,对6个短丝木犀基因组DNA样品等量混合,进行PCR扩增筛选引物。结果表明,第一,短丝木犀SSR-PCR最优反应体系为:1.0μL50ng/μL模板DNA,1.0μL 100μmol/L引物,12.5μL 2×Taq PCR Master Mix,补ddH2O至25μL;第二,DNA混合池方法比常规的筛选方法具有效率高,实验资源消耗低的优点,可用于短丝木犀SSR引物的大量筛选;第叁,最终筛选出10对具有高多态性、高稳定性且重复性好的SSR引物。本研究旨在建立适合短丝木犀的SSR-PCR最佳反应体系,并以DNA混合池为模板进行引物筛选,为短丝木犀引物的大量开发提供了一种新的途径。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年02期）
张尧锋,张冬青,余华胜,林宝刚,华水金[3]（2018）在《基于极端混合池(BSA)全基因组重测序的甘蓝型油菜有限花序基因定位》一文中研究指出【目的】适合机械化收获是当今油菜育种改良和遗传研究的重要目标。该研究以一个自然变异产生的油菜有限花序(denterminate inflorescence 1,di1)突变体为研究对象,通过分析有限花序的遗传模式,开展有限花序性状的基因定位和克隆,以期发掘候选基因,为培育适合机械化收获的油菜新品种提供新思路和新材料,为揭示油菜有限花序遗传机制奠定基础。【方法】以一个稳定遗传的有限花序突变株系FM8与野生型自交系FM7开展正反交,观察F1和F2后代的花序形态,分析有限花序性状的遗传模式。在F2群体中挑选20个有限花序单株和20个野生类型单株构建混合池,对混合池和亲本开展20×和10×覆盖度的全基因组重测序,定位有限花序性状的关联区间。根据关联区间对应到拟南芥基因组的共线性区段和基因注释信息,预测候选基因,并对候选基因进行同源克隆,发掘序列变异,筛选关键基因。【结果】油菜有限花序突变性状表现为初花期主花序和侧枝花序顶部形成一个或若干个顶生花,花序无限生长受阻,导致结角期主枝和侧枝有封顶特征即有限花序。有限花序突变株系与野生型正反交F1均表现为野生型,F2代无限花序与有限花序的分离比符合13﹕3,说明有限花序的遗传受2对隐性基因和1对隐性上位抑制基因互作控制。对混合池及亲本开展全基因组重测序,得到30 123个单核苷酸多态性(SNPs)标记和107 636个插入缺失标记(In Dels)标记,用于有限花序性状的全基因组定位。定位结果共检测获得7个显着关联区间,分布于油菜A08、A09、A10、C08和C09共5条染色体。其中,A10染色体上的关联区间峰值最高,是控制有限花序性状的主效位点。并且,A10染色体关联区间内的14.36—15.07 Mb的区域与C09染色体2个关联区间显示高度同源性。候选基因预测发现位于A08、A09、A10、C08和C09的5个关联区间包含有8个候选基因,包括TERMINAL FLOWER 1(TFL1)、FLOWERING LOCUS C(FLC)、ATBZIP14(FD)、MULTICOPY SUPPRESSOR OF IRA1 4(FVE)和SCHLAFMUTZE(SMZ)。基因序列分析表明di1突变体TFL1、FVE和SMZ的基因编码区存在序列变异,并导致蛋白序列变异。【结论】油菜有限花序突变由2对隐性基因和1对隐性上位抑制基因互作控制。与有限花序性状显着关联的区间有7个,其中,位于染色体A10和C09的关联区间具有高度同源性。TFL1、FVE和SMZ被推断为有限花序性状的候选基因。(本文来源于《中国农业科学》期刊2018年16期）
刘果,谢耀坚,张党权,陈鸿鹏,吴志华[4]（2018）在《基因组DNA混合池技术在SSR引物筛选中的可靠性分析》一文中研究指出SSR-PCR产物的重测序是SSR标记技术开发和应用的必要步骤。本研究以6个桉树DNA样品为对照组,1个基因组DNA混合池为试验组进行基因组DNA混合池在SSR引物筛选中的可靠性性分析。通过SSR-PCR产物的重测序分析,6个桉树单一DNA样品与基因组DNA混合池的扩增序列比对结果分析显示,两种模板扩增结果差异不显着,即基因组DNA混合池可以替代多个单一DNA样品进行SSR引物的高效筛选。利用20对SSR引物在6种桉树DNA样品中的扩增序列进行多态性分析发现,同一位点不同桉树种间的扩增序列存在长度多态性和核苷酸多态性,从而证实了SSR序列的多态性和复杂性,为SSR标记技术在桉树遗传育种研究中的应用提供了理论依据。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年03期）
