导读:本文包含了肽序列标签论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:肽序列标签,翻译后修饰,质谱,盲搜索
肽序列标签论文文献综述
李文军,徐云,邵明芝[1]（2012）在《基于肽序列标签的蛋白质翻译后修饰中的过滤算法》一文中研究指出大量的质谱数据无法被鉴定或是鉴定的精度不够高,特别是在肽段数据库较大时,普通的算法精度下降很快。提出一种新的盲搜索算法,此算法基于一种全新的基于相似关系度量的打分模型。为了处理大规模问题,同时还应用了基于母离子质量和肽序列标签的前过滤方法,使得此算法在较大规模的数据库上精度得到很好的保证。实验结果表明,对于规模为10000,20000,50000的肽段数据库,其鉴定准确率分别为78.3%,74.2%,65.5%。随着数据库规模的增大,算法的鉴定准确率保持得较好。(本文来源于《计算机应用》期刊2012年05期）
王中胜[2]（2007）在《基于支持向量机分类的b/y离子峰选取算法及肽序列标签生成算法的研究》一文中研究指出蛋白质组学研究是细胞生物学领域里日趋成熟和应用日益广泛的一门技术，它可以规模化地鉴定出蛋白质混合物甚至大的组织器官样品中蛋白质的组成成分，并分析蛋白质翻译后修饰。生物质谱技术是蛋白质组学的关键技术，而其中最关键的部分是肽序列测序。已有的肽序列测序算法包括数据库搜索算法、从头测序算法，以及肽序标签搜库算法。这些算法的首要步骤是质谱峰的过滤，它与整个算法的复杂性有关。以往对高精度质谱数据的峰选取工作取得了较好的效果，而对低精度质谱数据的峰选取工作却没有合适的方法。本研究针对低精度质谱数据，提出了基于支持向量机分类的b／y离子峰选取算法，通过仅选取质谱图谱中的b／y离子峰，简化质谱图的构建和减少了肽序列标签生成步骤的计算量，提高了结果的可靠性。本研究主要基于以下假设：1．所有参与质谱图构建的质谱峰均为b／y离子峰；2.b／y离子峰与噪声的本质区别在于有无同位素峰以及是否发生中性丢失(主要考虑的中性丢失包括：-H_2O，-NH_3，-H_2O-H_2O，-H_2O-NH_3)，而不是峰强度的高低；3.b／y离子峰与其他碎片离子的区别在于有无互补离子。为了验证所建立的基于支持向量机分类的b／y离子峰选取算法的可靠性，本研究对一批标准蛋白质数据(1281个谱)进行了训练和测试，并与以往广泛使用的峰过滤算法作了比较。结果表明，b／y离子峰选取算法能够取得很好的质谱峰过滤效果，比以往普遍使用的质谱峰选取算法有了提高，为质谱图的构建和肽序列标签生成算法提供了可靠的基础。在肽序列标签生成算法的研究中，我们提出了一种基于b／y离子峰选取的算法。对这一方法的测试及与常用肽序列标签生成算法的比较表明，我们算法的可靠性与当前这一领域里效果最好的软件PepNovoTag的可靠性相当，比GutenTag的可靠性要高。(本文来源于《中国人民解放军军事医学科学院》期刊2007-05-15）
肽序列标签论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
蛋白质组学研究是细胞生物学领域里日趋成熟和应用日益广泛的一门技术，它可以规模化地鉴定出蛋白质混合物甚至大的组织器官样品中蛋白质的组成成分，并分析蛋白质翻译后修饰。生物质谱技术是蛋白质组学的关键技术，而其中最关键的部分是肽序列测序。已有的肽序列测序算法包括数据库搜索算法、从头测序算法，以及肽序标签搜库算法。这些算法的首要步骤是质谱峰的过滤，它与整个算法的复杂性有关。以往对高精度质谱数据的峰选取工作取得了较好的效果，而对低精度质谱数据的峰选取工作却没有合适的方法。本研究针对低精度质谱数据，提出了基于支持向量机分类的b／y离子峰选取算法，通过仅选取质谱图谱中的b／y离子峰，简化质谱图的构建和减少了肽序列标签生成步骤的计算量，提高了结果的可靠性。本研究主要基于以下假设：1．所有参与质谱图构建的质谱峰均为b／y离子峰；2.b／y离子峰与噪声的本质区别在于有无同位素峰以及是否发生中性丢失(主要考虑的中性丢失包括：-H_2O，-NH_3，-H_2O-H_2O，-H_2O-NH_3)，而不是峰强度的高低；3.b／y离子峰与其他碎片离子的区别在于有无互补离子。为了验证所建立的基于支持向量机分类的b／y离子峰选取算法的可靠性，本研究对一批标准蛋白质数据(1281个谱)进行了训练和测试，并与以往广泛使用的峰过滤算法作了比较。结果表明，b／y离子峰选取算法能够取得很好的质谱峰过滤效果，比以往普遍使用的质谱峰选取算法有了提高，为质谱图的构建和肽序列标签生成算法提供了可靠的基础。在肽序列标签生成算法的研究中，我们提出了一种基于b／y离子峰选取的算法。对这一方法的测试及与常用肽序列标签生成算法的比较表明，我们算法的可靠性与当前这一领域里效果最好的软件PepNovoTag的可靠性相当，比GutenTag的可靠性要高。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
肽序列标签论文参考文献
[1].李文军,徐云,邵明芝.基于肽序列标签的蛋白质翻译后修饰中的过滤算法[J].计算机应用.2012
[2].王中胜.基于支持向量机分类的b/y离子峰选取算法及肽序列标签生成算法的研究[D].中国人民解放军军事医学科学院.2007