植物罹病组织中南方、爪哇、花生根结线虫的LAMP快速检测

植物罹病组织中南方、爪哇、花生根结线虫的LAMP快速检测

论文摘要

【目的】建立一种基于环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术,从植物罹病组织中直接检测3种常见的根结线虫,为根结线虫的监测和防治提供技术支持。【方法】分别采用3种根结线虫的种类特异性引物对所选择的根结线虫的DNA片段进行PCR扩增,扩增产物纯化、回收并测序。根据3种根结线虫的测序结果,针对种类特异区段,采用PrimerExplorerV4软件,分别设计3种根结线虫的LAMP引物。设计的引物组人工合成后,以提取的纯化种群线虫DNA为模板,分别进行引物组的特异性测试,筛选出分别针对3种根结线虫的最佳引物组。【结果】研究设计的3种根结线虫的LAMP特异性引物能够直接从植物根结中检测出南方、花生、爪哇3种常见根结线虫,LAMP快速检测体系为:dNTPS浓度为1 mmol·L-1,Mg2+的浓度为5 mmol·L-1,不添加甜菜碱,反应时间为45 min。【结论】本实验建立的南方、花生、爪哇根结线虫LAMP快速分子检测方法,具有特异性强、灵敏度高、简单、快速、经济等特征,能够从罹病植物组织中快速准确地检测出南方、花生和爪哇根结线虫,具有极高的实践应用价值。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 供试线虫
  •   1.2 试剂
  •   1.3 线虫DNA提取
  •   1.4 3种根结线虫种类特异性区段扩增
  •   1.5 LAMP引物设计
  •   1.6 LAMP反应体系的建立
  •   1.7 LAMP扩增产物的检测
  •   1.8 罹病根组织的LAMP直接检测
  • 2 结果与分析
  •   2.1 3种根结线虫的特异性引物PCR及测序结果
  •   2.2 3种根结线虫的LAMP引物设计
  •   2.3 3种根结线虫LAMP检测体系建立
  •   2.4 罹病番茄根组织中3种根结线虫的LAMP直接检测
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 吴文涛,李梅云,许姗姗,薛美静,张靖,魏环宇,王扬

    关键词: 环介导等温扩增,根结线虫,特异性,快速检测

    来源: 生物安全学报 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

    单位: 云南农业大学植物保护学院,云南省烟草农业科学研究院

    基金: 口岸及边贸区,自贸区入侵生物本底调查与动态分布(2016YFC1202104),国家自然科学基金(31560502,311060361)

    分类号: S432.45

    页码: 59-64

    总页数: 6

    文件大小: 922K

    下载量: 132

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