高通量测序解析微生物肥料对红壤有机农田土壤微生物群落的影响

高通量测序解析微生物肥料对红壤有机农田土壤微生物群落的影响

论文摘要

高通量测序技术可用于精确分析土壤微生物群落,从微生物群落结构和多样性的角度阐释微生物肥料对有机农田根区土壤微生物群落的影响。在红壤有机农田轮作种植条件下,施用微生物肥料后利用Illumina MiSeq高通量测序技术结合相关生物信息学分析土壤细菌和真菌的多样性指数及群落结构。结果表明,从6个有机农田根区土壤样本中获得7 729个细菌分类操作单元(operational taxonomic units,简称OTU)和3 271个真菌OTU,细菌和真菌文库测序覆盖率均在99%以上。微生物肥料会显著降低土壤细菌和真菌种群多样性,且可在一定程度上降低细菌群落丰富度,显著降低真菌群落丰富度;并减少根区土壤特有细菌和真菌物种数量。放线菌门、变形菌门和酸杆菌门是优势细菌,子囊菌门是优势真菌;微生物肥料会提高放线菌门、变形菌门、厚壁菌门和担子菌门的相对丰度,分别比对照组提高29. 46%、9. 17%、129. 33%、165. 73%;但会降低酸杆菌门、绿弯菌门、子囊菌门、接合菌门的相对丰度,分别比对照组降低30. 14%、33. 50%、17. 27%、86. 33%。因此,施用微生物肥料可改变红壤有机农田根区土壤细菌和真菌的丰富度和多样性,有助于控制作物病害发生。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验地概况
  •   1.2 试验设计
  •   1.3 土壤样品采集
  •   1.4 土壤湿化性质测定
  •   1.5 土壤微生物总DNA提取和高通量测序
  •   1.6 数据处理与分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 土壤微生物文库测序结果评价
  •   2.2 微生物肥料对根区土壤微生物群落丰富度和多样性的影响
  •   2.3 施用微生物肥料后根区土壤微生物类群分析
  •   2.4 微生物肥料对根区土壤微生物群落分布特征的影响
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王超,陈刘军,田伟,黄思杰,王磊,席运官

    关键词: 微生物肥料,根区土壤,高通量测序,微生物群落,种群多样性,相对丰度

    来源: 江苏农业科学 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学

    单位: 环境保护部南京环境科学研究所

    基金: 云南省环保公益专项(编号:45014),中央级公益性科研院所基本科研业务专项(编号:GYZX170307)

    分类号: S154.3;S144

    DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.02.066

    页码: 272-277

    总页数: 6

    文件大小: 284K

    下载量: 848

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