米氏凯伦藻(Km02)共培养细菌群落的研究

米氏凯伦藻(Km02)共培养细菌群落的研究

论文摘要

米氏凯伦藻作为我国沿岸典型的有毒赤潮甲藻,近年来赤潮频度越来越密,赤潮规模越来越大,持续时间也越来越长,造成了严重的经济损失,并且威胁到海洋生态系统的健康。众多研究表明藻际细菌可能是影响赤潮生消与有毒藻产毒的关键生物影响因子。为揭示米氏凯伦藻共培养菌群的物种多样性信息,本文通过高通量测序技术手段,分析了我国沿岸产米氏凯伦藻(Km02)共培养菌群的种类、丰度、多样性及系统发育信息。结果显示,米氏凯伦藻(Km02)共培养菌群共有40个种与已有数据库匹配,隶属于4个门(Phylum),11个纲(Class),21个目(Order),26个科(Family),37个属(Genus)。其中优势菌属有8个(>5%),分别为Balneola(20.28%)、 Marinobacter(19.25%)、Rhodobacteraceae科下的未知属(13.15%)、Alteromonas (8.88%)、Methylophaga (8.17%)、Thalassospira(6.24%)、Reichenbachiella (5.92%)及Mesoflavibacter (5.41%)。研究结果表明我国沿岸产米氏凯伦藻(Km02)含有生物多样性较高的共培养菌群,且具有探寻未知海洋细菌的潜力,同时该研究结果也为未来更进一步研究细菌群落对米氏凯伦藻赤潮暴发与消亡,以及产毒特性等机制的研究提供了实验方法与奠定了理论基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验藻种与培养方法
  •   1.2 样品总DNA的提取
  •   1.3 PCR扩增与高通量测序
  •   1.4 生物信息分析
  •   1.5 系统发生进化树
  • 2 结果与分析
  •   2.1 测序数据序列信息统计
  •   2.2 样品多样性指数
  •   2.3 操作分类单元 (OTU) 分布与统计
  •   2.4 分类学分析
  •   2.5 系统发生进化树分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王鹏斌,戴鑫烽,陆斗定

    关键词: 赤潮藻,米氏凯伦藻,共培养菌群

    来源: 海洋与湖沼 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 海洋学,环境科学与资源利用

    单位: 自然资源部第二海洋研究所海洋生态系统与生物地球化学重点实验室

    基金: 国家重点研发计划资助,2017YFC1404300号,国家自然科学基金青年项目,41706191号,国家自然科学基金项目,41676111号,国家海洋局第二海洋研究所所长专项团队项目,JT1803号,海洋赤潮灾害立体监测技术与应用国家海洋局重点实验室开放研究基金课题,MATHAB201704号,卫星海洋环境动力学国家重点实验室自主项目,SOEDZZ1702号

    分类号: X55

    页码: 644-651

    总页数: 8

    文件大小: 1621K

    下载量: 92

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