论文摘要
文中提出了一种简单有效的蛋白质亚细胞区间定位预测方法,为进一步了解蛋白质的功能和性质提供理论基础。运用稀疏编码,结合氨基酸组成信息提取蛋白质序列特征,基于不同字典大小对得到的特征进行多层次池化整合,并送入支持向量机进行分类。经Jackknife检验,在数据集ZD98、CH317和Gram1253上的预测成功率分别达到95.9%、93.4%和94.7%。实验证明基于多层次稀疏编码的分类预测算法能显著提高蛋白质亚细胞区间定位的预测精度。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 陈行健,胡雪娇,薛卫
关键词: 稀疏编码,氨基酸组成,多层次池化,支持向量机,亚细胞区间定位
来源: 生物工程学报 2019年04期
年度: 2019
分类: 基础科学,信息科技
专业: 生物学,自动化技术
单位: 南京农业大学信息科学技术学院
基金: 国家重点研发计划(No.2017YFD0800204),中央高校基本科研业务费专项资金(No.KYZ201600175)资助~~
分类号: TP181;Q51
DOI: 10.13345/j.cjb.180403
页码: 687-696
总页数: 10
文件大小: 875K
下载量: 158
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