‘无子瓯柑’CHS基因家族的克隆和表达分析

‘无子瓯柑’CHS基因家族的克隆和表达分析

论文摘要

为研究查尔酮合成酶基因(CHS)家族在‘无子瓯柑’ Citrus suavissima ‘Seedless’雄性不育发生过程中的作用,以克里曼丁橘Citrus clementina基因组数据库为参照,在‘无子瓯柑’和瓯柑Citrus suavissima的转录组和蛋白质组测序结果中筛选出4个CHS同源差异表达基因,并对其克隆和表达量分析,对克里曼丁橘CHS基因家族成员进行生物信息学分析。结果表明:‘无子瓯柑’和瓯柑CHS基因编码区核苷酸序列相似度达98%以上。小孢子母细胞发育各时期CHS基因表达量在瓯柑和‘无子瓯柑’间差异显著。与瓯柑相比,‘无子瓯柑’小孢子母细胞时期Ciclev10005133m, Ciclev10030093m和Ciclev10015535m的表达量显著下调;减数分裂时期Ciclev10005133m,Ciclev10001405m和Ciclev10015535m的表达量显著下调;四分体时期Ciclev10001405m和Ciclev10030093m的表达量显著减少。在花粉粒成熟时期的花蕾中,Ciclev10001405m与Ciclev10005133m在花药中特异性表达。CHS同源基因在花药不同时期中的差异表达可能是‘无子瓯柑’花药发育异常的重要原因,并最终导致‘无子瓯柑’雄性不育。图3表6参15

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •     1.1.1 数据源
  •     1.1.2 材料
  •   1.2 基因克隆和基因表达量分析
  •   1.3 CHS基因家族生物信息学分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 CHS基因家族成员的鉴定和克隆
  •   2.2 CHS基因家族成员的表达分析
  •   2.3 CHS基因家族的生物信息学分析
  •     2.3.1 CHS基因家族成员鉴定
  •     2.3.2 CHS家族同源蛋白系统进化树构建
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 俞狄虎,张迟,柯甫志,敬露阳,顾雪娇,吴宝玉,张敏

    关键词: 园艺学,查尔酮合成酶,雄性不育,无子瓯柑,基因家族

    来源: 浙江农林大学学报 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,园艺

    单位: 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,浙江农林大学浙江省农产品品质改良技术研究重点实验室,浙江省柑橘研究所,浙江省丽水市莲都区农业技术推广中心

    基金: 浙江省基础公益研究计划项目(LGN18C160005,LGN19C160005),国家自然科学基金资助项目(31000897),国家现代农业产业技术体系专项基金资助项目(CARS-27)

    分类号: S666.1;Q943.2

    页码: 943-949

    总页数: 7

    文件大小: 652K

    下载量: 120

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