论文摘要
本研究基于二代测序平台应用比较基因组学对35株来源于酸马奶、酸粥、酸面团、食草动物中罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)基因组进行比较分析,研究其基因多样性及生境适应性机制,为L.reuteri优良菌株的开发提供理论基础。结果表明分离自酸马奶、酸粥L.reuteri基因组大小、GC含量均比食草动物、面团分离株略有偏高,且同种来源分离株系统发育关系相距较近。泛基因集和核心基因集分别包含8599个、954个基因家族。功能注释发现与碳水化合物、氨基酸、B族维生素相关基因数量及种类差异较大,注释到的碳水化合物活性酶GH25、GH68、GT4、GT8、CBM50、AA6数量差异明显。本研究发现不同来源L.reuteri具有广泛的基因多样性,与生存环境密切相关。酸马奶、酸粥、食草动物分离株具有较多的特异基因并能体现其生存方式及与宿主有关的环境适应能力,可加深对发酵食品和肠内环境中细菌生境适应性的理解。
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文章来源
类型: 国际会议
作者: 安晓娜,赵洁,李伟程,莫蓝馨,姚彩青,于洁,孙志宏,张和平
关键词: 罗伊氏乳杆菌,比较基因组学,发酵食品,生境适应性
来源: 第十四届益生菌与健康国际研讨会 2019-05-22
年度: 2019
分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑
专业: 生物学,轻工业手工业
单位: 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业部奶制品加工重点实验室
分类号: TS201.3
页码: 72
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