4种鸫科（Turdidae）鸟类的遗传分化研究

论文摘要

本研究利用ND2和C01基因以及13个微卫星位点研究红尾鸫（Turdus naumanni）、斑鸫（Turdus eunomus）、赤颈鸫（Turdus ruficollis）及黑领鸫（Turdus atrogularis）4种鸫科鸟类种群的遗传多样性、遗传结构和遗传分化,并进一步探讨渐渗对该4种鸟类种群的影响。同时结合形态学特征,对该4种鸟类的分类地位进行重新的界定。主要研究结果如下:1.基于ND2和C01基因构建系统发育树（BI和ML）结果表明,斑鸫与红尾鸫聚为一支,赤颈鸫与黑颈鸫聚为一支,两支为单系群,四者与环颈鸫亲缘关系最近。基于微卫星构建的系统发育树表明斑鸫与红尾鸫亲缘关系最近,与黑颈鸫亲缘关系最远。利用BP&P分析显示,红尾鸫类群与赤颈鸫类群的物种形成率在各个参数下均为1,而红尾鸫与斑鸫之间、赤颈鸫与黑颈鸫之间的物种形成率在半数参数条件下小于0.99。利用5个可量性形态学指标构建的主成分分析散点图结果与系统发育分析的结果一致。综上所述,建议将斑鸫定义为红尾鸫（Tudus naumanni naumanni）的北方亚种（Tudus nauuanni eunomus）,黑颈鸫定义为赤颈鸫(Turdus ruficollis ruficollis 的黑喉亚种（Turdus ruficollis atrogularis）。2.利用分子方差分析（AMOVA）检验4种鸫科鸟类的遗传分化水平并计算物种间的基因流。联合ND2和CO1基因结果显示,斑鸫与红尾鸫之间有高水平的基因流（4.678）,赤颈鸫与黑颈鸫之间同样具有高水平的基因流（Inf）,而斑鸫-红尾鸫与赤颈鸫-黑颈鸫种群间的基因流处于低水平（0.0063-0.0086）,有明显的遗传分化。基于微卫星DNA对该4种鸫科鸟类进行的基因流检测显示:各种群间有高水平的基因流（3.12-Inf）,亚种间基因流高于种间基因流（20.86-inf>3.12-7.79）。对4种鸫科鸟类的基因流分析表明,亚种间在线粒体和微卫星水平上皆有渐渗现象,种间在微卫星水平显示渐渗现象,由于物种间不完全生殖隔离和大面积的分布重叠区导致渐渗的发生。3.遗传多样性指数表明,在不含复合体时黑颈鸫种群的核苷酸多样性最高,为0.00645土0.00203;红尾鸫种群最低,为0.00311±0.00034。包含复合体时,黑颈鸫种群的核苷酸多样性最高,为0.00948±0.00181;红尾鸫种群最低,为0.00435±0.00061。表明渐渗提高了该4种鸫科鸟类的遗传多样性水平。

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文章来源

类型: 硕士论文

作者: 安博洋

导师: 李波

关键词: 红尾鸫,赤颈鸫,分类地位,渐渗,遗传分化,遗传多样性

来源: 东北林业大学

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学,生物学

单位: 东北林业大学

分类号: Q953

DOI: 10.27009/d.cnki.gdblu.2019.000664

总页数: 69

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