郭刚刚,董国清,周进,达瓦顿珠,袁兴淼[5]（2013）在《大麦BAC文库叁维混合池的构建与HvGW2筛选》一文中研究指出【目的】从大麦BAC文库中快速筛选包含目的基因HvGW2的阳性BAC克隆。【方法】构建BAC文库叁维混合池,设计2对HvGW2特异性引物,进行BAC文库筛选,对含有目的基因HvGW2的阳性BAC克隆进行测序,获得编码大麦GW2蛋白的基因组DNA序列,并与禾本科中的GW2进行同源进化分析。【结果】构建了大麦BAC文库的叁维混合池160个,文库空载率为0.18%;筛选到含HvGW2的阳性BAC克隆3个,其中,BAC克隆196M02包含完整编码该基因的序列;HvGW2包含8个外显子和7个内含子,具有与其它植物GW2相似的结构特征和保守的功能结构域;同源进化分析结果显示,大麦与小麦的GW2蛋白同源性最高;序列分析发现,HvGW2第6内含子上包含2个不同类型的反转录转座子插入,从而使大麦比其它作物的GW2长度增加11.5 kb以上。【结论】通过构建叁维混合池快速筛选包含目的基因的单个阳性BAC克隆,建立了大麦目标基因克隆的辅助平台;HvGW2基因组中位于内含子区的反转录转座子插入导致基因长度增加,可能是影响该基因转录水平的关键变异。(本文来源于《中国农业科学》期刊2013年01期）
刘果,谢耀坚,张党权,谷振军[6]（2012）在《基于基因组DNA混合池的EST-SSR引物快速筛选方法研究》一文中研究指出林木SSR标记的引物筛选工作量大,十分费时且消耗大量实验材料。采用基因组DNA混合池技术,将研究对象的若干个基因组DNA样品等量混合后,作为单一模板进行SSR的PCR扩增,能显着降低实验的工作量和成本。以选择的150对EST-SSR引物为对象,对6个桉树基因组DNA样品进行等量混合,进行PCR扩增筛选引物,结果表明,与常规筛选方法相比,基因组DNA混合池方法大幅度缩短了实验周期,显着减少了基因组DNA的消耗,可用于大量林木SSR引物的快速高效筛选。(本文来源于《中南林业科技大学学报》期刊2012年09期）
陈逸飞,钟诗龙,罗建方,薛凌,黎明[7]（2012）在《DNA混合池技术全基因组关联研究筛查主动脉夹层易感基因的研究》一文中研究指出目的筛选主动脉夹层发病机制相关的遗传易感基因。方法选取主动脉夹层患者为病例组(150例),按照性别、年龄、是否吸烟、合并高血压、糖尿病情况与病例组匹配的原则入选排除主动脉夹层、重大心血管疾病及肿瘤的志愿者为对照组(250例),均从外周血提取基因组DNA,采用DNA混合池技术为基础的IlluminaHuman660W-Quad芯片扫描,筛选主动脉夹层发病相关的遗传易感基因。结果对照组女性数量明显多于病例组(P<0.01);在年龄、吸烟、高血压、糖尿病人数方面差异均无统计学意义(P>0.05)。根据芯片扫描结果 ,挑选silhouettewidth计算值大于0.7,最小等位基因频率(MAF)大于0.05,且SNPs位于已知名称基因上的前5个SNPs位点。结果发现,遗传变异位点SNPrs2970873(位于PPARGC1A基因)、SNPrs12678080(位于SGCZ基因)、SNPrs489526(位于UNC13C基因)、SNPrs6928665(位于TRAM2基因)和SNPrs17837003(位于ACCN1基因上)可能与主动脉夹层的发病机制有关。结论 SNPsrs2970873、rs12678080、rs489526、rs6928665和rs17837003可能与主动脉夹层发病机制相关。(本文来源于《热带医学杂志》期刊2012年06期）
周进[8]（2012）在《大麦BAC文库叁维混合池的构建与HvGW2基因筛选》一文中研究指出目的：本研究的目的在于利用现有的大麦BAC单克隆文库（HV_MBb）构建大麦BAC文库叁维混合池，并开发一种基于PCR筛选的BAC文库高通量筛选的方法；以便从超过147456个单克隆文库中快速筛选出含有目的基因HvGW2的阳性BAC克隆，并对HvGW2在极端性状材料中的多样性做初步分析。方法：通过数学计算，设计构建可用最少PCR次数筛选的大麦BAC叁维混合池模型，利用Q-Pix2系统分别构建了大麦BAC文库叁维混合池的板池，行池和列池。同时，设计特异性引物对获得的混合克隆池进行PCR筛选，通过叁点定位直接获得单个候选阳性BAC克隆。在此基础上分别统计BAC文库的空载率和所研究目的基因的阳性BAC克隆。最终，根据对目的基因HvGW2所在阳性BAC克隆的部分基因测序结果，结合基因组共线性分析，设计覆盖基因编码区的特异性引物，在籽粒宽度极端性状的大麦种质资源中开展初步关联分析。