2种糖基转移酶在植物乳杆菌YM 4-3菌株胞外多糖生物合成中的分子调控机理研究

2种糖基转移酶在植物乳杆菌YM 4-3菌株胞外多糖生物合成中的分子调控机理研究

论文摘要

乳酸菌胞外多糖(exopolysaccharide,EPS)是乳酸菌在生长代谢过程中产生的一种高分子聚合物,由于菌株基因多样性以及EPS结构的多样性使得EPS生理活性也具有多样性,在各个领域都具有很大的潜在利用价值。本研究着眼于植物乳杆菌YM 4-3菌株胞外多糖合成中参与寡糖重复单元的合成过程的两种糖基转移酶(orf1595及cps4I),通过对这两个基因进行敲除和回补,并结合基因敲除后菌株的转录组数据共同分析,进而对这两种糖基转移酶基因的功能进行初步确定。此外通过对糖基转移酶基因敲除后的菌株的生长特性及其抗菌活性进行检测,从而评估这两种糖基转移酶对菌株生理特性的影响。对基因敲除株以及野生型菌株的胞外多糖进行提取并作含量、化学成分以及体外抗菌活性和抗氧化活性进行分析从而评估这两种糖基转移酶对胞外多糖生理活性的影响,结合单糖组分测定结果从而明确两种糖基转移酶基因的功能,进而为胞外多糖生物合成调控做一定的理论基础。具体研究内容及结果如下:(1)基于温敏载体针对orf1595与cps4I基因目的敲除片段成功构建获得基因敲除载体pFED76-Δorf1595及pFED76-Δcps4I。并将其转化入宿主菌株并经同源重组获得基因敲除菌株植物乳杆菌YM 4-3-Δorf1595及YM 4-3-Δcps4I。基于同样的原理,成功获得基因回补菌株植物乳杆菌YM 4-3-orf1595及YM 4-3-cps4I。(2)基于上述试验所构建的基因敲除菌株及基因回补菌株对其胞外多糖进行提取并测定其含量,结果显示YM 4-3-Δorf1595菌株胞外多糖含量为53.7±2.76mg/L,YM 4-3-Δcps4I菌株胞外多糖含量为23.8±0.364 mg/L,而YM 4-3野生型菌株其产量为74.75±0.254 mg/L,基因敲除后胞外多糖产量下降。基因回补菌株YM 4-3-orf1595胞外多糖产量为80.85±1.344 mg/mL(p<0.05),YM 4-3-cps4I胞外多糖产量为70.4±0.973 mg/mL(p>0.05),胞外多糖产量得以恢复。(3)通过转录组测序情况分析基因敲除菌株的表达差异情况。糖基转移酶基因敲除后会使得胞外多糖合成基因簇中部分基因表达差异变化,还会导致菌株糖代谢途径中的基因出现表达差异。(4)对敲除菌株所产胞外多糖的体外DPPH清除、羟基自由基清除及超氧阴离子自由基清除进行检测评估基因敲除对其胞外多糖抗氧化活性的影响。结果发现糖基转移酶基因敲除后胞外多糖的DPPH及超氧阴离子自由基清除能力显著降低,但其羟基自由基的清除明显升高,当胞外多糖浓度达400μg/mL具有60%以上的清除活性。(5)对敲除菌株及野生型菌株所产胞外多糖的蛋白质含量、糖醛酸含量以及硫酸盐含量进行检测,结果发现基因敲除后会引起胞外多糖化学成分的变化。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  •   1.1 引言
  •   1.2 植物乳杆菌研究进展
  •   1.3 乳酸菌胞外多糖的研究现状与进展
  •     1.3.1 乳酸菌胞外多糖结构
  •     1.3.2 乳酸菌胞外多糖生理活性
  •     1.3.3 乳酸菌EPS的生物合成
  •     1.3.4 参与乳酸菌胞外多糖合成的相关基因
  •   1.4 糖基转移酶
  •   1.5 本课题研究的目的和意义
  • 第二章 L.plantarum YM4-3 糖基转移酶基因的敲除
  •   2.1 引言
  •   2.2 实验材料
  •     2.2.1 实验菌株
  •     2.2.2 实验质粒及引物
  •     2.2.3 实验仪器
  •     2.2.4 培养基及所需试剂配制
  •   2.3 实验方法
  •     2.3.1 植物乳杆菌YM4-3 菌株糖基转移酶基因的克隆与测序
  •     2.3.2 qPCR检测YM4-3 菌株两种糖基转移酶基因表达水平差异
  •     2.3.3 温度敏感型质粒基因敲除原理
  •     2.3.4 敲除载体的构建
  •     2.3.5 植物乳杆菌YM4-3 单基因敲除菌株的构建
  •     2.3.6 植物乳杆菌YM4-3 双敲菌株的构建
  •     2.3.7 敲除菌株胞外多糖含量测定
  •     2.3.8 敲除菌株的生长情况测定
  •     2.3.9 基因敲除菌株的回补
  •   2.4 实验结果
  •     2.4.1 糖基转移酶基因的TA克隆测序
  •     2.4.2 糖基转移酶基因的表达差异分析
  •     2.4.3 糖基转移酶的基因敲除
  •     2.4.4 敲除菌株的胞外多糖含量
  •     2.4.5 基因敲除菌株生长情况
  •     2.4.6 基因敲除菌株的基因回补
  •   2.5 讨论
  •   本章小结
  • 第三章 基因敲除菌株转录组学研究
  •   3.1 引言
  •   3.2 材料与方法
  •     3.2.1 实验引物表
  •     3.2.2 实验所用菌株
  •     3.2.3 实验样品处理
  •     3.2.4 转录组文库的构建及测序
  •     3.2.5 生物信息学分析
  •     3.2.6 转录组数据的qPCR验证
  •   3.3 实验结果
  •     3.3.1 基因表达差异分析
  •     3.3.2 GO显著性富集分析
  •     3.3.3 KEGG富集分析
  •     3.3.4 qPCR分析验证转录组分析结果
  •   3.4 讨论
  •   本章小结
  • 第四章 胞外多糖体外抗氧化检测及其结构特性
  •   4.1 引言
  •   4.2 实验设备及耗材
  •     4.2.1 实验菌株
  •     4.2.2 相关材料及仪器
  •     4.2.3 实验试剂
  •     4.2.4 培养基及试剂配制
  •   4.3 实验方法
  •     4.3.1 菌株及胞外多糖抑菌活性测定
  •     4.3.2 植物乳杆菌YM4-3 菌株胞外多糖抗氧化活性测定
  •     4.3.4 胞外多糖的化学成分测定
  •   4.4 实验结果
  •     4.4.1 菌株及胞外多糖的抑菌活性
  •     4.4.2 胞外多糖抗氧化活性检测
  •     4.4.3 胞外多糖化学成分检测
  •   4.5 讨论
  •   本章小结
  • 第五章 总结与展望
  •   5.1 本文小结
  •   5.2 展望
  • 致谢
  • 参考文献
  • 附录1
  • 附录2
  • 附录3
  • 附录4
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 赵波

    导师: 杨恩

    关键词: 植物乳杆菌,胞外多糖,糖基转移酶,基因敲除

    来源: 昆明理工大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 昆明理工大学

    分类号: Q78;Q93

    DOI: 10.27200/d.cnki.gkmlu.2019.000160

    总页数: 111

    文件大小: 5098K

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