用于海洋沉积物中厌氧氨氧化细菌分子生态学研究的引物比较

论文摘要

为比较厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因的2对特异性引物(Amx368F/Amx820R、Brod541F/Amx820R)在其分子生态学研究方面的优点与不足,本研究采用高通量测序和qPCR技术对长江口及其邻近海域沉积物中厌氧氨氧化细菌细菌的群落组成、多样性和丰度进行比较分析,结果表明,引物Amx368F/Amx820R特异性较高,能够较为完整地反映沉积物中厌氧氨氧化细菌的多样性信息,且其覆盖的厌氧氨氧化细菌丰度与功能基因hzo丰度正相关(P<0.01);而引物Brod541F/Amx820R特异性较低,覆盖部分厌氧氨氧化细菌及其他多个门的细菌,其量化的厌氧氨氧化细菌与功能基因hzo丰度无明显相关关系(P>0.05)。因此,引物Amx368F/Amx820R能够更加真实地反映厌氧氨氧化细菌在海洋沉积物中的群落特征,在其分子生态学研究中更具优势。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 付璐璐,李思琦,甄毓,米铁柱

关键词: 厌氧氨氧化细菌,基因,群落结构,丰度

来源: 中国海洋大学学报(自然科学版) 2019年09期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 海洋学,地质学

单位: 中国海洋大学海洋生命学院,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室,海洋环境与生态教育部重点实验室,中国海洋大学环境科学与工程学院

基金: 国家自然科学基金项目(41620104001),鳌山科技创新计划项目(2016ASKJ02),中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学开放课题项目(KLMEES201601)资助~~

分类号: P736.21

DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20180094

页码: 77-88

总页数: 12

文件大小: 5442K

下载量: 205

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标签：厌氧氨氧化细菌论文;  基因论文;  群落结构论文;  丰度论文;