结果：本研究构建了一个包含160个混合克隆池的大麦BAC叁维混合池（板池48个，行池64个，列池48个）。分析获得了该文库中空载体单克隆数目和编号，计算得到混合池空载率为1.52%。从叁维池中筛选到叁个含有HvGW2基因的阳性BAC克隆，其中，196M02克隆包含完整目的基因。根据该克隆的初步测序结果，分别与禾本科中的水稻和小麦进行基因共线性分析，设计包含编码区的多组基因特异性引物。初步分析发现，其第二外显子上的序列变异与大麦籽粒宽度和千粒重性状高度相关。结论：本研究构建的大麦BAC叁维混合池空载率仅为1.52%，共160个混合池，利用特异性引物PCR技术，可以实现快速高效地进行全文库的筛选，满足功能基因发掘的需要。通过构建大麦BAC文库叁维混合池及对HvGW2基因的初步研究，为大麦其他功能基因的研究提供了重要的研究平台。(本文来源于《武汉工业学院》期刊2012-05-01）
张海龙,崔福义,伍悦滨[9]（2010）在《机械搅拌混合池叁维流场的数值模拟研究》一文中研究指出应用Fluent软件对竖轴机械搅拌混合池的叁维流场进行了数值模拟。首先通过试验数据进行湍流模型校核,然后计算和分析速度场及湍流强度场。结果表明,RNGκ-ε湍流模型能够对机械搅拌混合池流场进行正确的模拟和预测;混合池内形成了周期性的上下循环流动,桨片区域的速度及湍流强度较大,下层桨片至池底区域具有较大的流动漩涡;挡板的设置消除了流场的"打漩"现象,改善了搅拌效果。研究结果为机械搅拌混合池的设计及运行管理提供了参考依据。(本文来源于《中国给水排水》期刊2010年09期）
刘佩学,晁凯峰,王伟,谢忠超[10]（2008）在《MP20钻井液药品混合池改进》一文中研究指出介绍MP20钻井液药品混合池改进的创新点及经济效益。(本文来源于《中国设备工程》期刊2008年11期）
混合池论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本研究采用L9(23)正交试验设计确定短丝木犀的SSR-PCR最佳反应体系,同时设置12个不同的温度梯度优化引物退火温度;利用优化后的体系以50对候选SSR引物为对象,对6个短丝木犀基因组DNA样品等量混合,进行PCR扩增筛选引物。结果表明,第一,短丝木犀SSR-PCR最优反应体系为:1.0μL50ng/μL模板DNA,1.0μL 100μmol/L引物,12.5μL 2×Taq PCR Master Mix,补ddH2O至25μL;第二,DNA混合池方法比常规的筛选方法具有效率高,实验资源消耗低的优点,可用于短丝木犀SSR引物的大量筛选;第叁,最终筛选出10对具有高多态性、高稳定性且重复性好的SSR引物。本研究旨在建立适合短丝木犀的SSR-PCR最佳反应体系,并以DNA混合池为模板进行引物筛选,为短丝木犀引物的大量开发提供了一种新的途径。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
混合池论文参考文献
[1].徐建峰,容维中,石福岳,王燕燕,董和.样本数量和终质量浓度对DNA混合池PCR扩增质量和测序效果的影响[J].西北农业学报.2019
[2].钱慧蓉,陈林,杨国栋,潘婷婷,王贤荣.短丝木犀SSR-PCR反应体系优化及基于DNA混合池的引物快速筛选[J].分子植物育种.2019
[3].张尧锋,张冬青,余华胜,林宝刚,华水金.基于极端混合池(BSA)全基因组重测序的甘蓝型油菜有限花序基因定位[J].中国农业科学.2018
[4].刘果,谢耀坚,张党权,陈鸿鹏,吴志华.基因组DNA混合池技术在SSR引物筛选中的可靠性分析[J].分子植物育种.2018
[5].郭刚刚,董国清,周进,达瓦顿珠,袁兴淼.大麦BAC文库叁维混合池的构建与HvGW2筛选[J].中国农业科学.2013
[6].刘果,谢耀坚,张党权,谷振军.基于基因组DNA混合池的EST-SSR引物快速筛选方法研究[J].中南林业科技大学学报.2012
[7].陈逸飞,钟诗龙,罗建方,薛凌,黎明.DNA混合池技术全基因组关联研究筛查主动脉夹层易感基因的研究[J].热带医学杂志.2012
[8].周进.大麦BAC文库叁维混合池的构建与HvGW2基因筛选[D].武汉工业学院.2012
[9].张海龙,崔福义,伍悦滨.机械搅拌混合池叁维流场的数值模拟研究[J].中国给水排水.2010
[10].刘佩学,晁凯峰,王伟,谢忠超.MP20钻井液药品混合池改进[J].中国设备工程.2008
论文知识图
